More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01090 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK01090  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  100 
 
 
233 aa  472  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.848315  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0749  ABC transporter ATP-binding protein  37.38 
 
 
230 aa  120  1e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_5405  predicted protein  33.03 
 
 
213 aa  111  1e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.347426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  36.71 
 
 
224 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  36.23 
 
 
224 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0551  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  31.33 
 
 
268 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.41658  hitchhiker  1.78063e-20 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1808  ABC transporter related  38.73 
 
 
213 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0422599  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  33.78 
 
 
581 aa  99.8  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2267  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
276 aa  99  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3640  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  36.28 
 
 
279 aa  99  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.720751  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2452  phosphate transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 
272 aa  98.6  7e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.896212  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  33.94 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2322  ABC transporter, ATPase subunit  34.38 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1864  ABC transporter related  32.9 
 
 
242 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00206412  normal  0.0919522 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0260  phosphate transporter ATP-binding protein  34.08 
 
 
273 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.47384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1436  phosphate transporter ATP-binding protein  34.88 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01033  phosphate transporter ATP-binding protein  34.55 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  34.4 
 
 
272 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2582  phosphate transporter ATP-binding protein  35.81 
 
 
272 aa  96.3  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1568  phosphate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
272 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.120557  normal  0.436226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2816  phosphate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
272 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1540  phosphate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
272 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1535  phosphate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
272 aa  95.9  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.172939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3118  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  33.05 
 
 
291 aa  95.5  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0430987  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2558  phosphate transporter ATP-binding protein  34.42 
 
 
272 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.897125  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2625  phosphate transporter ATP-binding protein  34.42 
 
 
272 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0233475  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2732  phosphate transporter ATP-binding protein  34.42 
 
 
272 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0744  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  30.57 
 
 
254 aa  95.1  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.21752e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  32.88 
 
 
249 aa  94.7  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  33.96 
 
 
244 aa  94.7  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2189  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  33.98 
 
 
237 aa  94.4  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1798  ABC transporter related  36.2 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1359  phosphate transporter ATP-binding protein  35.06 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0675287  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1725  phosphate transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1532  phosphate transporter ATP-binding protein  32.9 
 
 
263 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal  0.97409 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3538  phosphate transporter ATP-binding protein  34.2 
 
 
270 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.484334  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1139  phosphate transport system permease protein 1  33.95 
 
 
260 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.89911  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2152  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3166  phosphate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
272 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1074  phosphate transporter ATP-binding protein  32.43 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.566041  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  32.97 
 
 
614 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2320  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
276 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  32.57 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1797  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0098  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1068  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1310  ABC transporter, ATP-binding protein  33.48 
 
 
231 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1436  ABC transporter related  33.33 
 
 
221 aa  93.2  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343902  normal  0.0885291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3626  phosphate transporter ATP-binding protein  30.45 
 
 
295 aa  92.8  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.926867  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1700  phosphate transporter ATP-binding protein  33.76 
 
 
272 aa  92.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2743  phosphate transporter ATP-binding protein  32.47 
 
 
272 aa  92.4  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.306149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1503  phosphate transporter ATP-binding protein  32.47 
 
 
272 aa  92.4  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.529486  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  32.27 
 
 
222 aa  92.4  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1559  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.7 
 
 
251 aa  92.4  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4495  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  31.49 
 
 
301 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  30.34 
 
 
253 aa  92  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3752  phosphate transporter ATP-binding protein  29.33 
 
 
293 aa  92  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1202  ABC transporter related  37.26 
 
 
256 aa  92  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  32.23 
 
 
253 aa  92  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 
249 aa  91.7  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12291  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  31.62 
 
 
246 aa  92  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.782206  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  30.34 
 
 
253 aa  91.7  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1510  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  32.23 
 
 
251 aa  91.7  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  32.08 
 
 
273 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3292  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  32.08 
 
 
273 aa  91.7  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1922  glycine betaine transport ATP-binding protein  31.16 
 
 
252 aa  91.7  9e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0268  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  31.16 
 
 
252 aa  91.7  9e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  34.11 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2023  phosphate transporter ATP-binding protein  32.47 
 
 
263 aa  91.7  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.157085  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1929  phosphate transporter ATP-binding protein  32.37 
 
 
305 aa  91.3  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0381146  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  32.51 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1616  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  31 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  1.91963e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3315  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  29.71 
 
 
290 aa  91.3  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0283925  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0832  ATPase  31.89 
 
 
552 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.423533  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0987  ABC transporter related  32.31 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07290  amino acid ABC transporter, ATP binding component  35.07 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.175528  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1715  phosphate transporter ATP-binding protein  32.47 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.141839  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  30.88 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3967  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0850  ATPase  34.23 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.736744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1498  ABC transporter related  35.05 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0282182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4915  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  33.91 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.508237  normal  0.341234 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  33.87 
 
 
592 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0845  ABC transporter, ATP-binding protein  30.45 
 
 
340 aa  90.9  2e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.210193  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  30.22 
 
 
218 aa  90.9  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.02 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1410  phosphate transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
272 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.261593  normal  0.0224304 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14241  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  37.16 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  32.72 
 
 
267 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0982  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  32.76 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0534146 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  30 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3539  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydD  31.39 
 
 
582 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  32.72 
 
 
220 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.02 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2258  ABC transporter related  33.81 
 
 
286 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21556  normal  0.633697 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  32.72 
 
 
220 aa  90.9  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2480  phosphate transporter ATP-binding protein  32.29 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  33.03 
 
 
253 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5947  ABC transporter related  31.28 
 
 
254 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0218631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>