49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0205 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0203  heme oxygenase 2  100 
 
 
214 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.417948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0205  heme oxygenase  100 
 
 
214 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3635  Heme oxygenase  34.65 
 
 
240 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1858  Heme oxygenase (decyclizing)  33.66 
 
 
238 aa  131  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206398  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2962  Heme oxygenase  33 
 
 
239 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243829  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4780  Heme oxygenase  32.31 
 
 
251 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3827  Heme oxygenase  29.06 
 
 
237 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1380  Heme oxygenase  33.5 
 
 
238 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1169  Heme oxygenase  32.86 
 
 
235 aa  122  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1414  Heme oxygenase  33.5 
 
 
238 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20441  Heme oxygenase  33.33 
 
 
235 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.810996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2604  Heme oxygenase  31.53 
 
 
248 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18031  Heme oxygenase  33.01 
 
 
236 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17861  Heme oxygenase  33.01 
 
 
236 aa  119  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22411  Heme oxygenase  33.5 
 
 
239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0166  Heme oxygenase (decyclizing)  30.54 
 
 
237 aa  118  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0588149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0196  Heme oxygenase (decyclizing)  31.03 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.895775  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2851  heme oxygenase  32.51 
 
 
238 aa  115  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0335  Heme oxygenase (decyclizing)  31.37 
 
 
239 aa  116  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0979075  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17811  Heme oxygenase  32.04 
 
 
236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1431  Heme oxygenase  31.98 
 
 
230 aa  115  6e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385185  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_5902  predicted protein  30.62 
 
 
213 aa  113  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1686  Heme oxygenase  30.58 
 
 
236 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.454788  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2345  heme oxygenase (decyclizing)  32.37 
 
 
230 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2758  Heme oxygenase  32.35 
 
 
216 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3241  Heme oxygenase  31.25 
 
 
217 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00174182  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0441  Heme oxygenase  29.33 
 
 
235 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379779  normal  0.592764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3767  Heme oxygenase  31.28 
 
 
238 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00293088  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17151  Heme oxygenase  32.99 
 
 
235 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.714978  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12588  predicted protein  31.4 
 
 
207 aa  104  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3062  Heme oxygenase  28.5 
 
 
217 aa  104  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486899  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1727  Heme oxygenase  31.79 
 
 
220 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1310  Heme oxygenase (decyclizing)  33.16 
 
 
226 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.608398 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3387  heme oxygenase  29.25 
 
 
224 aa  102  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.562296  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0098  Heme oxygenase  27.27 
 
 
256 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.627475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0101  Heme oxygenase  27.27 
 
 
256 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1054  Heme oxygenase  27.36 
 
 
222 aa  101  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.623466  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35580  heme oxygenase  30.34 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6429  heme oxygenase  31.47 
 
 
202 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4613  Heme oxygenase  30.69 
 
 
229 aa  99  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0163448  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0079  Heme oxygenase  29.19 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0990  Heme oxygenase  30.29 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3739  Heme oxygenase (decyclizing)  30.89 
 
 
227 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0567134  hitchhiker  0.000363645 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3872  Heme oxygenase  25.96 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121605  normal  0.243926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3085  Heme oxygenase  29.02 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3984  Heme oxygenase (decyclizing)  27.69 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.85445  normal  0.103899 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08750  heme oxygenase  29.59 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01200  heme oxygenase 2, putative  23.24 
 
 
364 aa  48.9  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89558  predicted protein  26.95 
 
 
221 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.27472  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>