184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0033 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0033  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 		 294 aa  598  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.484885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0033  phosphatidylserine decarboxylase  98.3 
 
 		 294 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2613  phosphatidylserine decarboxylase  61.09 
 
 		 300 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3539  phosphatidylserine decarboxylase  59.25 
 
 		 298 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.100756  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1652  phosphatidylserine decarboxylase-related  39.04 
 
 		 298 aa  226  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.967613  normal  0.178004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1976  phosphatidylserine decarboxylase  37.79 
 
 		 306 aa  225  9e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129589 
 
 
-
 
NC_002620  TC0072  phosphatidylserine decarboxylase  35.99 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1961  phosphatidylserine decarboxylase-related  39.52 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.23874  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02200  phosphatidylserine decarboxylase, putative  37.86 
 
 		 1264 aa  171  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03188  phosphatidylserine decarboxylase Psd2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13970)  35.29 
 
 		 1053 aa  169  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.927453 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  36.43 
 
 		 286 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40695  phosphatidylserine decarboxylase  38.55 
 
 		 1064 aa  162  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.350595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  34.86 
 
 		 292 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  35.09 
 
 		 285 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  34.86 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  34.51 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  34.15 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  34.15 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  34.15 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  34.15 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07989  phosphatidylserine decarboxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16930)  32.3 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.167037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  33.8 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  34.47 
 
 		 285 aa  149  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  35.51 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  34.08 
 
 		 285 aa  146  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  34.3 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  33.94 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  33.33 
 
 		 325 aa  145  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  32.27 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  35.61 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  33.58 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  33.94 
 
 		 286 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  32.26 
 
 		 613 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04930  conserved hypothetical protein  35.46 
 
 		 409 aa  138  8.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  31.89 
 
 		 610 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2876  phosphatidylserine decarboxylase  31.43 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  33.94 
 
 		 287 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0445  phosphatidylserine decarboxylase  33.07 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  34.88 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  30.6 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  30.96 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  30.96 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  30.4 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  34.26 
 
 		 286 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  30.6 
 
 		 287 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  31.34 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  29.43 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  32.22 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  32.22 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  30.6 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  30.6 
 
 		 289 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 		 294 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  32.49 
 
 		 287 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1332  phosphatidylserine decarboxylase  28.29 
 
 		 259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  27.65 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  30.04 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  32.46 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  32.23 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  29.56 
 
 		 286 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4381  phosphatidylserine decarboxylase  32.6 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  31.02 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  31.02 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0385  phosphatidylserine decarboxylase  30 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  31.02 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  31.02 
 
 		 322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  32.02 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  32.02 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  32.02 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  31.02 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  32.09 
 
 		 322 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  32.09 
 
 		 322 aa  125  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  32.09 
 
 		 322 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  33.64 
 
 		 288 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  32.09 
 
 		 322 aa  125  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  32.09 
 
 		 322 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  32.09 
 
 		 322 aa  125  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  32.09 
 
 		 322 aa  125  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3755  phosphatidylserine decarboxylase  29.56 
 
 		 342 aa  125  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  31.72 
 
 		 322 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  27.92 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  27.92 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  33.2 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  29.24 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  31.2 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  29.39 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  28.22 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1925  phosphatidylserine decarboxylase  28.36 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0944439  hitchhiker  0.00451587 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2358  phosphatidylserine decarboxylase  28.88 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  31.27 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2218  phosphatidylserine decarboxylase  29.82 
 
 		 277 aa  122  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.127421  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  29.64 
 
 		 294 aa  122  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  30.5 
 
 		 316 aa  122  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0346  phosphatidylserine decarboxylase  30.83 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  unclonable  0.00000248623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4073  phosphatidylserine decarboxylase  32.51 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.293375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2462  phosphatidylserine decarboxylase  33.2 
 
 		 259 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0788063  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  31.27 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  32.35 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  28.63 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1716  phosphatidylserine decarboxylase  30.16 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0895386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  29.71 
 
 		 304 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>