105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0265 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 
427 aa  867    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  100 
 
 
427 aa  867    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.88 
 
 
411 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  44.69 
 
 
411 aa  334  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.51 
 
 
477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  42.97 
 
 
477 aa  298  2e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  33.06 
 
 
942 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  25.99 
 
 
729 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  29.29 
 
 
443 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 
728 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 
728 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 
416 aa  120  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  26.48 
 
 
389 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  25.31 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  25.31 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 
392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  25.31 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  30.23 
 
 
443 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
382 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  27.07 
 
 
374 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  30.18 
 
 
388 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  25.31 
 
 
1119 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.33 
 
 
378 aa  106  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 
388 aa  106  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  25.97 
 
 
375 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  25.81 
 
 
434 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  27.61 
 
 
385 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  23.73 
 
 
405 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
403 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  24.74 
 
 
397 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
397 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  24.09 
 
 
422 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  24.31 
 
 
319 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  24.15 
 
 
783 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 
395 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 
390 aa  96.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  29.22 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  26.99 
 
 
391 aa  95.5  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
903 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  23.53 
 
 
814 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
705 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 
394 aa  93.6  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  25.77 
 
 
420 aa  92.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  29.59 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  23.9 
 
 
385 aa  90.5  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
398 aa  90.1  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
404 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 
382 aa  88.2  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  26.54 
 
 
783 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  36 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  29.88 
 
 
394 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
726 aa  84.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  25.77 
 
 
385 aa  84  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  28.35 
 
 
1293 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  34.56 
 
 
394 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  26.15 
 
 
417 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  34.44 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  34.45 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  24.24 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  22.88 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  27.45 
 
 
751 aa  66.2  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 
395 aa  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
378 aa  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 
373 aa  59.7  0.00000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  25.38 
 
 
741 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  25 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  24.83 
 
 
754 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  22.03 
 
 
370 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  23.81 
 
 
723 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
415 aa  54.3  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  22.86 
 
 
416 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
393 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  22.22 
 
 
378 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  20.89 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25.14 
 
 
404 aa  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0324  glycosyl transferase, group 1  25.3 
 
 
400 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.546563  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 
406 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0152  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.48 
 
 
403 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  23.33 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  18.49 
 
 
378 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2473  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
403 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
412 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  22.64 
 
 
475 aa  46.6  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0654  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
392 aa  46.6  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871092  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  23.84 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1571  hypothetical protein  22.14 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.443604 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  22.45 
 
 
405 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
412 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  22 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3354  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
409 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
396 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  24.72 
 
 
385 aa  44.3  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0036  glycosyl transferase group 1  30.93 
 
 
381 aa  44.3  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2840  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
403 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>