26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM01800 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006682  CNM01800  cytoplasm protein, putative  100 
 
 
480 aa  993    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389549  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  38.79 
 
 
515 aa  301  2e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50504  predicted protein  56.76 
 
 
438 aa  255  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0295961 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01996  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10390)  33.42 
 
 
655 aa  195  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385246  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65824  nuclear division protein  28.6 
 
 
611 aa  194  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.360229 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02410  cytoplasm protein, putative  37.55 
 
 
636 aa  166  8e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0757  hypothetical protein  36.41 
 
 
264 aa  147  3e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4205  hypothetical protein  38.68 
 
 
266 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02721  hypothetical protein  37.69 
 
 
260 aa  128  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02180  cytoplasm protein, putative  30.47 
 
 
485 aa  120  7e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0121  hypothetical protein  31.36 
 
 
268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0107  hypothetical protein  31.36 
 
 
268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04875  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11210)  28.86 
 
 
421 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.11498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0757  hypothetical protein  30.34 
 
 
268 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.186442 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  26.13 
 
 
254 aa  87.4  6e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  27.7 
 
 
271 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  25.23 
 
 
267 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  24.77 
 
 
266 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  25.66 
 
 
274 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1728  protein of unknown function DUF155  26.26 
 
 
263 aa  58.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00082913  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  25.23 
 
 
262 aa  57.4  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40884  predicted protein  22.37 
 
 
288 aa  52  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00671341  normal  0.871752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2558  hypothetical protein  21.74 
 
 
271 aa  50.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  22.69 
 
 
278 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0224  hypothetical protein  25.98 
 
 
269 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0720  hypothetical protein  25.56 
 
 
259 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000252618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>