205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH01780 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  100 
 
 		 2245 aa  4621    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  35.57 
 
 		 1999 aa  458  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  32.59 
 
 		 1189 aa  256  4.0000000000000004e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  32.07 
 
 		 795 aa  253  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  33.92 
 
 		 1077 aa  216  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  39.31 
 
 		 479 aa  216  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  34.64 
 
 		 1090 aa  214  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  31.97 
 
 		 797 aa  197  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  31.47 
 
 		 636 aa  195  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  31.35 
 
 		 754 aa  192  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  31.17 
 
 		 635 aa  191  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  31 
 
 		 636 aa  189  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  32.09 
 
 		 466 aa  188  8e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  31.01 
 
 		 655 aa  187  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  31.92 
 
 		 609 aa  187  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  30.61 
 
 		 632 aa  182  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  30 
 
 		 650 aa  174  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  29.58 
 
 		 650 aa  170  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  28.74 
 
 		 952 aa  168  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  31.78 
 
 		 622 aa  168  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  38.31 
 
 		 315 aa  167  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  31.7 
 
 		 622 aa  165  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  30.63 
 
 		 619 aa  163  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  29.93 
 
 		 716 aa  163  3e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  27.99 
 
 		 633 aa  161  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  29.58 
 
 		 611 aa  159  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  27.71 
 
 		 633 aa  160  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  29.3 
 
 		 643 aa  160  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  39.78 
 
 		 268 aa  159  6e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  35.14 
 
 		 388 aa  154  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  26.79 
 
 		 633 aa  154  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  26.38 
 
 		 748 aa  153  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  30.38 
 
 		 464 aa  153  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  29.28 
 
 		 686 aa  150  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  28.9 
 
 		 651 aa  150  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  28.6 
 
 		 633 aa  150  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  29.12 
 
 		 553 aa  149  8.000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  29.12 
 
 		 553 aa  149  8.000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  27.85 
 
 		 715 aa  144  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  27.31 
 
 		 1099 aa  132  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  26.77 
 
 		 1651 aa  124  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  28.57 
 
 		 1048 aa  120  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  32.36 
 
 		 902 aa  115  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  25.18 
 
 		 1585 aa  111  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  25.59 
 
 		 629 aa  111  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  32.01 
 
 		 934 aa  111  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  25.18 
 
 		 1585 aa  111  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  30.06 
 
 		 1097 aa  108  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  30.82 
 
 		 986 aa  103  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  29 
 
 		 1038 aa  102  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  32.01 
 
 		 752 aa  101  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  29.54 
 
 		 902 aa  100  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  29.47 
 
 		 1620 aa  99.4  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  29.93 
 
 		 521 aa  99.4  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  27.5 
 
 		 1108 aa  95.9  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33296  predicted protein  30.04 
 
 		 634 aa  94  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  27.72 
 
 		 486 aa  92  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  28.74 
 
 		 1653 aa  91.3  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  26.48 
 
 		 1427 aa  91.7  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  23.96 
 
 		 769 aa  90.9  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  29.45 
 
 		 941 aa  90.1  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  25.75 
 
 		 2310 aa  89.7  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  30.96 
 
 		 901 aa  90.1  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  28.19 
 
 		 944 aa  89.4  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  30.45 
 
 		 585 aa  88.6  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1018 aa  87.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  24.29 
 
 		 759 aa  87.4  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  24.58 
 
 		 759 aa  87.4  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  29.1 
 
 		 1284 aa  86.3  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  23.75 
 
 		 769 aa  86.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  23.75 
 
 		 759 aa  86.3  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  23.92 
 
 		 759 aa  85.5  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  24.25 
 
 		 759 aa  85.9  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  24.08 
 
 		 759 aa  84.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  24.08 
 
 		 759 aa  84.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  24.08 
 
 		 759 aa  85.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  28.9 
 
 		 297 aa  82.8  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  24.21 
 
 		 759 aa  82  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  27.14 
 
 		 283 aa  82  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  29.67 
 
 		 1190 aa  81.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  30.42 
 
 		 606 aa  81.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  23.87 
 
 		 905 aa  80.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  26.98 
 
 		 1126 aa  80.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  30.22 
 
 		 219 aa  80.1  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  23.87 
 
 		 905 aa  80.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  26.74 
 
 		 907 aa  79.7  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  27.7 
 
 		 1041 aa  79.3  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  26.37 
 
 		 900 aa  79  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.33 
 
 		 1196 aa  78.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07014  DEAD helicases superfamily protein (Aquarius), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G04350)  27.92 
 
 		 1422 aa  78.2  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  25.53 
 
 		 1228 aa  77.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  26.05 
 
 		 905 aa  76.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  30.84 
 
 		 237 aa  75.5  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  25.72 
 
 		 905 aa  75.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  25.97 
 
 		 1139 aa  75.5  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  25.4 
 
 		 905 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  29.1 
 
 		 1198 aa  75.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.27 
 
 		 1324 aa  73.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.77 
 
 		 1203 aa  73.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  25.94 
 
 		 1270 aa  73.6  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>