More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A2126 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A2126  16S rRNA methyltransferase GidB  100 
 
 
204 aa  422  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0197  16S rRNA methyltransferase GidB  98.04 
 
 
204 aa  414  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2807  16S rRNA methyltransferase GidB  51.67 
 
 
208 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.202155  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4617  16S rRNA methyltransferase GidB  44.17 
 
 
214 aa  189  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3084  glucose inhibited division protein  46.8 
 
 
214 aa  185  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167506  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3315  glucose-inhibited division protein B  43.56 
 
 
210 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.395697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73360  16S rRNA methyltransferase GidB  44.5 
 
 
214 aa  178  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04093  glucose-inhibited division protein B  42.29 
 
 
211 aa  177  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6366  16S rRNA methyltransferase GidB  43 
 
 
214 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4472  methyltransferase GidB  42.44 
 
 
208 aa  173  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  hitchhiker  0.00000000163094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0003  16S rRNA methyltransferase GidB  43.5 
 
 
216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113806  hitchhiker  0.000164452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5305  16S rRNA methyltransferase GidB  43.5 
 
 
216 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0376618 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5441  16S rRNA methyltransferase GidB  43.5 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5131  16S rRNA methyltransferase GidB  41.41 
 
 
214 aa  171  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2879  methyltransferase GidB  43.37 
 
 
220 aa  171  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5210  16S rRNA methyltransferase GidB  43 
 
 
216 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5609  glucose-inhibited division protein B  40.4 
 
 
211 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4104  16S rRNA methyltransferase GidB  45.59 
 
 
205 aa  168  5e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0344821  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52260  16S rRNA methyltransferase GidB  41.5 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2769  16S rRNA methyltransferase GidB  41.55 
 
 
216 aa  165  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.142379  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2949  16S rRNA methyltransferase GidB  45.29 
 
 
208 aa  165  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2803  16S rRNA methyltransferase GidB  45.29 
 
 
208 aa  165  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2176  methyltransferase GidB  39 
 
 
216 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000122528  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3069  16S rRNA methyltransferase GidB  40.29 
 
 
209 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4011  glucose inhibited division protein B  40.2 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.256555 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2754  methyltransferase GidB  43.94 
 
 
205 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  0.648083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3967  16S rRNA methyltransferase GidB  40.4 
 
 
212 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3885  methyltransferase GidB  44.72 
 
 
214 aa  158  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0046  16S rRNA methyltransferase GidB  38.25 
 
 
226 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0027  16S rRNA methyltransferase GidB  38.97 
 
 
226 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.292216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3740  16S rRNA methyltransferase GidB  38.42 
 
 
207 aa  155  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.258045  normal  0.158212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5740  16S rRNA methyltransferase GidB  41.92 
 
 
214 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0209353  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0052  16S rRNA methyltransferase GidB  39.29 
 
 
243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4156  16S rRNA methyltransferase GidB  37.38 
 
 
207 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00135676  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4206  16S rRNA methyltransferase GidB  37.38 
 
 
207 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0819041  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4265  16S rRNA methyltransferase GidB  37.38 
 
 
207 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.286943  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4100  16S rRNA methyltransferase GidB  37.38 
 
 
207 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000205274  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1035  16S rRNA methyltransferase GidB  40.39 
 
 
238 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.943257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  36.14 
 
 
213 aa  153  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0002  glucose-inhibited division protein B  43.94 
 
 
205 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.189717  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4108  16S rRNA methyltransferase GidB  36.23 
 
 
207 aa  153  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000252823  normal  0.110996 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0911  16S rRNA methyltransferase GidB  39.9 
 
 
212 aa  153  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4124  16S rRNA methyltransferase GidB  35.92 
 
 
207 aa  152  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000172745  normal  0.0365925 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03624  glucose-inhibited division protein  36.23 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0012473  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4227  methyltransferase GidB  36.23 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000380789  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4254  16S rRNA methyltransferase GidB  36.23 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0110141  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4181  16S rRNA methyltransferase GidB  36.23 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5176  16S rRNA methyltransferase GidB  36.23 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000263973  normal  0.0413042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3956  16S rRNA methyltransferase GidB  36.23 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03568  hypothetical protein  36.23 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4909  16S rRNA methyltransferase GidB  37.2 
 
 
206 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346301  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3654  16S rRNA methyltransferase GidB  40.1 
 
