118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0150 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0150  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.113557  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0149  hypothetical protein  97.78 
 
 		 225 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0873  SNARE associated Golgi protein  35.09 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000105314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0481  hypothetical protein  38.54 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000679806  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2985  SNARE associated Golgi protein  33.18 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0716748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03520  hypothetical protein  29.35 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.130294 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1002  hypothetical protein  34.07 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1893  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  106  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3011  SNARE associated Golgi protein  27.43 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.140642 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  29.38 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01370  hypothetical protein  36 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.867089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1595  SNARE associated Golgi protein  27.23 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.734861  hitchhiker  0.00926155 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1685  SNARE associated Golgi protein  34.86 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2268  hypothetical protein  38.35 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2397  hypothetical protein  34.03 
 
 		 238 aa  84.7  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  27.8 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  28.64 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  28.64 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2357  SNARE associated Golgi protein  24.58 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.865891  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0914  hypothetical protein  31.41 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0971  hypothetical protein  34.4 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  25.52 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01721  conserved inner membrane protein  28.03 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1890  SNARE associated Golgi protein-like protein  28.03 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.028896  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1836  hypothetical protein  28.03 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1975  hypothetical protein  28.03 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1880  SNARE associated Golgi protein  28.03 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124953 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1438  hypothetical protein  28.03 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.319111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01709  hypothetical protein  28.03 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1196  SNARE associated Golgi protein  28.36 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000186388  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2001  hypothetical protein  25.53 
 
 		 235 aa  69.7  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2471  hypothetical protein  27.39 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  26.18 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.13 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  25.47 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3139  SNARE associated Golgi protein  25.17 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2340  hypothetical protein  25.17 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.290858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1623  hypothetical protein  30.53 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000141356  normal  0.0113653 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1525  hypothetical protein  24.18 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1842  hypothetical protein  24.29 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04161  hypothetical protein  32.1 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0548142  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0746  hypothetical protein  23.33 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.528389 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  20.77 
 
 		 735 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  27.59 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0728  hypothetical protein  27.78 
 
 		 182 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  28.32 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0668  hypothetical protein  27.16 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0568  hypothetical protein  30.07 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.155537  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0510  hypothetical protein  30.07 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00856705  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0512  hypothetical protein  30.07 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000166734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0600  hypothetical protein  30.07 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  24.42 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0515  SNARE associated Golgi protein  31.06 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0657  hypothetical protein  30.07 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.85178e-22 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  24.82 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  23.26 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  22 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  23.26 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  23.26 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0639  hypothetical protein  31.51 
 
 		 182 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  23.26 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0516  SNARE associated Golgi protein  26.67 
 
 		 182 aa  49.3  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.156492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4699  hypothetical protein  30.53 
 
 		 182 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000989349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.76 
 
 		 713 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12210  hypothetical protein  23.08 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.992528  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  23.26 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  25.15 
 
 		 320 aa  48.9  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  22.65 
 
 		 238 aa  48.9  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  26.83 
 
 		 259 aa  48.5  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  22.67 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  28.72 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2719  putative transmemebrane protein  27.43 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934003  normal  0.0999716 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  22.67 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  22.67 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  23.12 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2421  hypothetical protein  23.81 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3057  SNARE associated Golgi protein  23.24 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000815606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  25.4 
 
 		 738 aa  47  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1727  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  23.17 
 
 		 266 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  23.04 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  23.45 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  24.84 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  24.07 
 
 		 245 aa  45.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  26.71 
 
 		 283 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  23.18 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  30 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  30 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  24.38 
 
 		 225 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0273  hypothetical protein  22.88 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.294063  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  21.74 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  27.92 
 
 		 240 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0668  SNARE associated Golgi protein  28 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000171663  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003943  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.46 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2829  hypothetical protein  24.5 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1483  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.83 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  25.52 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2545  hypothetical protein  25.18 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0636099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  28.21 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  25.26 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>