More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC05340 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC05340  d-arabinitol 2-dehydrogenase, putative  100 
 
 
355 aa  735    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.656485  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04691  D-arabinitol dehydrogenase (EC 1.1.1.250) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6T5L8]  45.13 
 
 
358 aa  250  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65696  D-arabinitol 2-dehydrogenase [ribulose forming] (ARDH)  39.63 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
258 aa  190  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.53 
 
 
255 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
251 aa  186  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00162277  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
252 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.1 
 
 
258 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
252 aa  182  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 
255 aa  182  7e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07590  hypothetical protein similar to NADP-dependent mannitol dehydrogenase (Broad)  40.15 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
257 aa  179  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108701 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38255  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase, and sorbitol utilization protein  35.79 
 
 
282 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 
255 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
269 aa  173  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
257 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.34144  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0615  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.67 
 
 
257 aa  169  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000368197  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
256 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08819  short chain dehydrogenase (Eurofung)  37.76 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0173459  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  35.98 
 
 
254 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 
255 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 
255 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  37.93 
 
 
255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0919  putative oxidoreductase  36.84 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  0.888241 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  36.12 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1454  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.59 
 
 
256 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.108685 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01677  short chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08710)  36.19 
 
 
287 aa  162  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02177  short chain dehydrogenase/oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15740)  34.81 
 
 
337 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186122 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86346  peroxisomal 2,4- dienoyl-CoA reductase and sorbitol utilization protein  36.12 
 
 
285 aa  162  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
255 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29820  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  38.17 
 
 
261 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  38.17 
 
 
255 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 
264 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
255 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
255 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.91 
 
 
255 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
255 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.199732  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03312  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_6G13830)  37.16 
 
 
249 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2397  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.72 
 
 
254 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0465114  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00130  conserved hypothetical protein  33.77 
 
 
302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  37.79 
 
 
255 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
255 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
255 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
257 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08113  conserved hypothetical protein  37.59 
 
 
268 aa  153  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.495019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
257 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  35.11 
 
 
260 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  37.26 
 
 
256 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.43 
 
 
248 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
254 aa  150  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
255 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  36.98 
 
 
255 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2037  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00988022  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2333  gluconate 5-dehydrogenase  36.94 
 
 
259 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.885017  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08110  conserved hypothetical protein  39.15 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0998723  normal  0.510903 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.33 
 
 
251 aa  148  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.83 
 
 
257 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
247 aa  146  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01831  Putative oxidoreductase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X186]  36.25 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.354543  normal  0.481163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
261 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 
254 aa  145  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3124  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 
262 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
257 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 
254 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
254 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0293  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
257 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673149  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
262 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
255 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 
260 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
275 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
264 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02402  conserved hypothetical protein  35.11 
 
 
278 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.021724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 
259 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
257 aa  144  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.242227  normal  0.57964 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2363  Short-chain dehydrogenase/reductase  36.4 
 
 
254 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 
254 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  32.95 
 
 
259 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1024  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
254 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.824888  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  36.78 
 
 
253 aa  143  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
254 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251484  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
254 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1513  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  37.26 
 
 
277 aa  143  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.729699 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  37.13 
 
 
252 aa  143  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
268 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05017  conserved hypothetical protein  33.23 
 
 
330 aa  142  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.34 
 
 
258 aa  142  7e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.04 
 
 
266 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2411  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.58 
 
 
255 aa  142  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4775  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
249 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  36.02 
 
 
253 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
257 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563434  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2695  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family protein  36.26 
 
 
277 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6365  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
263 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.54288  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 
254 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6406  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
254 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 
254 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>