More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0047 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0047  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
262 aa  522  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000638304  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0046  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  98.47 
 
 
262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09840  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.04 
 
 
284 aa  238  8e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.15 
 
 
257 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3705  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
270 aa  225  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.74 
 
 
270 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5266  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.32 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5011  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.32 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4840  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.32 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4855  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.32 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.32 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5391  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.32 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5247  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.32 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5281  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.32 
 
 
270 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4955  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.26 
 
 
270 aa  221  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.27 
 
 
279 aa  217  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0785  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.27 
 
 
279 aa  217  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.577083  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2986  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.68 
 
 
269 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0528161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3170  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.58 
 
 
270 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1279  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.08 
 
 
250 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0904  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.98 
 
 
293 aa  206  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1967  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.8 
 
 
282 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.394112  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0737  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.53 
 
 
257 aa  202  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1192  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.58 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1165  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.58 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2716  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.8 
 
 
251 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000613339  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0429  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.01 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0370  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.86 
 
 
275 aa  199  5e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0767  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.08 
 
 
293 aa  195  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0790  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.08 
 
 
293 aa  195  6e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1327  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.41 
 
 
278 aa  195  7e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000868448  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0984  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.33 
 
 
320 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2585  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.56 
 
 
293 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.221457  normal  0.189717 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0191  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.03 
 
 
277 aa  191  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.95258  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0273  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.03 
 
 
277 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4345  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.87 
 
 
285 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0767  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.92 
 
 
267 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0323676  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.7 
 
 
263 aa  186  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0760049  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1408  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.41 
 
 
289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.997076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1554  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.86 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000775379  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1209  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.86 
 
 
266 aa  176  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.77 
 
 
297 aa  172  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.337573  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06631  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.59 
 
 
304 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04851  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.37 
 
 
297 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0473  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.63 
 
 
357 aa  168  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0590188  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05151  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.38 
 
 
303 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.404739 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1792  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.78 
 
 
303 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04611  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.63 
 
 
303 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05161  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.3 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1230  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.7 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0607531 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0909  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.48 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.173456  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.34 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.875971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0868  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.68 
 
 
291 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.514857  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05241  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.37 
 
 
297 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2481  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.98 
 
 
305 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.148056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1553  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.46 
 
 
288 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.880731 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.92 
 
 
297 aa  159  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262365  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1736  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.6 
 
 
280 aa  158  8e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0556739  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C63  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  36.84 
 
 
268 aa  158  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2864  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.84 
 
 
305 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0627  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.72 
 
 
290 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616827  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0626  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.55 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1139  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.11 
 
 
282 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2569  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.94 
 
 
295 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000200473  hitchhiker  0.00320491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.84 
 
 
299 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4306  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.1 
 
 
290 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14920  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.44 
 
 
307 aa  136  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13542  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0481  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.09 
 
 
315 aa  135  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.04165  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0804  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.07 
 
 
305 aa  135  5e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1934  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  35.32 
 
 
387 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0138413  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2944  Prolipoprotein diacylglyceryltransferase-like protein  33.47 
 
 
372 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0870252  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  34.15 
 
 
276 aa  132  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3064  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.6 
 
 
865 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333242  normal  0.223199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3048  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.6 
 
 
954 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.814492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3107  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.6 
 
 
954 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.851617  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2819  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.97 
 
 
820 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200403  normal  0.775609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2513  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31 
 
 
362 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1455  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.78 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5705  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.67 
 
 
388 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.84 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.175815  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12920  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.06 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.870796  normal  0.137466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1685  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.48 
 
 
396 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000186875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1690  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.39 
 
 
409 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.268506  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4457  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.46 
 
 
319 aa  125  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0207952  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2870  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  33.48 
 
 
498 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00175644  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2962  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  30.11 
 
 
334 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.16 
 
 
292 aa  122  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20720  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.33 
 
 
325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.14446  normal  0.252754 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1218  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.03 
 
 
285 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3340  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.68 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469594  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1502  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  32.1 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3014  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.62 
 
 
409 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5699  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  27.94 
 
 
371 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0462  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.44 
 
 
342 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.285848  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28080  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.37 
 
 
354 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.640026  normal  0.438535 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0905  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.68 
 
 
267 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4475  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.47 
 
 
345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00262186  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0855  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  28.21 
 
 
279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.984114  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2491  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  31.91 
 
 
344 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  29.55 
 
 
323 aa  108  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>