More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A1146 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
351 aa  704  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  99.15 
 
 
351 aa  697  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  35.76 
 
 
348 aa  197  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56880  putative membrane fusion protein  33.43 
 
 
376 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4943  RND efflux membrane fusion protein precursor  33.71 
 
 
375 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1209  RND family efflux transporter MFP subunit  34.14 
 
 
381 aa  182  9e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.421019  normal  0.31825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  33.33 
 
 
397 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4492  secretion protein HlyD  36.17 
 
 
382 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0226833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  34.97 
 
 
374 aa  180  3e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  33.33 
 
 
403 aa  179  5e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1288  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 
365 aa  179  6e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  32.4 
 
 
397 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  33.65 
 
 
365 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1201  RND family efflux transporter MFP subunit  33.65 
 
 
365 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0341767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0078  RND family efflux transporter MFP subunit  33.65 
 
 
365 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1044  RND family efflux transporter MFP subunit  33.65 
 
 
365 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  33.65 
 
 
365 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  33.33 
 
 
403 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1580  RND family efflux transporter MFP subunit  33.65 
 
 
365 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610408  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1496  RND family efflux transporter MFP subunit  33.65 
 
 
365 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1194  acriflavin resistance periplasmic protein  31.05 
 
 
380 aa  176  8e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  32.26 
 
 
390 aa  175  1e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.39 
 
 
362 aa  173  4e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  33.33 
 
 
397 aa  172  6e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
397 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  32.13 
 
 
340 aa  170  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0907  RND efflux membrane fusion protein-related protein  34.08 
 
 
406 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.86 
 
 
368 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0946  RND family efflux transporter MFP subunit  33.8 
 
 
382 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  32.29 
 
 
467 aa  167  3e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0975  RND family efflux transporter MFP subunit  33.7 
 
 
382 aa  167  3e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0109715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0892  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.99 
 
 
370 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2846  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  30.47 
 
 
396 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  31.36 
 
 
360 aa  166  6e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.94 
 
 
388 aa  165  1e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  31.4 
 
 
376 aa  164  2e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  34.67 
 
 
373 aa  163  4e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  32.46 
 
 
372 aa  162  8e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00481  hypothetical protein  31.21 
 
 
368 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0358  RND family efflux transporter MFP subunit  30.85 
 
 
372 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  32.32 
 
 
434 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0776882  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  29.87 
 
 
360 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  30.29 
 
 
365 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  32.44 
 
 
369 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  9.84298e-06  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.44 
 
 
369 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  1.18856e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  30.38 
 
 
372 aa  159  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  32.48 
 
 
376 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.99 
 
 
380 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.33 
 
 
363 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.33 
 
 
363 aa  158  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  1.5248e-07 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 
369 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.21535e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0200  secretion protein HlyD  30.64 
 
 
365 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  29.46 
 
 
372 aa  156  5e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0650  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.19 
 
 
410 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  29.15 
 
 
366 aa  156  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0627  RND family efflux transporter MFP subunit  29.19 
 
 
405 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 
369 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.22351e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3255  RND family efflux transporter MFP subunit  30.06 
 
 
388 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  29.36 
 
 
373 aa  155  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0703  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.3 
 
 
355 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0779  RND family efflux transporter MFP subunit  31.29 
 
 
415 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.521132  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3735  RND family efflux transporter MFP subunit  28.9 
 
 
410 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  31.23 
 
 
368 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1906  HlyD family-like protein  30.88 
 
 
361 aa  154  3e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000977353  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0654  RND family efflux transporter MFP subunit  28.9 
 
 
410 aa  154  3e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  31.94 
 
 
368 aa  154  3e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.55433e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  30.62 
 
 
372 aa  154  3e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.77 
 
 
372 aa  154  3e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  30.57 
 
 
417 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  31.23 
 
 
366 aa  153  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4015  hypothetical protein  28.9 
 
 
435 aa  153  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  30.92 
 
 
385 aa  152  6e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.32808e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  30.33 
 
 
353 aa  152  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  29.48 
 
 
349 aa  152  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1989  RND family efflux transporter MFP subunit  31.56 
 
 
379 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0266  RND family efflux transporter MFP subunit  29.39 
 
 
375 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  30.23 
 
 
381 aa  151  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  29.14 
 
 
372 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3889  RND family efflux transporter MFP subunit  29.44 
 
 
364 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  32.07 
 
 
361 aa  150  3e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  2.48395e-06  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  32.39 
 
 
377 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  31.89 
 
 
367 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004022  membrane-fusion protein  33.33 
 
 
369 aa  149  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.60707e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1156  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 
370 aa  149  1e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  3.11518e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  30.55 
 
 
360 aa  147  2e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  1.90652e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 
361 aa  147  2e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1658  RND family efflux transporter MFP subunit  29.91 
 
 
360 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000232607  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  31.62 
 
 
354 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  29.91 
 
 
360 aa  146  4e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00136978  hitchhiker  1.41161e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  32.44 
 
 
372 aa  147  4e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2588  RND family efflux transporter MFP subunit  29 
 
 
360 aa  147  4e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  7.07575e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2410  RND family efflux transporter MFP subunit  29.91 
 
 
360 aa  146  4e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000315716  hitchhiker  0.00636413 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.38 
 
 
370 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09530  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.37 
 
 
370 aa  145  7e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3927  RND family efflux transporter MFP subunit  31.49 
 
 
392 aa  146  7e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1030  RND family efflux transporter MFP subunit  31.07 
 
 
365 aa  145  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  1.01532e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1881  HlyD family-like protein  29.91 
 
 
360 aa  145  9e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  30.08 
 
 
372 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.44 
 
 
352 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0091  RND family efflux transporter MFP subunit  31.69 
 
 
394 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.666427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>