70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01660 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE01660  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  889    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.722392  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58562  predicted protein  28.64 
 
 		 279 aa  100  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0813846  normal  0.776229 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49419  predicted protein  34.91 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2419  hypothetical protein  36.92 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2298  hypothetical protein  36.15 
 
 		 212 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15952  predicted protein  47.96 
 
 		 123 aa  81.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_9486  predicted protein  46.74 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  38.83 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  34.58 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  33.93 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  34.88 
 
 		 493 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0961  methyltransferase  29.63 
 
 		 331 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000822635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  32.77 
 
 		 554 aa  55.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2903  RNA methyltransferase, TrmA family  36.47 
 
 		 438 aa  53.9  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02120  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  36.36 
 
 		 543 aa  53.5  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  37.5 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  25.9 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1141  methyltransferase  28.87 
 
 		 185 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.812871  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  36.25 
 
 		 395 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2225  tRNA (uracil-5-) -methyltransferase  32.26 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  29.76 
 
 		 458 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  34.52 
 
 		 459 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  31.21 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1392  methyltransferase  29.2 
 
 		 336 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.12 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 243 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  32.69 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40 
 
 		 305 aa  46.6  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  35 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1295  RNA methyltransferase  31.88 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293917  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0072  SAM-dependent methyltransferase  34.12 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1577  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  28.18 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1252  RNA methyltransferase  34.07 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0113803  normal  0.599775 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41962  predicted protein  30 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0487312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1650  23S rRNA methyluridine methyltransferase  28.17 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1963  23S rRNA methyluridine methyltransferase  28.17 
 
 		 375 aa  45.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.333439  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0665  PUA domain-containing protein  28.42 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.438806  normal  0.11367 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2704  RNA methyltransferase, TrmA family  32.76 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000380281  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0868  23S rRNA methyluridine methyltransferase  26.02 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0733  protein of unknown function Met10  30 
 
 		 329 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.213021 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3054  23S rRNA methyluridine methyltransferase  26.83 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0690  RNA methyltransferase, TrmA family  28.41 
 
 		 449 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2971  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.71 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.422086  hitchhiker  0.0000745246 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  34.15 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  35.48 
 
 		 407 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1527  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.71 
 
 		 443 aa  44.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.334033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3619  23S rRNA methyluridine methyltransferase  26.02 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1871  methyltransferase  32.5 
 
 		 198 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3424  23S rRNA methyluridine methyltransferase  26.02 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3496  23S rRNA methyluridine methyltransferase  26.02 
 
 		 390 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  31.76 
 
 		 295 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.13 
 
 		 442 aa  44.3  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  32.5 
 
 		 413 aa  43.9  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  33.33 
 
 		 495 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1470  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.71 
 
 		 468 aa  43.9  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00598904  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1674  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  27.43 
 
 		 458 aa  43.5  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2390  23S rRNA methyluridine methyltransferase  28.57 
 
 		 382 aa  43.5  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.437044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3543  ribosomal protein L11 methylase-like protein  35.44 
 
 		 265 aa  43.5  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103113 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3309  23S rRNA methyluridine methyltransferase  27.34 
 
 		 384 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  25.49 
 
 		 477 aa  43.5  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  26.44 
 
 		 461 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  26.44 
 
 		 461 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1733  hypothetical protein  30.86 
 
 		 179 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  30.49 
 
 		 297 aa  43.5  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2114  methyltransferase  30.86 
 
 		 179 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  35.37 
 
 		 297 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0450  HemK family modification methylase  35.29 
 
 		 295 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  32.94 
 
 		 435 aa  43.1  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0053  RNA methyltransferase, TrmA family  29.55 
 
 		 415 aa  43.1  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  34.07 
 
 		 301 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>