123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF02960 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF02960  conserved hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  518  1e-146  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.392793  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03640  membrane protein, putative  59.19 
 
 
283 aa  270  2e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0291661  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02140  conserved hypothetical protein  53.15 
 
 
281 aa  247  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31420  predicted protein  48.37 
 
 
258 aa  171  9e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.450745  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83722  Accumulation of DYads  44.55 
 
 
274 aa  156  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05226  Acetate permeasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2K4]  47.06 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.719404  normal  0.707615 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35800  predicted protein  42.71 
 
 
264 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38314  putative transporter  39.27 
 
 
270 aa  140  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.801192  normal  0.297491 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35799  predicted protein  39.27 
 
 
272 aa  139  4.999999999999999e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0356533  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01839  conserved hypothetical protein  33.57 
 
 
293 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.009571  normal  0.645979 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31253  predicted protein  39.06 
 
 
266 aa  135  5e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33707  predicted protein  33.64 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.373247  hitchhiker  0.000185367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  44.15 
 
 
197 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07317  conserved hypothetical protein  36.53 
 
 
221 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0696491  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0724  GPR1/FUN34/yaaH  42.25 
 
 
214 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0605  GPR1/FUN34/yaaH family protein  42.39 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0492  GPR1/FUN34/yaaH family protein  43.24 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4506  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.67 
 
 
202 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40.64 
 
 
214 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40.64 
 
 
214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.954499  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0065  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.3 
 
 
196 aa  117  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1305  GPR1/FUN34/yaaH family protein  43.09 
 
 
200 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  43.27 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1126  GPR1/FUN34/yaaH  41.38 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3478  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.36 
 
 
195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0263  GPR1/FUN34/yaaH family protein  42.02 
 
 
199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2192  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.89 
 
 
201 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032608 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1327  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.49 
 
 
197 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.39924  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  37.89 
 
 
188 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1067  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40.86 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00312411  normal  0.445935 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1352  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.9 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000041614  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0666  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.48 
 
 
186 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0435275  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1480  permease  41.62 
 
 
189 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0634  GPR1/FUN34/yaaH  39.7 
 
 
198 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0870411  normal  0.0467455 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  37.63 
 
 
188 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.63 
 
 
188 aa  107  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  37.63 
 
 
188 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  39.89 
 
 
203 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  37.63 
 
 
188 aa  107  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  37.63 
 
 
188 aa  107  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  39.89 
 
 
203 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  39.89 
 
 
203 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  37.63 
 
 
188 aa  107  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1124  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.13 
 
 
196 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.546055 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  37.63 
 
 
188 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1224  transcriptional regulator  43.62 
 
 
200 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1348  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.78 
 
 
197 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00408603 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1287  GPR1/FUN34/yaaH family protein  42.7 
 
 
255 aa  106  4e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00383069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  37.11 
 
 
188 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  36.65 
 
 
188 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.13 
 
 
183 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  36.32 
 
 
188 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  36.32 
 
 
188 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  36.32 
 
 
188 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  36.32 
 
 
188 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1410  hypothetical protein  40 
 
 
204 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0010  hypothetical protein  37.11 
 
 
188 aa  105  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1357  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.34 
 
 
194 aa  103  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55658  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  37.77 
 
 
190 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  36.7 
 
 
190 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0029  GPR1/FUN34/yaaH family protein  42.08 
 
 
223 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2076  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.77 
 
 
183 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0552  hypothetical protein  39.27 
 
 
194 aa  101  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.85069e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3588  gpr1/fun34/yaaH family protein  40.31 
 
 
189 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3630  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.34 
 
 
209 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1075  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.06 
 
 
187 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  38.3 
 
 
197 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0755  GPR1/FUN34/yaaH  40.32 
 
 
190 aa  100  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.830173  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3002  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40.31 
 
 
189 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  0.240175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3180  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.79 
 
 
189 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0999  hypothetical protein  39.27 
 
 
203 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1861  hypothetical protein  38.62 
 
 
211 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0524  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.09 
 
 
196 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0691  hypothetical protein  37.04 
 
 
199 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.003925  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5595  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.5 
 
 
201 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626541  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3083  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.79 
 
 
189 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0605595  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1108  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.54 
 
 
187 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00215615 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1050  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.22 
 
 
203 aa  99.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  36.41 
 
 
191 aa  99  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0904  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.7 
 
 
188 aa  98.6  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.02 
 
 
187 aa  98.6  9e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.264314  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2982  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.25 
 
 
186 aa  98.2  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119024  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  35.98 
 
 
191 aa  98.2  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.74 
 
 
199 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  38.3 
 
 
196 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  37.77 
 
 
197 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2772  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.51 
 
 
213 aa  96.7  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.713345  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  37.97 
 
 
183 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1253  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.47 
 
 
194 aa  89.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284277  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1320  membrane protein  36.11 
 
 
183 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0364  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.16 
 
 
186 aa  87.4  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0228  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.57 
 
 
209 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2835  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.62 
 
 
193 aa  85.5  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.244228  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1006  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.54 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0753776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0212  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.57 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0761648 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3283  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.54 
 
 
187 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0944573 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7849  predicted protein  31.35 
 
 
191 aa  79  0.00000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.161215 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2423  GPR1/FUN34/yaaH family protein  31.79 
 
 
194 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0695  gpr1/fun34/YaaH family protein  37.57 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1065  putative regulatory protein  33.51 
 
 
194 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>