More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0084 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3495  iolD protein  58.81 
 
 		 645 aa  797    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2335  iolD protein  65.99 
 
 		 644 aa  897    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2530  putative iolD protein  65.99 
 
 		 644 aa  898    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612889 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2298  malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  65.83 
 
 		 644 aa  894    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2254  myo-inositol catabolism protein, malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  65.83 
 
 		 644 aa  902    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1621  hypothetical protein  50.62 
 
 		 623 aa  647    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1616  hypothetical protein  50.08 
 
 		 623 aa  639    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3269  pyruvate decarboxylase:pyruvate decarboxylase  58.81 
 
 		 645 aa  800    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149274  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0302  myo-inositol catabolism protein  65.05 
 
 		 644 aa  888    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4015  thiamine pyrophosphate protein central region  67.19 
 
 		 638 aa  894    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2514  acetolactate synthase IolD  65.99 
 
 		 644 aa  897    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.868451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3048  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  56.41 
 
 		 648 aa  720    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1876  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  56.56 
 
 		 648 aa  719    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662616 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  57.59 
 
 		 643 aa  743    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50100  myo-inositol catabolism protein IolD  62.11 
 
 		 645 aa  805    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0084  myo-inositol catabolism protein IolD  100 
 
 		 639 aa  1327    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1578  myo-inositol catabolism protein  61.21 
 
 		 645 aa  814    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.505237  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2976  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  56.56 
 
 		 648 aa  720    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3342  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  54.84 
 
 		 643 aa  701    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.621165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3002  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  57.28 
 
 		 643 aa  725    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4659  thiamine pyrophosphate protein central region  58.67 
 
 		 646 aa  755    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4714  probable malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  57.23 
 
 		 646 aa  760    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163823  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1524  thiamine pyrophosphate protein central region  47.66 
 
 		 623 aa  598  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1718  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  45.12 
 
 		 626 aa  597  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  45.38 
 
 		 621 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  45.29 
 
 		 637 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4539  thiamine pyrophosphate protein central region  44.72 
 
 		 637 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1800  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.01 
 
 		 626 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0659  thiamine pyrophosphate protein central region  43.93 
 
 		 623 aa  550  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3608  thiamine pyrophosphate protein central region  42.7 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908775  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  45.28 
 
 		 623 aa  547  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1695  thiamine pyrophosphate protein central region  43.86 
 
 		 624 aa  547  1e-154  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5566  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.61 
 
 		 612 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2599  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  40.88 
 
 		 649 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2745  thiamine pyrophosphate protein central region  40.54 
 
 		 649 aa  519  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0728  thiamine pyrophosphate protein central region  41.12 
 
 		 645 aa  519  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4056  thiamine pyrophosphate protein central region  43.01 
 
 		 643 aa  520  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3121  thiamine pyrophosphate protein central region  43.01 
 
 		 652 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0077  acetolactate synthase  42.74 
 
 		 607 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4019  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.8 
 
 		 649 aa  511  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14756 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3838  thiamine pyrophosphate protein central region  43.8 
 
 		 607 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0714  TPP-requiring enzyme IolD  42.45 
 
 		 607 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83955  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1595  thiamine pyrophosphate protein central region  42.41 
 
 		 620 aa  502  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0670  TPP-requiring enzyme IolD  42.61 
 
 		 607 aa  504  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0981  thiamine pyrophosphate protein central region  42.74 
 
 		 616 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1134  thiamine pyrophosphate protein central region  42.74 
 
 		 616 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474291 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1601  thiamine pyrophosphate protein central region  43.12 
 
 		 649 aa  501  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3561  thiamine pyrophosphate protein central region  42.39 
 
 		 622 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0138  thiamine pyrophosphate protein central region  40.44 
 
 		 653 aa  491  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5446  thiamine pyrophosphate protein central region  40.68 
 
 		 664 aa  490  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1325  putative myo-inositol catabolism LolD protein  41.78 
 
 		 659 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7802  thiamine pyrophosphate protein central region  40.22 
 
 		 612 aa  482  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.821593  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0822  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.32 
 
 		 654 aa  484  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1369  thiamine pyrophosphate protein central region  41.15 
 
 		 644 aa  483  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0939  thiamine pyrophosphate protein central region  40.88 
 
 		 660 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0912  iolD protein  42.77 
 
 		 661 aa  480  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0725  iolD protein  42.77 
 
 		 646 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2810  thiamine pyrophosphate protein central region  42.19 
 
 		 657 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595591  normal  0.165764 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1443  iolD protein  42.77 
 
 		 646 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0437  iolD protein  42.77 
 
 		 646 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1830  iolD protein  42.61 
 
 		 661 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.301996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3315  thiamine pyrophosphate protein central region  42.23 
 
 		 618 aa  478  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1654  iolD protein  42.61 
 
 		 646 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1676  iolD protein  42.61 
 
 		 646 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479049  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  40.82 
 
 		 612 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  41.56 
 
 		 627 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2648  iolD protein  42.15 
 
 		 667 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0487  putative malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  40.82 
 
 		 610 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.853743  normal  0.367436 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3284  acetolactate synthase  39.97 
 
 		 614 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.787406  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4016  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  39.97 
 
 		 614 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  39.94 
 
 		 627 aa  457  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  41.54 
 
 		 636 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1675  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.25 
 
 		 609 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  41.6 
 
 		 627 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.02 
 
 		 627 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  41.44 
 
 		 627 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.44 
 
 		 627 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2834  thiamine pyrophosphate protein central region  39.12 
 
 		 613 aa  447  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  40.4 
 
 		 638 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.43 
 
 		 627 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  38.63 
 
 		 627 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3348  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  37.73 
 
 		 622 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0194169  normal  0.142166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1420  thiamine pyrophosphate enzyme protein  38.56 
 
 		 623 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406796  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1269  thiamine pyrophosphate protein central region  37.48 
 
 		 621 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4209  thiamine pyrophosphate protein central region  35.57 
 
 		 624 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.423105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6846  thiamine pyrophosphate protein central region  36.19 
 
 		 616 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  47.61 
 
 		 924 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  28.78 
 
 		 578 aa  204  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  28.97 
 
 		 566 aa  189  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  26.54 
 
 		 595 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.54 
 
 		 595 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  26.54 
 
 		 595 aa  188  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  26.67 
 
 		 587 aa  186  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.94 
 
 		 600 aa  183  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  26.18 
 
 		 566 aa  182  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  29.14 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26 
 
 		 576 aa  181  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  26.98 
 
 		 554 aa  180  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.16 
 
 		 572 aa  179  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  27.36 
 
 		 567 aa  178  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>