243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL05890 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  1015    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  32.48 
 
 
457 aa  210  6e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  31.16 
 
 
459 aa  187  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  29.27 
 
 
454 aa  186  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  30.82 
 
 
465 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  31.99 
 
 
449 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  31.57 
 
 
447 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  27.1 
 
 
457 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  28.36 
 
 
492 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  29.45 
 
 
450 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  29.45 
 
 
450 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  28.21 
 
 
456 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  28.22 
 
 
499 aa  153  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  31.14 
 
 
454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  28.3 
 
 
469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  27.81 
 
 
459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  29.55 
 
 
446 aa  145  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  28.12 
 
 
463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  29.3 
 
 
484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  27.73 
 
 
456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  28.69 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  27.75 
 
 
452 aa  137  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  25.76 
 
 
487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  28.6 
 
 
498 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  28.6 
 
 
498 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  28.16 
 
 
498 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  26.81 
 
 
445 aa  127  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  28.6 
 
 
463 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  26.88 
 
 
462 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  27.46 
 
 
492 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  27.62 
 
 
490 aa  123  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  25.15 
 
 
510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  28.18 
 
 
532 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  27.65 
 
 
493 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  27.04 
 
 
578 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  27.44 
 
 
493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  27.44 
 
 
493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  26.83 
 
 
494 aa  117  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  26.9 
 
 
444 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  25.83 
 
 
494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  25.88 
 
 
493 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  24.49 
 
 
464 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  23.84 
 
 
510 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  25.34 
 
 
512 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  25.15 
 
 
495 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  25.81 
 
 
458 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  25.46 
 
 
496 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  25.9 
 
 
492 aa  93.6  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  24.02 
 
 
459 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  23.97 
 
 
431 aa  90.5  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  23.89 
 
 
495 aa  86.7  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  23.58 
 
 
495 aa  84  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  22.55 
 
 
427 aa  79  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  28.28 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  25.47 
 
 
435 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  22.13 
 
 
479 aa  77  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  22.38 
 
 
592 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  24.63 
 
 
469 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  21.7 
 
 
496 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  21.7 
 
 
496 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  27.05 
 
 
352 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  25.98 
 
 
445 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.29 
 
 
478 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.29 
 
 
478 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  21.1 
 
 
619 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  24.64 
 
 
470 aa  71.6  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  21.75 
 
 
625 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  24.49 
 
 
465 aa  70.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  21.25 
 
 
619 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  22.34 
 
 
478 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  25.96 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  22.73 
 
 
565 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  21.67 
 
 
616 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  21.46 
 
 
436 aa  67  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  25.63 
 
 
492 aa  66.6  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  21.41 
 
 
628 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  21.93 
 
 
624 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  42.31 
 
 
396 aa  65.1  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  33.1 
 
 
529 aa  64.3  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  22.65 
 
 
478 aa  63.9  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  21.63 
 
 
478 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  22.89 
 
 
482 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2975  amine oxidase  22.88 
 
 
480 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  21.68 
 
 
478 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  32.8 
 
 
537 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  21.43 
 
 
478 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  21.43 
 
 
478 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  24.62 
 
 
353 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  20.4 
 
 
482 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  26.92 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  37.96 
 
 
543 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  41.77 
 
 
547 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  42.68 
 
 
367 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  20.62 
 
 
445 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  20.12 
 
 
485 aa  57.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  21.44 
 
 
478 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  40.43 
 
 
537 aa  57.4  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1467  amine oxidase  24.9 
 
 
463 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  67.5 
 
 
557 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>