18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG01760 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG01760  hypothetical protein  100 
 
 
469 aa  962    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.610994  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05580  hypothetical protein  47.53 
 
 
309 aa  147  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2170  hypothetical protein  29.3 
 
 
155 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000841913  hitchhiker  0.00518945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3206  hypothetical protein  26.99 
 
 
152 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.053039 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7190  hypothetical protein  29.27 
 
 
150 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60706  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2022  hypothetical protein  28.21 
 
 
152 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2571  hypothetical protein  29.19 
 
 
152 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00137712  unclonable  0.0000000326154 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3949  hypothetical protein  34.02 
 
 
153 aa  55.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2639  hypothetical protein  27.39 
 
 
154 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0562456  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0504  hypothetical protein  34.34 
 
 
151 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0184  hypothetical protein  26.35 
 
 
150 aa  50.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.22231  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0263  hypothetical protein  34.95 
 
 
158 aa  50.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0324257 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0532  hypothetical protein  27.33 
 
 
155 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.790547 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0593  hypothetical protein  26.47 
 
 
153 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00333094  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1392  glutaredoxin  33.33 
 
 
263 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5841  hypothetical protein  29.17 
 
 
150 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4355  hypothetical protein  24.53 
 
 
151 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4488  hypothetical protein  24.53 
 
 
151 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000653372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>