More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG00130 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006692  CNG00130  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  100 
 
 
561 aa  1167    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45662  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  38.45 
 
 
510 aa  347  4e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70077  Phosphomethylpyrimidine kinase THI21 (HMP-phosphate kinase) (HMP-P kinase)  31.9 
 
 
583 aa  239  9e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.583202  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  30.35 
 
 
518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  39.23 
 
 
268 aa  188  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  38.46 
 
 
271 aa  187  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  30.5 
 
 
518 aa  187  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  31.51 
 
 
494 aa  186  8e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  30.32 
 
 
531 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  36.81 
 
 
263 aa  177  3e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  38.54 
 
 
268 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  37.58 
 
 
265 aa  177  6e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  38.02 
 
 
266 aa  176  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  38.54 
 
 
268 aa  176  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  37.9 
 
 
270 aa  174  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  37.13 
 
 
260 aa  171  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06842  transcriptional regulator  39.9 
 
 
222 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  31.18 
 
 
499 aa  172  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  38.26 
 
 
264 aa  172  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0151  transcriptional activator, TenA family  40.36 
 
 
236 aa  171  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  37.42 
 
 
264 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000867  thiaminase II  39.9 
 
 
220 aa  167  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  35.78 
 
 
266 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0490  putative thiaminase (transcriptional activator TenA)  38.89 
 
 
220 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  40.87 
 
 
271 aa  164  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  35.87 
 
 
269 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  38.19 
 
 
262 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  36.45 
 
 
271 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  35.78 
 
 
288 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2374  transcriptional activator  39.42 
 
 
226 aa  164  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0840  phosphomethylpyrimidine kinase  36.89 
 
 
265 aa  163  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4540  phosphomethylpyrimidine kinase  36.18 
 
 
270 aa  163  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.48056 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0791  phosphomethylpyrimidine kinase  36.18 
 
 
270 aa  163  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0565  phosphomethylpyrimidine kinase  37.2 
 
 
264 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00127347  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0452  phosphomethylpyrimidine kinase  35.83 
 
 
436 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.70912 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2025  TenA family transcription regulator  37.98 
 
 
232 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0804  phosphomethylpyrimidine kinase  36.7 
 
 
270 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.088589  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  35.18 
 
 
270 aa  162  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  35.18 
 
 
270 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  35.29 
 
 
260 aa  161  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  35.18 
 
 
270 aa  161  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0888  phosphomethylpyrimidine kinase  36.07 
 
 
270 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
265 aa  160  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0700  phosphomethylpyrimidine kinase  36.07 
 
 
270 aa  160  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0644  phosphomethylpyrimidine kinase  36.07 
 
 
270 aa  160  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0734  phosphomethylpyrimidine kinase  36.07 
 
 
270 aa  160  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24669  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0811  phosphomethylpyrimidine kinase  36.07 
 
 
270 aa  160  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46467e-47 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1692  phosphomethylpyrimidine kinase  38.14 
 
 
283 aa  160  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0788599  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  39.3 
 
 
490 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0644  phosphomethylpyrimidine kinase  36.07 
 
 
270 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  37.04 
 
 
267 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  36.31 
 
 
269 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0621  phosphomethylpyrimidine kinase  36.52 
 
 
270 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0650  phosphomethylpyrimidine kinase  36.7 
 
 
273 aa  158  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.797575  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
288 aa  158  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
288 aa  158  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2046  phosphomethylpyrimidine kinase  38.31 
 
 
266 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0486  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  36.05 
 
 
277 aa  157  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  36.54 
 
 
267 aa  157  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  33.66 
 
 
279 aa  157  7e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  34.3 
 
 
264 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  35.56 
 
 
268 aa  154  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  34.5 
 
 
285 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  33.55 
 
 
272 aa  154  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1583  phosphomethylpyrimidine kinase  36.1 
 
 
264 aa  154  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.152097  normal  0.0340338 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  33.55 
 
 
270 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  34.52 
 
 
257 aa  154  5.9999999999999996e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2294  phosphomethylpyrimidine kinase  37.54 
 
 
269 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  34.5 
 
 
268 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  40.85 
 
 
264 aa  153  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  33.65 
 
 
270 aa  153  8.999999999999999e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  36.01 
 
 
269 aa  153  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  34.49 
 
 
267 aa  153  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  33.98 
 
 
264 aa  153  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0406  transcriptional activator, TenA family  38.76 
 
 
234 aa  152  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.23459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0908  transcriptional activator  39.72 
 
 
232 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156653  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1938  phosphomethylpyrimidine kinase  35.15 
 
 
267 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0695148  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  33.86 
 
 
270 aa  151  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  36.31 
 
 
266 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  36.31 
 
 
266 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  36.31 
 
 
266 aa  150  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  36.31 
 
 
266 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  36.31 
 
 
266 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  36.31 
 
 
266 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0192  phosphomethylpyrimidine kinase  34.41 
 
 
269 aa  150  5e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  39.76 
 
 
479 aa  150  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  35.14 
 
 
267 aa  150  5e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  36.31 
 
 
266 aa  150  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  33.96 
 
 
297 aa  149  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  35.99 
 
 
266 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  37.01 
 
 
266 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1700  phosphomethylpyrimidine kinase  33.55 
 
 
273 aa  149  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.847021  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0212  transcriptional regulator TenA, putative  37.29 
 
 
232 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  35.99 
 
 
266 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0203  putative transcriptional regulator TenA  37.29 
 
 
232 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2677  TenA family transcription regulator  37.68 
 
 
219 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  37.38 
 
 
497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  38.06 
 
 
497 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0279  TenA family transcription regulator  37.77 
 
 
231 aa  148  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  36.45 
 
 
267 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>