147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0044 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0044  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  386  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0043  hypothetical protein  97.94 
 
 		 194 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2882  G3E family GTPase-like protein  30.46 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000684528  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3005  permease  31.79 
 
 		 524 aa  63.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  25.99 
 
 		 308 aa  62  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  25.42 
 
 		 308 aa  61.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  23.36 
 
 		 364 aa  58.9  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  27.89 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  25.15 
 
 		 333 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  26.19 
 
 		 344 aa  53.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  22.27 
 
 		 420 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2062  cobalamin synthesis protein P47K  22.58 
 
 		 397 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.410151  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  25 
 
 		 395 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  24.14 
 
 		 337 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  22.67 
 
 		 320 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  25.13 
 
 		 293 aa  51.6  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  24.06 
 
 		 423 aa  51.6  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  21.13 
 
 		 388 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  25.95 
 
 		 324 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  23.12 
 
 		 358 aa  50.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  25.14 
 
 		 380 aa  50.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  26.11 
 
 		 360 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  24.34 
 
 		 357 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0047  permease  31.09 
 
 		 524 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000898812  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  25.57 
 
 		 331 aa  49.3  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  23.98 
 
 		 406 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  24.87 
 
 		 339 aa  49.7  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  22.38 
 
 		 399 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  25 
 
 		 378 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  25 
 
 		 378 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1227  cobalamin synthesis protein P47K  21.26 
 
 		 341 aa  48.9  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.381423 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  24.53 
 
 		 395 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  24.06 
 
 		 395 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  21.1 
 
 		 408 aa  48.9  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  24.53 
 
 		 395 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0711  cobalamin synthesis protein, P47K  25.29 
 
 		 308 aa  48.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  26.02 
 
 		 296 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0727  cobalamin synthesis protein P47K  25.29 
 
 		 308 aa  48.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  26.02 
 
 		 296 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  26.74 
 
 		 362 aa  48.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  19.39 
 
 		 356 aa  48.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  24.53 
 
 		 527 aa  47.8  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  22.37 
 
 		 417 aa  47.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4084  cobalamin synthesis protein, P47K  21.96 
 
 		 420 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4282  cobalamin synthesis protein, P47K  21.96 
 
 		 420 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  24.54 
 
 		 322 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  20 
 
 		 313 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  24.86 
 
 		 324 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  21.58 
 
 		 360 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  24.37 
 
 		 346 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  22.07 
 
 		 406 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  22.65 
 
 		 433 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  21.54 
 
 		 377 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  23.58 
 
 		 395 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  23.16 
 
 		 347 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  21.93 
 
 		 395 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  23.58 
 
 		 395 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  20.74 
 
 		 400 aa  45.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  23.11 
 
 		 395 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  21.74 
 
 		 460 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6542  cobalamin synthesis protein, P47K  21.63 
 
 		 414 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  20.5 
 
 		 410 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  26.23 
 
 		 624 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  23.53 
 
 		 369 aa  45.4  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  19.34 
 
 		 377 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2994  cobalamin synthesis protein P47K  23.53 
 
 		 372 aa  45.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6256  cobalamin synthesis protein P47K  21.63 
 
 		 414 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420491  normal  0.88577 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  22.4 
 
 		 379 aa  45.1  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  21.72 
 
 		 401 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  19.7 
 
 		 355 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  19.19 
 
 		 357 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  20.74 
 
 		 382 aa  45.1  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  23.33 
 
 		 379 aa  44.7  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  19.74 
 
 		 352 aa  44.7  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  21.86 
 
 		 460 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  22.28 
 
 		 460 aa  44.7  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  22.95 
 
 		 363 aa  44.7  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0339  hypothetical protein  28.18 
 
 		 208 aa  44.7  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  22.7 
 
 		 349 aa  44.7  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  22.4 
 
 		 372 aa  44.7  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  23.28 
 
 		 362 aa  44.7  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  20.99 
 
 		 322 aa  44.7  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  23.66 
 
 		 320 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  21.5 
 
 		 406 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  22.22 
 
 		 415 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  22.75 
 
 		 449 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  20.21 
 
 		 395 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  20.54 
 
 		 328 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  24.04 
 
 		 354 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  22.63 
 
 		 449 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  22.7 
 
 		 362 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  22.75 
 
 		 449 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  20.91 
 
 		 394 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  24.48 
 
 		 346 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  22.75 
 
 		 365 aa  43.9  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  24.48 
 
 		 346 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3235  cobalamin synthesis protein P47K  22.43 
 
 		 420 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  20.1 
 
 		 408 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  23.16 
 
 		 452 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  24.06 
 
 		 366 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>