31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE02640 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE02640  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  100 
 
 
507 aa  1058    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06119  zinc carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08790)  29.96 
 
 
586 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32238  predicted protein  31.99 
 
 
502 aa  189  8e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.237691  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6479  hypothetical protein  32.18 
 
 
606 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.485049  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4502  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.46 
 
 
628 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.040263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2507  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.53 
 
 
378 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3105  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.66 
 
 
632 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000214938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4082  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.14 
 
 
626 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.221076  normal  0.0678076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2367  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.67 
 
 
428 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5723  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.08 
 
 
439 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21250  predicted carboxypeptidase  29.92 
 
 
403 aa  89.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39208  normal  0.631814 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2457  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.69 
 
 
889 aa  82.4  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0889296  normal  0.334441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3806  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.52 
 
 
356 aa  77.8  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0393058  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1183  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.27 
 
 
1061 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0756  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.24 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0770  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.24 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0750  peptidase M14, carboxypeptidase A  26.24 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.992935 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5783  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.97 
 
 
457 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0804955  normal  0.645968 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5245  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.53 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.510355 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2914  carboxypeptidase A  22.92 
 
 
429 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000427177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1701  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.88 
 
 
1034 aa  67  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1703  peptidase M14, carboxypeptidase A  24.22 
 
 
1034 aa  67  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.504762 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0391  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.94 
 
 
446 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2489  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.75 
 
 
1074 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.85 
 
 
773 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1643  peptidase M14 carboxypeptidase A  26.45 
 
 
440 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  27.04 
 
 
429 aa  52  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42459  predicted protein  23.61 
 
 
356 aa  47.4  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8143  hypothetical protein  22.71 
 
 
815 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.797388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.85 
 
 
393 aa  43.9  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2377  Gamma-D-glutamyl-meso-diaminopimelate peptidase  25.53 
 
 
388 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>