More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A1173 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
113 aa  226  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
113 aa  226  1e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  48.21 
 
 
120 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  42.34 
 
 
119 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  45.79 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0449  GntR family transcriptional regulator  47.27 
 
 
119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  46.02 
 
 
166 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  45.13 
 
 
123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0952  GntR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.091739  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
115 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2982  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
118 aa  100  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.583811  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01221  transcriptional regulator GntR family  43.96 
 
 
97 aa  98.2  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  36.61 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
127 aa  87.4  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 
134 aa  86.3  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0486  transcriptional regulator, GntR family  40.38 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2609  transcriptional regulator, GntR family  38.39 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4731  transcriptional regulator, GntR family  37.27 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0188  transcriptional regulator, GntR family  37.38 
 
 
120 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428204  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1559  transcriptional regulator, GntR family  34.82 
 
 
122 aa  80.1  0.000000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39240  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
119 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  34.26 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3323  transcriptional regulator, GntR family  39.58 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  32.14 
 
 
119 aa  76.3  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1337  transcriptional regulator, GntR family  36.9 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2889  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2569  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  41.98 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06980  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
123 aa  66.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0413  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126119  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3976  transcriptional regulator, GntR family protein  32.69 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3352  regulatory protein GntR HTH  30.91 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0676  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 
119 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3779  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3574  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0162  regulatory protein GntR, HTH  36.36 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0077  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0074  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0072  regulatory protein GntR HTH  32.08 
 
 
123 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4277  regulatory protein GntR, HTH  32.08 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0058  regulatory protein GntR, HTH  33.65 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2945  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2634  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
126 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00782758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2324  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.665788  hitchhiker  0.000002965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4189  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
124 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5482  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148324  normal  0.0115562 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2712  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
126 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.902974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0274  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 
141 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2657  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000366094  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0791  putative transcriptional regulator  39.39 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2908  putative transcriptional regulator  29.63 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000437446 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0069  regulatory protein GntR, HTH  28.97 
 
 
129 aa  60.1  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  29.73 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2154  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.75211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  36.11 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0073  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.138424  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  36.36 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2235  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
117 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1478  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0392506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3135  transcriptional regulator GntR  35.71 
 
 
247 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2708  transcriptional regulator  33.73 
 
 
90 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
243 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1515  regulatory protein GntR, HTH  25.66 
 
 
120 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2547  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.136131  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07820  predicted transcriptional regulator  32.35 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2024  regulatory protein GntR HTH  26.79 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1991  regulatory protein GntR, HTH  26.79 
 
 
126 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0793  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 
120 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02090  predicted transcriptional regulator  39.39 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1133  regulatory protein GntR, HTH  34.72 
 
 
122 aa  55.5  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2244  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  36.84 
 
 
239 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  31.53 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2645  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
125 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  28.85 
 
 
126 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>