104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0124 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0124  sortase family protein  100 
 
 
292 aa  587  1e-166  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5387  sortase family protein  37.59 
 
 
272 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5330  sortase family protein  37.59 
 
 
272 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1858  sortase family protein  41.92 
 
 
266 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3113  sortase family protein  38.18 
 
 
268 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1804  sortase family protein  40.74 
 
 
266 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2537  sortase  38.08 
 
 
267 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2786  sortase  37.01 
 
 
282 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.175033  hitchhiker  0.00000000215644 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1406  sortase family protein  31.1 
 
 
293 aa  161  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1486  sortase family protein  37.73 
 
 
316 aa  159  6e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05690  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.13 
 
 
270 aa  158  8e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0146  sortase family protein  39.44 
 
 
273 aa  155  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1469  sortase  34.78 
 
 
327 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0773  sortase family protein  41.46 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00114802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0148  sortase family protein  38.46 
 
 
273 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.886356  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24310  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.85 
 
 
344 aa  150  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1261  sortase family protein  32.33 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00840  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  33.9 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1287  sortase  35.97 
 
 
377 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1025  sortase family protein  30.38 
 
 
337 aa  140  3e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1405  sortase family protein  35.78 
 
 
294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0772  sortase family protein  36.2 
 
 
279 aa  138  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00805513  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1532  sortase (surface protein transpeptidase)  36.43 
 
 
384 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0427  sortase family protein  30.48 
 
 
365 aa  136  5e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000168911 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0647  sortase family protein  33.47 
 
 
305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1485  sortase family protein  32.78 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05680  sortase family protein, LPXTG-site transpeptidase  32.23 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.781628  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1859  sortase family protein  30.89 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1805  sortase family protein  30.48 
 
 
269 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1214  sortase family protein  34.73 
 
 
339 aa  128  9.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000620808 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1522  sortase family protein  33.33 
 
 
308 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.301282  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1533  sortase (surface protein transpeptidase)  39.55 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.223047  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1161  sortase family protein  41.05 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000131719 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0422  sortase family protein  33.9 
 
 
381 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.102959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0648  sortase family protein  35.51 
 
 
260 aa  125  9e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0043  sortase family protein  30.21 
 
 
291 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0807  sortase (surface protein transpeptidase)  40 
 
 
249 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.759239  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0650  sortase family protein  41.28 
 
 
189 aa  98.6  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1484  sortase family protein  30.2 
 
 
292 aa  89  8e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4970  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.57 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4565  sortase  29.52 
 
 
206 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4953  LPXTG-site transpeptidase family protein  29.29 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4938  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.62 
 
 
206 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2615  sortase family protein  27.16 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.209279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4317  fimbria associated protein  29.52 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0301  LPXTG-site transpeptidase family protein  28.1 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4647  sortase family protein  29.29 
 
 
206 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4708  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.36 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4547  sortase  27.36 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4933  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.36 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0157  fimbria-associated protein  27.8 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000951258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0598  sortase family protein  27.63 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000660576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0599  sortase family protein  27.63 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0252782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0755  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.63 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0815  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.63 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0400761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0602  sortase family protein  27.19 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0211  sortase family protein  33.05 
 
 
187 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1218  sortase (surface protein transpeptidase)  32.37 
 
 
250 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000016214  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0129  lpxtg-site transpeptidase sortase family protein  26.69 
 
 
233 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402223 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0654  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.19 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000454419  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5069  LPXTG-site transpeptidase family protein  26.87 
 
 
198 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0212  sortase family protein  33.05 
 
 
187 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0719  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.19 
 
 
210 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0579393  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4617  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.19 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0891302  normal  0.0210172 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0743  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.19 
 
 
210 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000196785 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0688  LPXTG-site transpeptidase family protein  27.19 
 
 
233 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0578  sortase family protein  26.64 
 
 
210 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.276833  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2301  sortase family protein  26.05 
 
 
220 aa  62.4  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.206988  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0016  sortase family protein  32.68 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  31.4 
 
 
302 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5808  fimbria-associated protein  26.47 
 
 
233 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  38.04 
 
 
354 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  38.3 
 
 
350 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2842  sortase family protein  27.78 
 
 
197 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1255  sortase (surface protein transpeptidase)  24.12 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.20645  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  34.23 
 
 
238 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  33.59 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3139  sortase family protein  25.35 
 
 
200 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.211754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8826  sortase family protein  30.99 
 
 
229 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457222  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0961  sortase SrtA  24.55 
 
 
247 aa  53.5  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000962691  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1118  peptidase C60, sortase A and B  31.82 
 
 
263 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  33.59 
 
 
235 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2116  sortase family protein  30.95 
 
 
269 aa  53.1  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0022  sortase family protein  32.71 
 
 
268 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3291  sortase family protein  33.83 
 
 
209 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2542  peptidase C60, sortase A and B  32.37 
 
 
270 aa  52.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0900562  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4302  sortase family protein  22.22 
 
 
222 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000168018  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0060  sortase family protein  25.77 
 
 
192 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1385  sortase  23.79 
 
 
412 aa  49.7  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.70961  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2089  sortase  23.26 
 
 
203 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0825  sortase (surface protein transpeptidase)  24.39 
 
 
229 aa  48.5  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2383  peptidase C60, sortase A and B  31.37 
 
 
262 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.480623  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2421  peptidase C60, sortase A and B  31.11 
 
 
216 aa  47.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2551  sortase  22.9 
 
 
206 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2603  sortase  22.9 
 
 
206 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2138  sortase family protein  24.43 
 
 
323 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0374  sortase family protein  24.12 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  30.6 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0236  sortase family protein  26.52 
 
 
234 aa  44.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0041  sortase family protein  28.06 
 
 
238 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>