 
206 aa  152  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.611058  hitchhiker  0.00060095 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03243  16S rRNA methyltransferase GidB  37.93 
 
 
212 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4250  16S rRNA methyltransferase GidB  35.64 
 
 
207 aa  151  7e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4085  16S rRNA methyltransferase GidB  36.89 
 
 
207 aa  151  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0040729  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4249  16S rRNA methyltransferase GidB  35.27 
 
 
206 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3985  methyltransferase GidB  34.95 
 
 
206 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3935  16S rRNA methyltransferase GidB  35.15 
 
 
206 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.387591  hitchhiker  0.000403371 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0111  16S rRNA methyltransferase GidB  41.46 
 
 
228 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0001  16S rRNA methyltransferase GidB  35.15 
 
 
206 aa  148  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.895325  hitchhiker  0.000116578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  38.57 
 
 
228 aa  148  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.978547  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3356  16S rRNA methyltransferase GidB  37.96 
 
 
235 aa  147  7e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3276  16S rRNA methyltransferase GidB  39.71 
 
 
228 aa  147  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2961  16S rRNA methyltransferase GidB  40.98 
 
 
228 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0094  16S rRNA methyltransferase GidB  40.98 
 
 
228 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3762  16S rRNA methyltransferase GidB  34.78 
 
 
208 aa  147  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.247019  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4027  16S rRNA methyltransferase GidB  35.15 
 
 
206 aa  147  9e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.537471  normal  0.874868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3327  16S rRNA methyltransferase GidB  39.81 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0247343  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2518  16S rRNA methyltransferase GidB  39.11 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015126  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3319  16S rRNA methyltransferase GidB  39.61 
 
 
231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0029  16S rRNA methyltransferase GidB  40.09 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0064  16S rRNA methyltransferase GidB  39.23 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.75809 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4496  16S rRNA methyltransferase GidB  33.99 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.227983  hitchhiker  0.00000107328 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4185  methyltransferase GidB  34.78 
 
 
206 aa  145  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4197  16S rRNA methyltransferase GidB  39.13 
 
 
218 aa  145  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000264563 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00432  16S rRNA methyltransferase GidB  37.88 
 
 
211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0085  16S rRNA methyltransferase GidB  38.76 
 
 
228 aa  144  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.446759  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0095  16S rRNA methyltransferase GidB  38.76 
 
 
228 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4539  16S rRNA methyltransferase GidB  34.95 
 
 
206 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0125661  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4218  16S rRNA methyltransferase GidB  33.5 
 
 
206 aa  144  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00057334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3904  16S rRNA methyltransferase GidB  38.86 
 
 
227 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1704  16S rRNA methyltransferase GidB  37.7 
 
 
212 aa  143  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002020  ribosomal RNA small subunit methyltransferase G  36.87 
 
 
211 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000210084  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4757  16S rRNA methyltransferase GidB  35.64 
 
 
206 aa  142  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4184  16S rRNA methyltransferase GidB  33.5 
 
 
206 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000958004  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4210  16S rRNA methyltransferase GidB  33.5 
 
 
206 aa  142  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00534269  normal  0.148659 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3855  16S rRNA methyltransferase GidB  37.36 
 
 
234 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382464  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3197  16S rRNA methyltransferase GidB  39.81 
 
 
222 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0047  16S rRNA methyltransferase GidB  37.14 
 
 
219 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3522  16S rRNA methyltransferase GidB  39.32 
 
 
222 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4517  16S rRNA methyltransferase GidB  33.17 
 
 
206 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289594 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2336  methyltransferase GidB  38.5 
 
 
217 aa  141  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000208151  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4375  16S rRNA methyltransferase GidB  33.17 
 
 
206 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4320  16S rRNA methyltransferase GidB  33.17 
 
 
206 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000104223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4376  16S rRNA methyltransferase GidB  33.17 
 
 
206 aa  141  8e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000253102  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3038  16S rRNA methyltransferase GidB  38.83 
 
 
225 aa  140  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.631468  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4055  16S rRNA methyltransferase GidB  38.65 
 
 
213 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2945  16S rRNA methyltransferase GidB  38.65 
 
 
213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.373809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3366  16S rRNA methyltransferase GidB  38.65 
 
 
213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3004  16S rRNA methyltransferase GidB  38.65 
 
 
230 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>