More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC04200 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC04200  thioredoxin (allergen cop c 2), putative  100 
 
 
104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.867459  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_56471  thioredoxin h  47.12 
 
 
105 aa  100  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26095  predicted protein  47.47 
 
 
105 aa  99  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00850949 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  48.91 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48539  thioredoxin h  48.89 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  43.16 
 
 
103 aa  90.9  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2576  thioredoxin  41.67 
 
 
123 aa  90.5  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00003573  decreased coverage  0.0000301117 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0223  thioredoxin  37.89 
 
 
125 aa  89.4  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0640953 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37753  predicted protein  44.57 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0200499  hitchhiker  0.00126408 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52686  thioredoxin  42.05 
 
 
117 aa  87.8  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.540777  normal  0.0222325 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  40.21 
 
 
121 aa  87.8  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1855  thioredoxin  39.53 
 
 
124 aa  88.2  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000364045  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5689  thioredoxin  36.36 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  44.44 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01639  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09090)  39.22 
 
 
330 aa  85.9  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2496  thioredoxin  42.86 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.525579  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  36.36 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  43.37 
 
 
103 aa  85.5  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  36.36 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  35.05 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08571  thioredoxin, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10300)  53.33 
 
 
108 aa  84.3  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321852  hitchhiker  0.00174715 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  48.91 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  40.23 
 
 
131 aa  84  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4021  thioredoxin  35.35 
 
 
125 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0834665  normal  0.313604 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1385  thioredoxin  38.1 
 
 
123 aa  83.6  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1832  thioredoxin  35.35 
 
 
125 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11499  thioredoxin trxB1  44.94 
 
 
123 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0242294  normal  0.175347 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0044  thioredoxin  38.78 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  36.14 
 
 
120 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0207  thioredoxin  42.86 
 
 
120 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0358  thioredoxin  40 
 
 
123 aa  82  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  36.14 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0730  thioredoxin  36.36 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0675  thioredoxin  36.36 
 
 
120 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.576431  normal  0.854298 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2770  thioredoxin  36.08 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117115 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1331  thioredoxin  40.79 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.545136  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21270  thioredoxin  37.11 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.724232  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0335  thioredoxin  42.53 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0052  thioredoxin  37.5 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.263175  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2770  thioredoxin  34.74 
 
 
125 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0125  thioredoxin  32.99 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.109226 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0737  thioredoxin  41.05 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942767  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  35.79 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1372  thioredoxin  43.68 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00473089  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  35.79 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2647  thioredoxin  44.05 
 
 
120 aa  80.1  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623834  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  35.79 
 
 
131 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1065  thioredoxin  37.11 
 
 
123 aa  80.1  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00170  Thioredoxin (Trx) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P29429]  46.99 
 
 
189 aa  80.1  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145032  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16950  thioredoxin  36.08 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.30623  normal  0.239589 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3068  thioredoxin  35.05 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.357713  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  36.9 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0420  thioredoxin  43.66 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0867  thioredoxin  40.48 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2740  thioredoxin  41.49 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.529199 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  41.89 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0988  thioredoxin domain-containing protein  44.57 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  34.88 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1702  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxin  41.18 
 
 
104 aa  78.2  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.145851  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0172  thioredoxin  36.9 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  38.1 
 
 
282 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0143  thioredoxin  40.48 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0114  thioredoxin  41.57 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2444  thioredoxin  40 
 
 
121 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2489  thioredoxin  40 
 
 
121 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412658  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0848  thioredoxin  37.37 
 
 
149 aa  77  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  42.06 
 
 
106 aa  77  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31831  Thioredoxin (Trx)  39.33 
 
 
129 aa  76.6  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.986588  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  37.78 
 
 
281 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_002936  DET0661  thioredoxin  43.33 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0695  thioredoxin  43.33 
 
 
107 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2481  thioredoxin  38.95 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.555436  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1789  thioredoxin  41.89 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  42.35 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2231  thioredoxin  36.14 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0118387  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  32.95 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  32.95 
 
 
123 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2638  thioredoxin  32.63 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00698501  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3670  thioredoxin  40.7 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.603645  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  40.7 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_9576  predicted protein  43.33 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  34.57 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  36.9 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4220  thioredoxin  35.05 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  36.67 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  36.9 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  36.9 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  36.9 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0542  thioredoxin  38.16 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  45.45 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  35.71 
 
 
282 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0143  thioredoxin  38.37 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1254  thioredoxin  44.59 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0452  thioredoxin 2  39.73 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0183  thioredoxin  38.37 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0927  thioredoxin  45.21 
 
 
108 aa  75.1  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00418006  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0405  thioredoxin  35.37 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.497639 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  36.9 
 
 
282 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2066  thioredoxin  36.59 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0918718  normal  0.219337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3833  thioredoxin  39.73 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>