222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0089 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0089  formate/nitrite transporter family protein  100 
 
 		 252 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1429  nitrite transporter  38.89 
 
 		 265 aa  190  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0198898  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1695  formate/nitrite transporter  38.1 
 
 		 265 aa  188  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0645091  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3165  formate/nitrite transporter  41.39 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000339601  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0800  formate/nitrite transporter  35.71 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4597  nitrite transporter NirC  31.98 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1359  formate/nitrite transporter family protein  30.31 
 
 		 283 aa  141  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1421  formate/nitrite transporter family protein  29.53 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1461  formate/nitrite transporter family protein  29.53 
 
 		 283 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3985  formate/nitrite transporter family protein  29.92 
 
 		 283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1222  formate/nitrite transporter family protein  29.25 
 
 		 283 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109703  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1199  formate/nitrite transporter family protein  29.25 
 
 		 283 aa  138  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1201  formate/nitrite transporter family protein  29.25 
 
 		 283 aa  138  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1321  formate/nitrite transporter family protein  29.25 
 
 		 283 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1397  formate/nitrite transporter family protein  29.25 
 
 		 283 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1223  formate/nitrite transporter  28.85 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0233  nitrite transporter NirC  32.13 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1450  formate/nitrite transporter  30.99 
 
 		 276 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3958  nitrite transporter NirC  31.73 
 
 		 268 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3718  nitrite transporter NirC  31.73 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3795  nitrite transporter NirC  31.58 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3674  nitrite transporter NirC  30.77 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03218  nitrite transporter  30.77 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0345  formate/nitrite transporter  30.77 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3674  nitrite transporter NirC  30.77 
 
 		 289 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0345  nitrite transporter NirC  30.77 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3743  nitrite transporter NirC  30.77 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.966188  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03170  hypothetical protein  30.77 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3748  nitrite transporter NirC  30.77 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.373246 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4678  nitrite transporter NirC  30.77 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.402738 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3783  nitrite transporter NirC  30.77 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3837  nitrite transporter NirC  30.77 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3845  nitrite transporter NirC  30.77 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3649  nitrite transporter NirC  30.77 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222466 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3563  nitrite transporter NirC  30.77 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1035  formate/nitrite transporter  29.25 
 
 		 277 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2227  formate/nitrite transporter  33.48 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0074  formate/nitrite transporter  34.08 
 
 		 285 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1135  formate transporter  34.82 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.258908  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46427  predicted protein  34.06 
 
 		 315 aa  106  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.215207  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0209  formate/nitrite transporter  32.34 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1956  putative formate transporter 1  33.33 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1838  putative formate transporter FdhC  34.5 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.17934e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0917  formate/nitrite transporter  31.65 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45982e-32 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25116  FNT family transporter: formate/nitrite  36.78 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.413468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3306  formate/nitrite transporter  33.91 
 
 		 289 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0326166  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0234  FNT family protein  29.44 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2194  formate/nitrite transporter  32.31 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0306752  normal  0.415669 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0999  formate/nitrite transporter  33.66 
 
 		 278 aa  99  7e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003830  formate efflux transporter  32.94 
 
 		 286 aa  95.5  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33420  formate/nitrite transporter family protein  27.23 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.375482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1906  formate/nitrite transporter  28.79 
 
 		 269 aa  93.6  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0937381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51110  formate,nitrite transporter  37.1 
 
 		 269 aa  93.2  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.269845  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1299  putative formate transporter 1  31.47 
 
 		 303 aa  92.8  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0151  formate/nitrite transporter  32.02 
 
 		 280 aa  92.8  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01852  hypothetical protein  31.85 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0191  formate/nitrite transporter  28.78 
 
 		 382 aa  91.7  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1072  putative formate transporter FocA  32.26 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.4998  normal  0.491294 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2663  formate/nitrite transporter  32.7 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000134322  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1038  putative formate transporter FocA  32.26 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.195915  normal  0.263222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1087  putative formate transporter FocA  32.26 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1007  putative formate transporter FocA  32.26 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.693785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0979  putative formate transporter FocA  32.26 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.377209  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00908  formate transporter  31.85 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.839413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2739  formate/nitrite transporter  31.85 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.851182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2911  formate transporter, putative  31.49 
 
 		 324 aa  89  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1001  formate transporter  31.85 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.304412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00915  hypothetical protein  31.85 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2424  formate transporter  31.85 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.307423  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2217  formate transporter  31.85 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.594776 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1065  formate transporter  31.85 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2692  formate transporter  31.85 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0091  formate/nitrate transporter  29.78 
 
 		 293 aa  89.4  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0018  formate/nitrate transporter  35.98 
 
 		 265 aa  89.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.135457  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1010  formate transporter  31.85 
 
 		 285 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00439262  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2100  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 316 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1562  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 324 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.141715 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1424  formate/nitrite transporter  31.85 
 
 		 285 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2470  formate/nitrite transporter  31.6 
 
 		 558 aa  87  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0519177  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01040  formate/nitrite transporter family protein  31.62 
 
 		 279 aa  86.3  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.281121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1495  formate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 324 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.299399  normal  0.115317 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1556  methionine gamma-lyase  32.8 
 
 		 324 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.331691  normal  0.232428 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1997  formate/nitrite transporter family protein  24.7 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4660  formate/nitrite transporter  29.03 
 
 		 271 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1621  formate/nitrite transporter  28.93 
 
 		 290 aa  85.5  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2344  formate/nitrite transporter  32 
 
 		 285 aa  85.5  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0842  formate/nitrite transporter  28.33 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1084  formate/nitrite transporter family protein  27.83 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.350742  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2376  formate/nitrite transporter  31.43 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3472  formate transporter  27.83 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000183902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1703  formate transporter  31.05 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.57542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2402  formate/nitrite transporter  31.87 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000214776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1710  formate/nitrite transporter  31.87 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.402769  hitchhiker  0.00135887 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3777  putative formate transporter  27.62 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1475  putative formate transporter  28.17 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000668667  hitchhiker  0.0000156273 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0474  putative formate transporter 1  31.8 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188118  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1449  formate/nitrite transporter  29.61 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.748577  normal  0.576318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3493  formate/nitrite transporter  28.17 
 
 		 271 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000349448  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1504  hypothetical protein  29.47 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.870795  normal  0.369594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1325  formate/nitrite transporter  29.61 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>