More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0168 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  100 
 
 
207 aa  416  1e-115  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  98.55 
 
 
207 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
206 aa  140  1e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  37.62 
 
 
206 aa  138  6e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  29.95 
 
 
212 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  32.6 
 
 
305 aa  118  5e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  30.94 
 
 
310 aa  114  1e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  31.28 
 
 
306 aa  113  2e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16904e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
309 aa  111  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
312 aa  110  2e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 
307 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
348 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  30.48 
 
 
305 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  37.68 
 
 
305 aa  103  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  28.22 
 
 
420 aa  99.4  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  30.85 
 
 
307 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
330 aa  97.1  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  27.94 
 
 
307 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  31.89 
 
 
311 aa  93.6  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
304 aa  91.7  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  28.95 
 
 
312 aa  91.3  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  24.16 
 
 
327 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  24.18 
 
 
339 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  29.71 
 
 
341 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
340 aa  87.8  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  29.24 
 
 
341 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
329 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  32.84 
 
 
333 aa  87  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  25.7 
 
 
336 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  25.84 
 
 
342 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
333 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  30.72 
 
 
328 aa  85.9  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  23.6 
 
 
328 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  32.35 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  29.89 
 
 
341 aa  84.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  25.28 
 
 
349 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  25.28 
 
 
354 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  29.7 
 
 
335 aa  84.3  1e-15  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  29.12 
 
 
309 aa  84.7  1e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
331 aa  83.6  2e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  27.81 
 
 
341 aa  82.4  4e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.22 
 
 
256 aa  82.4  5e-15  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.22 
 
 
256 aa  82  5e-15  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
341 aa  82.4  5e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
256 aa  82  6e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  5.01952e-05 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
341 aa  81.6  7e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  25 
 
 
215 aa  81.6  7e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.22 
 
 
256 aa  81.6  8e-15  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
330 aa  80.1  2e-14  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
330 aa  80.1  2e-14  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
335 aa  80.5  2e-14  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  32.48 
 
 
256 aa  79.7  3e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  30.67 
 
 
409 aa  79  4e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.22 
 
 
256 aa  79.3  4e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
330 aa  79  5e-14  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
334 aa  79  5e-14  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
337 aa  77.8  9e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  32.42 
 
 
340 aa  77.8  1e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.85 
 
 
256 aa  77.4  1e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  27.7 
 
 
250 aa  77  2e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
330 aa  77  2e-13  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.91 
 
 
256 aa  75.9  4e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  30.37 
 
 
331 aa  75.9  4e-13  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  26.44 
 
 
206 aa  75.9  4e-13  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.85 
 
 
256 aa  75.9  4e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  26.63 
 
 
250 aa  75.5  6e-13  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.19 
 
 
254 aa  75.1  6e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  31.11 
 
 
250 aa  75.1  7e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
337 aa  75.1  7e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  28.86 
 
 
254 aa  74.7  8e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2544  methyltransferase type 12  29.17 
 
 
200 aa  74.7  8e-13  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 
255 aa  74.7  9e-13  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
258 aa  74.7  9e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
341 aa  74.7  9e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  28.19 
 
 
254 aa  73.9  1e-12  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.21 
 
 
256 aa  73.6  2e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  26.59 
 
 
317 aa  73.6  2e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  27.52 
 
 
254 aa  73.6  2e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  29.63 
 
 
331 aa  73.2  3e-12  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5294  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 
259 aa  72.8  4e-12  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.570437 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
257 aa  72.4  5e-12  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
225 aa  72  6e-12  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
326 aa  72  6e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
411 aa  72  6e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  26.14 
 
 
326 aa  72  6e-12  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  30.57 
 
 
256 aa  72  6e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  31.11 
 
 
268 aa  71.6  7e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
207 aa  71.6  7e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2395  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 
208 aa  71.2  9e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  9.65249e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  28.39 
 
 
267 aa  70.9  1e-11  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  25 
 
 
255 aa  70.9  1e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
210 aa  71.2  1e-11  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.14 
 
 
261 aa  70.9  1e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  25.57 
 
 
326 aa  70.9  1e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 
265 aa  70.1  2e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  23.27 
 
 
349 aa  70.1  2e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  27.56 
 
 
322 aa  70.1  2e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  24.73 
 
 
250 aa  69.7  3e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  34.65 
 
 
253 aa  69.7  3e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  25.36 
 
 
207 aa  69.7  3e-11  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>