More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00800 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03657  putative TeaA receptor TeaR (Eurofung)  48.51 
 
 		 1015 aa  912    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.902934 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43971  predicted protein  40.14 
 
 		 962 aa  640    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00800  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 1002 aa  2068    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.123934  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86849  3'-5' exoribonuclease required for 3 end formation of 5.8S rRNA  47.21 
 
 		 989 aa  878    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.188778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23306  predicted protein  37.74 
 
 		 908 aa  566  1e-160  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.103886  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_10027  predicted protein  37.6 
 
 		 668 aa  386  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000299968  normal  0.0425653 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_582  predicted protein  36.8 
 
 		 538 aa  284  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000266967 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02350  SSD1 protein, putative  29.14 
 
 		 1671 aa  271  5e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26775  predicted protein  33.95 
 
 		 593 aa  263  2e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  33.4 
 
 		 795 aa  253  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  37.2 
 
 		 709 aa  250  9e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  32.26 
 
 		 742 aa  249  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  40.78 
 
 		 751 aa  244  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  31.43 
 
 		 726 aa  244  7.999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  30.47 
 
 		 735 aa  242  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  30.65 
 
 		 750 aa  239  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  32.45 
 
 		 825 aa  239  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  32.53 
 
 		 718 aa  235  3e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  35.68 
 
 		 702 aa  234  4.0000000000000004e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  30.92 
 
 		 795 aa  229  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  30.37 
 
 		 795 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  33.4 
 
 		 762 aa  224  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  31.12 
 
 		 705 aa  222  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  32.22 
 
 		 794 aa  220  8.999999999999998e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  36.47 
 
 		 716 aa  219  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  30.5 
 
 		 791 aa  217  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  33.62 
 
 		 770 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01158  cell wall biogenesis protein phosphatase Ssd1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11420)  29.38 
 
 		 1374 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  30.12 
 
 		 791 aa  207  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  28.76 
 
 		 752 aa  204  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  30.52 
 
 		 806 aa  202  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  37.36 
 
 		 757 aa  200  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  29.09 
 
 		 709 aa  199  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  30.16 
 
 		 806 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  30.16 
 
 		 808 aa  198  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  30.16 
 
 		 808 aa  198  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  30.16 
 
 		 808 aa  198  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  30.16 
 
 		 812 aa  198  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  30.16 
 
 		 810 aa  197  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  34.13 
 
 		 692 aa  197  7e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  30.16 
 
 		 804 aa  197  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  30.16 
 
 		 806 aa  197  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  29.98 
 
 		 814 aa  197  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  30.77 
 
 		 792 aa  197  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  32.45 
 
 		 762 aa  195  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  31.54 
 
 		 813 aa  194  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  32.59 
 
 		 751 aa  193  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  32.02 
 
 		 903 aa  192  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  32.59 
 
 		 751 aa  193  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  31.02 
 
 		 705 aa  192  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  29.85 
 
 		 766 aa  191  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  33.06 
 
 		 706 aa  190  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  31.34 
 
 		 710 aa  189  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  31.34 
 
 		 710 aa  189  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  31.39 
 
 		 788 aa  188  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  32.93 
 
 		 758 aa  188  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  29.04 
 
 		 706 aa  188  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  31.75 
 
 		 722 aa  187  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  31.58 
 
 		 759 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  30.9 
 
 		 695 aa  185  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  29.53 
 
 		 801 aa  184  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  33.06 
 
 		 817 aa  184  9.000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  31 
 
 		 770 aa  184  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  28.65 
 
 		 763 aa  183  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  31.76 
 
 		 827 aa  183  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  34.12 
 
 		 810 aa  179  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0356  ribonuclease R  31.36 
 
 		 778 aa  178  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  31.25 
 
 		 790 aa  177  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  31.25 
 
 		 790 aa  177  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  28.17 
 
 		 763 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  35.4 
 
 		 704 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  28.36 
 
 		 716 aa  177  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0050  ribonuclease R  30.79 
 
 		 750 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  31.42 
 
 		 1182 aa  177  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  29.98 
 
 		 701 aa  177  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  31.49 
 
 		 801 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4960  ribonuclease R  33.4 
 
 		 1004 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  32.71 
 
 		 863 aa  176  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2853  ribonuclease R  30.61 
 
 		 754 aa  176  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82373  Exosomal 3'-5' exoribonuclease complex, subunit Rrp44/Dis3  23.21 
 
 		 1251 aa  174  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0228634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  32.31 
 
 		 720 aa  174  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  29.39 
 
 		 777 aa  174  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1294  ribonuclease R  30 
 
 		 790 aa  174  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501938  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1386  ribonuclease R  30.24 
 
 		 790 aa  174  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.365928 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  29.76 
 
 		 737 aa  173  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  34.15 
 
 		 774 aa  173  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3672  ribonuclease R  27.19 
 
 		 787 aa  173  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330393  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1126  RNAse R  29.94 
 
 		 752 aa  173  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  30.61 
 
 		 828 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2787  ribonuclease R  29.55 
 
 		 752 aa  172  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1274  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  28.71 
 
 		 670 aa  171  6e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2418  exoribonuclease R  31.45 
 
 		 783 aa  171  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0155442  normal  0.184337 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  31.73 
 
 		 792 aa  170  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  29.56 
 
 		 737 aa  170  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  29.29 
 
 		 694 aa  169  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1948  ribonuclease R  32.74 
 
 		 759 aa  169  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  31.11 
 
 		 864 aa  169  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1353  ribonuclease R  28.3 
 
 		 765 aa  168  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3864  ribonuclease R  30.75 
 
 		 776 aa  167  6.9999999999999995e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  26.53 
 
 		 770 aa  167  8e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>