More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0282 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 328 aa  674    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  99.39 
 
 		 328 aa  669    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  68.1 
 
 		 354 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  71.95 
 
 		 329 aa  480  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  65.95 
 
 		 328 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  63.19 
 
 		 327 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  63.19 
 
 		 328 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  61.59 
 
 		 331 aa  435  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  62.77 
 
 		 328 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  63.61 
 
 		 330 aa  429  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  61.89 
 
 		 330 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  61.89 
 
 		 330 aa  425  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 		 330 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 		 330 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  61.47 
 
 		 330 aa  424  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  61.28 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  63.75 
 
 		 328 aa  422  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 		 330 aa  419  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  59.57 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  61.82 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  59.09 
 
 		 331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  59.56 
 
 		 328 aa  388  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  56.17 
 
 		 329 aa  388  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  56.88 
 
 		 328 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  56.1 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  55.49 
 
 		 330 aa  375  1e-103  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  56.48 
 
 		 324 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  55.11 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  54.71 
 
 		 328 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  55.59 
 
 		 332 aa  364  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  55.76 
 
 		 333 aa  362  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  53.89 
 
 		 323 aa  358  6e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  54.83 
 
 		 332 aa  358  8e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  54.41 
 
 		 326 aa  357  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  54.13 
 
 		 326 aa  358  9.999999999999999e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  56.48 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  52.42 
 
 		 327 aa  353  2e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  53.42 
 
 		 332 aa  352  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  51.82 
 
 		 328 aa  352  5e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  53.46 
 
 		 331 aa  351  1e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  52.73 
 
 		 329 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  54.41 
 
 		 331 aa  347  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  51.24 
 
 		 337 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  51.24 
 
 		 337 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  53.27 
 
 		 332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  53.27 
 
 		 332 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  50.78 
 
 		 329 aa  341  8e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  52.65 
 
 		 321 aa  341  1e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  54.55 
 
 		 332 aa  340  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  51.25 
 
 		 327 aa  340  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 		 320 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  53.25 
 
 		 318 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  51.69 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  54.09 
 
 		 320 aa  336  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  51.69 
 
 		 330 aa  335  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  53.14 
 
 		 324 aa  335  5e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  50.62 
 
 		 332 aa  334  1e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  48.01 
 
 		 351 aa  332  5e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  50.61 
 
 		 329 aa  332  7.000000000000001e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 330 aa  330  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  52.37 
 
 		 316 aa  329  4e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  48.92 
 
 		 333 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  53.14 
 
 		 319 aa  328  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  52.31 
 
 		 321 aa  325  7e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  51.24 
 
 		 324 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  50.46 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  50.58 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 		 326 aa  318  7.999999999999999e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  48.29 
 
 		 337 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  51.42 
 
 		 324 aa  316  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  51.7 
 
 		 321 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  51.39 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  50.93 
 
 		 321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  48.45 
 
 		 324 aa  313  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  49.06 
 
 		 330 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  46.01 
 
 		 327 aa  311  7.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  49.11 
 
 		 348 aa  310  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 327 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  49.08 
 
 		 323 aa  309  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  47.17 
 
 		 328 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  47.65 
 
 		 327 aa  308  9e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  47.32 
 
 		 327 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  47.17 
 
 		 328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  48.44 
 
 		 337 aa  306  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  47.04 
 
 		 330 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 327 aa  304  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  48.61 
 
 		 328 aa  302  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  47.42 
 
 		 328 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  48.43 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  45.35 
 
 		 334 aa  298  6e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>