More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0060 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  100 
 
 		 358 aa  741    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  99.16 
 
 		 358 aa  735    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0703  Alanine--glyoxylate transaminase  56.15 
 
 		 357 aa  445  1.0000000000000001e-124  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  47.9 
 
 		 356 aa  360  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  47.62 
 
 		 356 aa  359  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  47.34 
 
 		 357 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  44.94 
 
 		 357 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  44.66 
 
 		 358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  45.81 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  45.04 
 
 		 355 aa  323  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  44.92 
 
 		 360 aa  304  2.0000000000000002e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  44.07 
 
 		 362 aa  288  9e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  37.33 
 
 		 370 aa  249  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  35.93 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  36.77 
 
 		 375 aa  240  2e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  35.08 
 
 		 370 aa  237  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  34.54 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  37.97 
 
 		 383 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  36.05 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  35.81 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  35.47 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  34.64 
 
 		 383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  34.82 
 
 		 385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  33.71 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  35.19 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  33.61 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  34.59 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  34.59 
 
 		 382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  36.18 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  33.72 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  32.49 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  34.67 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  35.91 
 
 		 382 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  36.46 
 
 		 381 aa  187  2e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  33.61 
 
 		 382 aa  182  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.25 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  34.79 
 
 		 387 aa  182  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  33.43 
 
 		 384 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  32.43 
 
 		 379 aa  180  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  30.85 
 
 		 363 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  33.9 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  33.14 
 
 		 380 aa  179  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  34.38 
 
 		 379 aa  178  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  33.43 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  32.12 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  31.78 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  32.08 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  32.18 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  31.67 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  31.61 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  31.67 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.45 
 
 		 400 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.38 
 
 		 380 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  30.59 
 
 		 383 aa  172  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44075  predicted protein  33.14 
 
 		 379 aa  169  5e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  31.84 
 
 		 375 aa  169  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.92 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  31.3 
 
 		 387 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  30.92 
 
 		 396 aa  169  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  31.84 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  31.39 
 
 		 381 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  30.56 
 
 		 384 aa  166  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  29.32 
 
 		 390 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  30.56 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  31.36 
 
 		 362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  31.07 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  31.23 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  31.95 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0909  aminotransferase class V  33.24 
 
 		 377 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.520093  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  31.3 
 
 		 394 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  31.71 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  31.09 
 
 		 387 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  30.88 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  30.56 
 
 		 382 aa  160  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  30.47 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  31.16 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0056  aminotransferase, class V  32.4 
 
 		 376 aa  159  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  29.65 
 
 		 406 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  30.56 
 
 		 406 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  30.36 
 
 		 382 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0881  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  34.12 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.933241  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1817  putative aminotransferase  31.28 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372186  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09411  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  34.12 
 
 		 394 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.427075  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  32.18 
 
 		 381 aa  157  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  31.3 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  31.12 
 
 		 396 aa  156  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  28.97 
 
 		 385 aa  156  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  28.97 
 
 		 385 aa  156  6e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  30 
 
 		 397 aa  156  6e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  29.89 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  29.38 
 
 		 406 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  30.2 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  30.18 
 
 		 384 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  30.58 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  30.66 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0163  Alanine--glyoxylate transaminase  31.96 
 
 		 396 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  27.93 
 
 		 414 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  30.95 
 
 		 421 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  28.74 
 
 		 396 aa  152  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  29.09 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>