More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE03630 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE03630  Signal recognition particle 54 kDa protein, putative  100 
 
 
591 aa  1190    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.641738  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08246  hypothetical protein similar to srpA gene product (Broad)  60 
 
 
542 aa  552  1e-156  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0951188 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73416  Signal recognition particle 54 kDa protein  54.98 
 
 
561 aa  506  9.999999999999999e-143  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0128602 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13417  predicted protein  47.38 
 
 
510 aa  417  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26018  IISP family transporter: Signal recognition particle 54 kDa protein (SRP54)  44.13 
 
 
513 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0369  signal recognition particle protein Srp54  41.43 
 
 
444 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1260  signal recognition particle protein Srp54  38.9 
 
 
450 aa  301  2e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0865  signal recognition particle protein Srp54  39.13 
 
 
450 aa  300  4e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0440978  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0799  signal recognition particle protein Srp54  39.36 
 
 
450 aa  300  6e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1119  signal recognition particle protein Srp54  38.9 
 
 
450 aa  296  5e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.227466  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0502  GTP-binding signal recognition particle  37.81 
 
 
431 aa  291  2e-77  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0747031  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1474  signal recognition particle protein Srp54  39.33 
 
 
446 aa  290  4e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.570422  decreased coverage  0.000118802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0141  signal recognition particle protein Srp54  38.33 
 
 
439 aa  290  7e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0918  signal recognition particle protein Srp54  38.89 
 
 
443 aa  289  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0496  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  40.22 
 
 
464 aa  287  5e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.50914 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1802  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.38 
 
 
464 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1226  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.21 
 
 
468 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1964  signal recognition particle protein Srp54  38.17 
 
 
443 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0025  signal recognition particle protein Srp54  39.13 
 
 
450 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205386  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1757  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  39.47 
 
 
446 aa  283  6.000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.941567  normal  0.290924 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0544  signal recognition particle protein Srp54  38.76 
 
 
440 aa  282  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0717053  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3023  signal recognition particle protein Srp54  38.12 
 
 
437 aa  282  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1261  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.07 
 
 
469 aa  280  5e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1877  signal recognition particle protein Srp54  37.42 
 
 
441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.189511 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0260  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.16 
 
 
463 aa  273  7e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0917  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  37.01 
 
 
449 aa  273  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000000000000145882  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1950  GTP-binding signal recognition particle SRP54 G- domain protein  38.44 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910344  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0531  GTP-binding signal recognition particle  35.33 
 
 
442 aa  249  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0597  GTP-binding signal recognition particle  33.7 
 
 
433 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.000223356  hitchhiker  0.00000371893 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1713  signal recognition particle protein  35.68 
 
 
446 aa  242  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000859311  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1726  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.33 
 
 
431 aa  240  5e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.878395 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1519  GTP-binding signal recognition particle  34.78 
 
 
433 aa  237  4e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.262746  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0296  GTP-binding signal recognition particle  34.78 
 
 
449 aa  236  6e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000583511  normal  0.0555503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2671  signal recognition particle protein  34.22 
 
 
450 aa  234  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000192246  unclonable  0.0000000276763 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2888  signal recognition particle protein  34.11 
 
 
518 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.403346 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0983  signal recognition particle protein  33.89 
 
 
525 aa  233  9e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0432973  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0967  signal recognition particle protein  36.56 
 
 
443 aa  232  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000109658  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  30.6 
 
 
515 aa  228  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1769  GTP-binding signal recognition particle  32.82 
 
 
433 aa  227  4e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.0023858 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.01 
 
 
446 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000241723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2310  signal recognition particle protein  33.11 
 
 
443 aa  226  7e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0985246  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1142  signal recognition particle protein  32.43 
 
 
485 aa  225  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0433759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07290  signal recognition particle protein  33.33 
 
 
444 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.3957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1100  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.68 
 
 
512 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1611  signal recognition particle protein  35.41 
 
 
522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000856469  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1771  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.66 
 
 
496 aa  221  3e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0642  signal recognition particle protein  35.58 
 
 
452 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0127185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1806  signal recognition particle protein  34.03 
 
 
435 aa  220  7e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000012194  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1804  signal recognition particle protein  34.16 
 
