More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0053 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0053  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0056  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0791  hypothetical protein  59.82 
 
 
112 aa  134  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2143  hypothetical protein  55.75 
 
 
113 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000242142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0034  hypothetical protein  54.46 
 
 
111 aa  124  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00230988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0300  hypothetical protein  59.18 
 
 
104 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0987311  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0047  hypothetical protein  54.9 
 
 
119 aa  116  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0243  hypothetical protein  56.86 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000366291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0031  hypothetical protein  53.54 
 
 
99 aa  114  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000133634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0017  hypothetical protein  52.38 
 
 
108 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20780  conserved hypothetical protein TIGR00103  52.48 
 
 
102 aa  113  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0093  hypothetical protein  52.94 
 
 
104 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.790212  hitchhiker  0.0000035436 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4328  hypothetical protein  56.12 
 
 
104 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0095  hypothetical protein  54.64 
 
 
104 aa  111  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0375  hypothetical protein  51 
 
 
104 aa  111  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000118916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0194  hypothetical protein  54 
 
 
104 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.06405e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0211  hypothetical protein  54 
 
 
104 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0452861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0801  hypothetical protein  50 
 
 
104 aa  108  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0366  hypothetical protein  58.76 
 
 
104 aa  105  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000356644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1143  hypothetical protein  48.25 
 
 
113 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0324443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0541  hypothetical protein  52.43 
 
 
103 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000849008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2129  hypothetical protein  47.52 
 
 
102 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.293939  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0507  hypothetical protein  49 
 
 
100 aa  104  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.845644  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3421  hypothetical protein  56.7 
 
 
104 aa  103  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145337  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0016  hypothetical protein  50.49 
 
 
105 aa  103  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0043  hypothetical protein  52.13 
 
 
105 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00471711  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2270  hypothetical protein  47.57 
 
 
103 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1004  hypothetical protein  52.75 
 
 
101 aa  100  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0374061  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0116  hypothetical protein  43.75 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000133344  normal  0.143871 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0032  hypothetical protein  46 
 
 
102 aa  99  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000102998  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1387  hypothetical protein  52.81 
 
 
99 aa  97.4  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1739  hypothetical protein  47.27 
 
 
127 aa  97.4  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243349  normal  0.0708671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0107  hypothetical protein  44.66 
 
 
103 aa  97.4  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0067  hypothetical protein  44.66 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3923  hypothetical protein  45.36 
 
 
101 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153942  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36560  conserved hypothetical protein TIGR00103  47.17 
 
 
118 aa  94.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.29616  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0327  hypothetical protein  47.42 
 
 
102 aa  94.4  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.863681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2790  hypothetical protein  45.36 
 
 
110 aa  94.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00558888  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6869  hypothetical protein  45.1 
 
 
111 aa  93.6  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.273576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0051  hypothetical protein  59.38 
 
 
110 aa  92  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000883025  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01590  conserved hypothetical protein TIGR00103  43 
 
 
101 aa  91.7  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200269 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0253  hypothetical protein  52.38 
 
 
117 aa  90.1  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0347307  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2167  hypothetical protein  47 
 
 
106 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.230597  normal  0.38651 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2146  hypothetical protein  40.78 
 
 
103 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0020  hypothetical protein  52.38 
 
 
108 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000261671  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0258  hypothetical protein  46.15 
 
 
104 aa  88.2  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0882  hypothetical protein  46.23 
 
 
118 aa  87.8  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000000000577167  normal  0.0425373 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0106  hypothetical protein  46.39 
 
 
99 aa  88.2  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000396759  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0195  hypothetical protein  47 
 
 
98 aa  87.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.933815  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0604  hypothetical protein  46.32 
 
 
113 aa  86.7  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2910  hypothetical protein  43.56 
 
 
107 aa  86.3  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0427625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2292  hypothetical protein  42 
 
 
100 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.99726  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02340  conserved hypothetical protein TIGR00103  39.6 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.001975  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3200  hypothetical protein  50.6 
 
 
100 aa  85.5  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000349451  normal  0.470148 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1534  hypothetical protein  42 
 
 
100 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6565  hypothetical protein  45.83 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117283  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1309  hypothetical protein  44.23 
 
 
109 aa  84.3  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000243937  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0028  hypothetical protein  44.19 
 
 
104 aa  84  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.550866  hitchhiker  0.0000076986 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3777  hypothetical protein  42 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0610332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1086  hypothetical protein  43.81 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3636  hypothetical protein  41 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130906  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0188  hypothetical protein  36.89 
 
 
103 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3694  hypothetical protein  41 
 
 
103 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0165  hypothetical protein  43.56 
 
 
114 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6147  hypothetical protein  43.48 
 
 
116 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.918474  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0513  hypothetical protein  46.91 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0500  hypothetical protein  46.91 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00615814  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1592  hypothetical protein  40.38 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.107966  normal  0.0589589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1920  hypothetical protein  40.38 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5293  hypothetical protein  48.75 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00134592  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0025  hypothetical protein  48.75 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000165828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0021  hypothetical protein  47.5 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0022  hypothetical protein  47.5 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0020  hypothetical protein  47.5 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0020  hypothetical protein  47.5 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124742  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0711  hypothetical protein  42.16 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0020  hypothetical protein  47.5 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.113689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2380  hypothetical protein  45.1 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000806852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0027  hypothetical protein  47.5 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000699023  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0520  hypothetical protein  41.18 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.149206  normal  0.329373 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2366  hypothetical protein  42.16 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.242324  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0024  hypothetical protein  47.5 
 
 
109 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2406  hypothetical protein  44.12 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000526111  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1509  hypothetical protein  43.81 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0528919  normal  0.482179 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0231  hypothetical protein  44.44 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0115  hypothetical protein  45.68 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2234  hypothetical protein  44.55 
 
 
109 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846885  hitchhiker  0.000165912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7345  hypothetical protein  42 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0573  hypothetical protein  44.55 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000610964  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3877  hypothetical protein  40.78 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.598756  normal  0.10934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1860  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00278106  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1179  hypothetical protein  43.88 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000863207  normal  0.0112424 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1074  hypothetical protein  43.14 
 
 
108 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2195  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.388148  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1171  hypothetical protein  43.14 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000413849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0019  hypothetical protein  48.75 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00658876  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0530  hypothetical protein  49.46 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00315324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4847  hypothetical protein  41 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0019  hypothetical protein  47.5 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0215941  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1459  hypothetical protein  42.16 
 
 
108 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>