More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0118 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0118  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0119  ABC transporter  99.61 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.393598  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  74.8 
 
 
255 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1417  ABC transporter related  63.86 
 
 
279 aa  348  5e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.153222  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03360  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  63.49 
 
 
255 aa  344  8e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.922204 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1079  ABC transporter related  60.96 
 
 
276 aa  335  5e-91  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1938  ABC transporter related  60.96 
 
 
275 aa  314  8e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305639  normal  0.108587 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4956  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  56.05 
 
 
256 aa  294  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0279  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
256 aa  293  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4985  ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
256 aa  291  5e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4972  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
256 aa  291  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4565  ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
256 aa  291  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0124496  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4671  ABC transporter related  55.24 
 
 
256 aa  292  5e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4723  ABC transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 
256 aa  291  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4581  ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
256 aa  291  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5085  ABC transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 
256 aa  291  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4946  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  55.65 
 
 
256 aa  291  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3481  ABC transporter-related protein  53.94 
 
 
256 aa  289  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4557  ABC transporter, ATP-binding protein  54.76 
 
 
256 aa  288  7e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4950  bacitracin export ATP-binding protein BceA  54.37 
 
 
256 aa  287  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4888  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
253 aa  285  4e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4964  bacitracin export ATP-binding protein BceA  53.97 
 
 
256 aa  285  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
253 aa  285  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  55.2 
 
 
266 aa  284  9e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5201  bacitracin export ATP-binding protein BceA  54.47 
 
 
255 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4643  ABC transporter ATP-binding protein  54.8 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4478  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2843  ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4496  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2023  ABC transporter, ATP-binding protein  55.2 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4997  ABC transporter ATP-binding protein  54.8 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4867  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4857  ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4576  ABC transporter related  53.6 
 
 
253 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2310  ABC transporter related  54.8 
 
 
253 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0380  ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 
253 aa  278  4e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4659  ABC transporter related  54.8 
 
 
253 aa  278  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2110  ABC transporter related protein  52.36 
 
 
257 aa  278  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1694  peptide ABC transporter ATPase  57.08 
 
 
248 aa  278  9e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000011753  unclonable  4.03836e-28 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5204  bacitracin export ATP-binding protein BceA  54.4 
 
 
253 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2420  ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 
255 aa  275  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.658909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2490  ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 
270 aa  275  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.755313  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2162  ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 
255 aa  275  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.754182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2196  ABC transporter related  54.4 
 
 
258 aa  275  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111069  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2146  ABC transporter, ATP-binding protein  54.4 
 
 
255 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.278232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2972  ABC transporter, ATP-binding protein  54 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.344281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2355  ABC transporter, ATP-binding protein  54 
 
 
255 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  50.6 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2406  ABC transporter, ATP-binding protein  54 
 
 
255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5251  bacitracin export ATP-binding protein BceA  55.08 
 
 
253 aa  269  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1526  ABC transporter related protein  55.28 
 
 
254 aa  268  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  52.78 
 
 
256 aa  268  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 
256 aa  266  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4798  ABC transporter, ATP-binding protein  54.66 
 
 
253 aa  266  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  52.78 
 
 
256 aa  264  8e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2306  ABC transporter related  52.99 
 
 
256 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000206589  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  52.38 
 
 
256 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 
256 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  52.38 
 
 
256 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 
256 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  50 
 
 
259 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  52.38 
 
 
256 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0684  ABC transporter related  50.41 
 
 
253 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.511677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  51.19 
 
 
256 aa  260  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0699  ABC transporter related  50.41 
 
 
253 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184929  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  51.59 
 
 
256 aa  259  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4283  ABC transporter related  54.76 
 
 
258 aa  259  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0679  ABC transporter, ATP-binding protein  54.76 
 
 
258 aa  259  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000150042  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4570  ABC transporter, ATP-binding protein  54.76 
 
 
258 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  49.01 
 
 
274 aa  259  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4528  ABC transporter, ATP-binding protein  54.76 
 
 
258 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4334  ABC transporter ATP-binding protein  54.76 
 
 
258 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4171  ABC transporter, ATP-binding protein  54.76 
 
 
258 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.402066  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4182  ABC transporter, ATP-binding protein  54.76 
 
 
258 aa  259  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4669  ABC transporter ATP-binding protein  54.76 
 
 
258 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4517  ABC transporter, ATP-binding protein  54.76 
 
 
258 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  52.42 
 
 
250 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4555  ABC transporter, ATP-binding protein  54.76 
 
 
258 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 
250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  53.23 
 
 
250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  53.23 
 
 
250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  53.23 
 
 
250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  53.23 
 
 
250 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3152  ABC transporter-related protein  54.37 
 
 
258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  47.41 
 
 
252 aa  258  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  47.41 
 
 
252 aa  258  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4965  ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 
250 aa  255  5e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0268  ABC transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 
250 aa  255  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0314  ABC transporter, ATP-binding protein  47.97 
 
 
253 aa  254  7e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.924183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4993  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4681  ABC transporter related  52.42 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  51.98 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  52.02 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0341  ABC transporter related protein  49.19 
 
 
251 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0836  peptide ABC transporter ATPase  50.8 
 
 
251 aa  249  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.506405  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1308  peptide ABC transporter ATPase  48.21 
 
 
252 aa  250  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000199498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2892  ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 
251 aa  244  9e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3332  ABC transporter related  46.67 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2646  ABC transporter related  46.61 
 
 
251 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2702  ABC transporter related  46.61 
 
 
251 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>