 
512 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0197886  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2081  signal recognition particle protein  34.7 
 
 
517 aa  219  7.999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1725  signal recognition particle protein  32.4 
 
 
518 aa  219  1e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.862121  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1155  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  31.62 
 
 
481 aa  218  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000491114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2872  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  35.31 
 
 
452 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107321  hitchhiker  0.00000141752 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0777  signal recognition particle protein  31.31 
 
 
441 aa  218  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1351  signal recognition particle protein  31.71 
 
 
479 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0023431  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0785  Signal recognition particle GTPase  33.26 
 
 
476 aa  218  2.9999999999999998e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000113263  unclonable  1.02574e-27 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0803  signal recognition particle protein  33.33 
 
 
455 aa  217  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000079449  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1387  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.83 
 
 
443 aa  217  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133728  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23770  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.92 
 
 
527 aa  217  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645209  normal  0.354043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1667  signal recognition particle protein  33.04 
 
 
444 aa  217  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000671364  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1286  signal recognition particle protein  33.62 
 
 
444 aa  216  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.524326  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2535  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.59 
 
 
483 aa  216  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00293209  normal  0.012093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4178  signal recognition particle protein  34 
 
 
488 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4358  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.52 
 
 
490 aa  216  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366323  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0882  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.81 
 
 
492 aa  216  9e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.553698  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1468  signal recognition particle protein  33.91 
 
 
536 aa  216  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4020  signal recognition particle protein  32.82 
 
 
489 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000574509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1027  signal recognition particle protein  32.38 
 
 
450 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.588339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1087  signal recognition particle protein  33.18 
 
 
446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000240128  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19561  signal recognition particle protein (SRP54)  32.74 
 
 
494 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.20972 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1228  signal recognition particle protein  32.51 
 
 
433 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000301134  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0805  Signal recognition particle protein  31.09 
 
 
451 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.104742  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0966  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  34.46 
 
 
447 aa  213  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570112  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09710  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  33.33 
 
 
515 aa  213  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.955104 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2141  signal recognition particle protein  32.97 
 
 
508 aa  213  9e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3494  signal recognition particle protein  36.12 
 
 
453 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.28336e-32 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2449  signal recognition particle protein  34.88 
 
 
463 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000152943  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1227  signal recognition particle protein  32.29 
 
 
433 aa  212  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121808  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1418  signal recognition particle protein  32.01 
 
 
447 aa  212  1e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000224408  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1498  signal recognition particle protein  33.63 
 
 
448 aa  213  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.225316  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0296  signal recognition particle protein  30.36 
 
 
435 aa  212  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130095  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2754  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.35 
 
 
443 aa  212  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13331  signal recognition particle protein (SRP54)  34.16 
 
 
485 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.367944  normal  0.587075 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3764  signal recognition particle protein  34.26 
 
 
449 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000380679  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1321  signal recognition particle protein  32.46 
 
 
455 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000465855  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1296  signal recognition particle protein  32.46 
 
 
455 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000399025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1978  signal recognition particle protein  33.41 
 
 
469 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0638  signal recognition particle protein  33.64 
 
 
444 aa  211  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000602256  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4622  signal recognition particle protein  32.69 
 
 
449 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000364274  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1099  signal recognition particle protein  35.84 
 
 
453 aa  210  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000944997  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1396  signal recognition particle protein  31 
 
 
521 aa  210  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.167047  decreased coverage  0.0064303 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3432  signal recognition particle protein  35.89 
 
 
453 aa  209  9e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000327935  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4182  signal recognition particle protein  32.25 
 
 
535 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1196  signal recognition particle protein  32.97 
 
 
449 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0364721  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1525  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  32.29 
 
 
449 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000514832  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3761  signal recognition particle protein  33.03 
 
 
453 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000277324  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1440  signal recognition particle protein  32.18 
 
 
450 aa  208  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.627334  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0319  signal recognition particle protein  30.84 
 
 
439 aa  207  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000288102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0067  signal recognition particle protein  32.21 
 
 
446 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf350  signal recognition particle  31.91 
 
 
441 aa  207  3e-52  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.826641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>