More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL03960 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL03960  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  520  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.139278  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86991  60S large subunit ribosomal protein L2B  73.6 
 
 		 254 aa  363  1e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.32837 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28309  60S large subunit ribosomal protein L2A  73.6 
 
 		 254 aa  363  1e-99  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.24055 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02275  hypothetical protein similar to 60S ribosomal protein L2 (Broad)  67.2 
 
 		 254 aa  346  2e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31116  Ribosomal protein L8, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  63.92 
 
 		 255 aa  333  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28234  predicted protein  63.2 
 
 		 257 aa  326  3e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.638688  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0030  50S ribosomal protein L2P  47.13 
 
 		 240 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.291148  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0107  50S ribosomal protein L2P  46.53 
 
 		 238 aa  216  4e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0794  50S ribosomal protein L2P  46.31 
 
 		 240 aa  215  7e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.097706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1124  50S ribosomal protein L2P  45.9 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0860  50S ribosomal protein L2P  45.08 
 
 		 240 aa  211  7e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.480475  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0804  50S ribosomal protein L2P  47.35 
 
 		 240 aa  208  5e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.712432  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0213  ribosomal protein L2  46.72 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0004  50S ribosomal protein L2P  44.81 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000454303  n/a   
 
 
 
NC_013743  Htur_2221  ribosomal protein L2  46.05 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1775  ribosomal protein L2  46.28 
 
 		 238 aa  196  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2446  50S ribosomal protein L2P  45.18 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1725  50S ribosomal protein L2P  42.15 
 
 		 236 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0310662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2295  50S ribosomal protein L2P  45.18 
 
 		 242 aa  193  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0084  50S ribosomal protein L2P  44.94 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.33391 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1831  50S ribosomal protein L2P  44.3 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0227  50S ribosomal protein L2P  45.38 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1518  ribosomal protein L2  44.77 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.90355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0018  50S ribosomal protein L2P  45.53 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0052  50S ribosomal protein L2P  45.12 
 
 		 246 aa  186  5e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.946037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0049  50S ribosomal protein L2P  43.67 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0567  50S ribosomal protein L2P  42.62 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0425344  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1094  50S ribosomal protein L2P  43.27 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0535  50S ribosomal protein L2P  40.49 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393685  normal  0.694231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2250  50S ribosomal protein L2P  41.8 
 
 		 236 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000353713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1278  50S ribosomal protein L2P  41.7 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000789854 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0102  50S ribosomal protein L2P  43.9 
 
 		 244 aa  169  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00140338 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0094  50S ribosomal protein L2P  42.34 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000127555  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0445  50S ribosomal protein L2P  43.03 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2165  50S ribosomal protein L2  41.71 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.219576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2443  50S ribosomal protein L2  41.71 
 
 		 278 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2126  50S ribosomal protein L2  41.18 
 
 		 278 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647868 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  37.21 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0350  50S ribosomal protein L2  41.3 
 
 		 278 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.170348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2221  50S ribosomal protein L2  39.57 
 
 		 278 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1911  50S ribosomal protein L2  41.3 
 
 		 278 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00546363  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  40.21 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0598  50S ribosomal protein L2  37.32 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000263643  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  39.04 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  36.28 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3819  50S ribosomal protein L2  37.82 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1367  50S ribosomal protein L2  37.02 
 
 		 277 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.266089  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5067  50S ribosomal protein L2  37.57 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.828543  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1548  50S ribosomal protein L2  37.02 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  36.54 
 
 		 276 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0761  50S ribosomal protein L2  36.54 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000295488  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3998  50S ribosomal protein L2  37.7 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000302361  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  37.7 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  37.7 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  37.7 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0326  50S ribosomal protein L2  37.31 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000291678  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0331  50S ribosomal protein L2  37.31 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  37.31 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3741  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69026  normal  0.0152471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3633  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0350833  normal  0.361481 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3706  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00279259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3633  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000993877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3804  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00899018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4541  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000106039  hitchhiker  0.00201461 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0194  50S ribosomal protein L2  38.17 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.352427 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  36.63 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03168  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00146365  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0396  ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401214  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4640  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0685659  normal  0.0584567 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3511  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3612  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000120655  hitchhiker  0.00428222 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03119  hypothetical protein  37.17 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0062  50S ribosomal protein L2  37.63 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000000394369  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  34.82 
 
 		 277 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 275 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3702  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237187  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3800  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000757775  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  34.82 
 
 		 277 aa  108  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3748  50S ribosomal protein L2  36.65 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000108731  hitchhiker  0.00494792 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0364  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1719  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238282  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3181  50S ribosomal protein L2  36.46 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2531  50S ribosomal protein L2  38.67 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  38.1 
 
 		 275 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  34.38 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  36.08 
 
 		 274 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3445  50S ribosomal protein L2  37.02 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  36.46 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  37.86 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1350  50S ribosomal protein L2  36.36 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  36.23 
 
 		 281 aa  105  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3021  50S ribosomal protein L2  36.51 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0478203  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2685  50S ribosomal protein L2  36.02 
 
 		 279 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00277969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0285  50S ribosomal protein L2  36.46 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  33 
 
 		 274 aa  104  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  37.17 
 
 		 277 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0588  50S ribosomal protein L2  38.12 
 
 		 280 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  36.45 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0252  50S ribosomal protein L2  37.02 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>