53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03140 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_02670  conserved hypothetical protein  34.69 
 
 
1530 aa  764    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10649  conserved hypothetical protein  35.32 
 
 
1562 aa  781    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  unclonable  0.000556846  hitchhiker  0.00000000000679283 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03140  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  100 
 
 
1484 aa  3087    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00376  conserved hypothetical protein  31.7 
 
 
1376 aa  465  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.624297  normal  0.25549 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04160  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  30.46 
 
 
1414 aa  452  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0468988  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05470  conserved hypothetical protein  46.74 
 
 
608 aa  449  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.339173 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02714  conserved hypothetical protein  32.92 
 
 
944 aa  440  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.29896 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05254  hypothetical protein  52.06 
 
 
1010 aa  412  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10846  conserved hypothetical protein  31.08 
 
 
1307 aa  392  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342615  normal  0.0851199 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10256  conserved hypothetical protein  30.98 
 
 
1311 aa  379  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.16762  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08576  conserved hypothetical protein  27.41 
 
 
1451 aa  333  2e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000167609 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05253  conserved hypothetical protein  44.14 
 
 
568 aa  311  6.999999999999999e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0683124  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07845  conserved hypothetical protein  36.19 
 
 
533 aa  290  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413766  normal  0.0853676 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06968  conserved hypothetical protein  30.29 
 
 
722 aa  231  7e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.991348  normal  0.860423 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06966  conserved hypothetical protein  41.82 
 
 
356 aa  223  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.912995 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02713  conserved hypothetical protein  40.9 
 
 
345 aa  220  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.232747  normal  0.445875 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03471  conserved hypothetical protein  40.6 
 
 
345 aa  217  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05471  conserved hypothetical protein  37.97 
 
 
276 aa  184  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.507919  normal  0.280227 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05095  conserved hypothetical protein  38.05 
 
 
221 aa  145  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0925556  unclonable  7.92157e-19 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10632  conserved hypothetical protein  44.63 
 
 
356 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0128758  unclonable  9.48563e-19 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03500  conserved hypothetical protein  26.17 
 
 
560 aa  105  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385524  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07831  conserved hypothetical protein  43.79 
 
 
180 aa  105  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000784855  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05066  conserved hypothetical protein  36.56 
 
 
245 aa  100  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000000430279 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02616  conserved hypothetical protein  28.52 
 
 
768 aa  100  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00994417 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08305  conserved hypothetical protein  37.1 
 
 
207 aa  97.8  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000000634064  normal  0.0127721 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05065  conserved hypothetical protein  47.47 
 
 
109 aa  98.2  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000661141 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07846  conserved hypothetical protein  43.36 
 
 
198 aa  95.5  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.105225 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08295  conserved hypothetical protein  36.05 
 
 
250 aa  81.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000017057  unclonable  0.00000277069 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00536  conserved hypothetical protein  54.84 
 
 
86 aa  79  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03540  hypothetical protein  25 
 
 
329 aa  57.8  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.321774  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06967  conserved hypothetical protein  56.1 
 
 
50 aa  53.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.960671 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  27.47 
 
 
290 aa  52.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  27.47 
 
 
290 aa  52.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  25.75 
 
 
276 aa  49.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  28.98 
 
 
290 aa  47  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.402881 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05064  conserved hypothetical protein  24.81 
 
 
289 aa  47  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000000234416 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1693  integrase catalytic subunit  30.68 
 
 
167 aa  46.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.271458  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05094  conserved hypothetical protein  25.31 
 
 
220 aa  45.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00194642  unclonable  9.39036e-19 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  30 
 
 
307 aa  45.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  25.95 
 
 
372 aa  45.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  25.95 
 
 
372 aa  45.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  25.95 
 
 
372 aa  45.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  25.95 
 
 
372 aa  45.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  25.95 
 
 
372 aa  45.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  25.95 
 
 
372 aa  45.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  25.95 
 
 
372 aa  45.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  25.95 
 
 
372 aa  45.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  25.95 
 
 
372 aa  45.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  25.95 
 
 
372 aa  45.4  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  30.53 
 
 
309 aa  45.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  30.53 
 
 
309 aa  45.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  30.53 
 
 
309 aa  45.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.326011 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07830  conserved hypothetical protein  25.31 
 
 
377 aa  45.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00147496  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>