243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0030 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0030  degV family protein  100 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0030  degV family protein  97.94 
 
 		 291 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0869  degV family protein  43.6 
 
 		 287 aa  261  6.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10840  degV family protein  45.14 
 
 		 291 aa  246  2e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00470044  unclonable  0.00000000186001 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1556  degV family protein  41.32 
 
 		 292 aa  238  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0165981 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1951  degV family protein  44.91 
 
 		 286 aa  225  8e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3275  degV family protein  39.93 
 
 		 292 aa  222  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000632597  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3343  degV family protein  39.18 
 
 		 289 aa  222  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000215363  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2258  degV family protein  40.35 
 
 		 293 aa  218  7e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0884307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1542  degV family protein  42.14 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0211  DegV family protein  39.79 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.187112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0716  degV family protein  42.14 
 
 		 287 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2918  degV family protein  42.46 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0124  hypothetical protein  39.44 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2679  degV family protein  42.11 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.776437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2629  DegV family protein  42.11 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230947  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2872  degV family protein  42.11 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.428011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2677  degV family protein  42.46 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000367338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2359  degV family protein  42.11 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.823292  normal  0.669443 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2886  degV family protein  41.75 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2602  DegV family protein  42.11 
 
 		 286 aa  205  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00489344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2876  degV family protein  41.75 
 
 		 286 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000561682 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2906  degV family protein  41.75 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00204393  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1743  degV family protein  39.07 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0123277 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06330  degV family protein  36.77 
 
 		 293 aa  201  9e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.139961 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1558  DegV family protein  35.69 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1056  degV family protein  35.17 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.162419  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2746  degV family protein  34.75 
 
 		 281 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000295116  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14080  degV family protein  38.6 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000464693  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2064  hypothetical protein  35.94 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0791292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1901  hypothetical protein  35.89 
 
 		 281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0606  DegV family protein  31.65 
 
 		 295 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1061  degV family protein  33.11 
 
 		 294 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0946944  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1740  degV family protein  34.86 
 
 		 280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16140  hypothetical protein  31.36 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224707 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1346  degV family protein  35.94 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.22835 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2132  degV family protein  32.74 
 
 		 280 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04370  degV family protein  34.15 
 
 		 285 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2314  degV family protein  32.63 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00036475  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3733  degV family protein  35.61 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.131703  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1050  hypothetical protein  30.39 
 
 		 283 aa  155  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1150  degV family protein  34.03 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.444716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1121  degV family protein  30.46 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09150  hypothetical protein  32.41 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000277277  normal  0.476622 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09160  degV family protein  32.53 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.356982  normal  0.378413 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2801  degV family protein  34.15 
 
 		 284 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00587122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3318  degV family protein  32.06 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0982  degV family protein  31.72 
 
 		 342 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4890  degV family protein  34.52 
 
 		 280 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5316  degV family protein  34.16 
 
 		 280 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5642  degV family protein  34.16 
 
 		 280 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.121288  hitchhiker  0.00000000000040368 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5045  degV family protein  34.16 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4875  degV family protein  34.16 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5430  degV family protein  34.16 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5304  degV family protein  34.16 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5362  degV family protein  34.16 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4990  degV family protein  33.1 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1500  hypothetical protein  31.23 
 
 		 281 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.886569  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5286  degV family protein  33.81 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000358242 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0022  degV family protein  33.21 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.314645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3042  degV family protein  31.82 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00021741  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1048  DegV  30.28 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.925497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1265  degV family protein  28.42 
 
 		 281 aa  135  8e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1076  degV family protein  30.63 
 
 		 280 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.313955  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17990  degV family protein  31.51 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.980655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0851  degV family protein  26.76 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427219  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1310  degV family protein  31.03 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1514  hypothetical protein  29.82 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14660  degV family protein  31.94 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000206082  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1485  hypothetical protein  29.82 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.417725  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1264  degV family protein  30.42 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1047  DegV  30.77 
 
 		 279 aa  132  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.119875  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0363  degV family protein  32.38 
 
 		 277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.294942  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1587  degV family protein  31.58 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000247514  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0296  degV family protein  29.54 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0262  degV family protein  33.33 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1077  degV family protein  30.28 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.13132  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_116  DegV protein  33.33 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2385  degV family protein  29.54 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000544389  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0301  degV family protein  29.18 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.173313  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1075  degV family protein  29.17 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0973769  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1032  degV family protein  29.62 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.185654  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1307  degV family protein  32.44 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.675608  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1648  degV family protein  29.17 
 
 		 280 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000062676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2228  degV family protein  29.51 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000426041  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0915  degV family protein  29.54 
 
 		 285 aa  125  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0196903  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0903  degV family protein  30.66 
 
 		 282 aa  125  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.964833  normal  0.127362 
 
 
-
 
NC_002936  DET1266  degV family protein  29.54 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_363  DegV  32.01 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000284109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1517  degV family protein  32 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2816  degV family protein  31.8 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126617  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1049  DegV  28.87 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3096  degV family protein  29.51 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  hitchhiker  1.30761e-16 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0399  degV family protein  31.79 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000011327  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0105  degV family protein  32.29 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000465331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0364  degV family protein  28.27 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.924971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1607  degV family protein  27.87 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3239  degV family protein  30.88 
 
 		 281 aa  122  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2031  DegV family protein  28.82 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2029  DegV family protein  28.82 
 
 		 280 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>