More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC03860 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_01014  peroxisomal fatty acid ABC transporter, putative (Eurofung)  51.86 
 
 
706 aa  710    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.186726 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03860  adrenoleukodystrophy protein, putative  100 
 
 
725 aa  1492    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10078  peroxisomal fatty acid ABC transporter, putative (Eurofung)  40.28 
 
 
820 aa  457  1e-127  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252374  normal  0.955787 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06310  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  41.19 
 
 
867 aa  452  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82035  Peroxisomal long-chain fatty acid import protein 1 (Peroxisomal ABC transporter 2)  37.64 
 
 
689 aa  421  1e-116  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.670256  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30885  predicted protein  33.84 
 
 
806 aa  412  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0333554  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_10028  ABC(ABCD) family transporter: long-chain fatty acid  33.39 
 
 
583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.98374  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43996  ABC(ABCD) family transporter: long-chain fatty acid (ALDP-like protein)  32.01 
 
 
615 aa  284  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.4859  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  28.78 
 
 
567 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5213  ABC transporter domain protein  28.67 
 
 
563 aa  233  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149652 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1622  ABC transporter-like  27.52 
 
 
611 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0184099  normal  0.0800311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  27.8 
 
 
603 aa  210  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  28.57 
 
 
667 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  27.35 
 
 
575 aa  200  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  26.33 
 
 
534 aa  200  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  27.69 
 
 
662 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  26.32 
 
 
663 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  27.17 
 
 
589 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  26.32 
 
 
663 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1617  ABC transporter-like  27.56 
 
 
669 aa  195  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.477524  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  27.79 
 
 
570 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  25.68 
 
 
662 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  26.9 
 
 
660 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  25.9 
 
 
576 aa  190  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  25.53 
 
 
662 aa  190  7e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  24.53 
 
 
668 aa  188  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  27.48 
 
 
658 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  27.46 
 
 
660 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  26.2 
 
 
667 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  27.15 
 
 
660 aa  183  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  27.15 
 
 
660 aa  181  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  26.58 
 
 
576 aa  180  9e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  24.95 
 
 
665 aa  179  2e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0424  ABC transporter  38.97 
 
 
640 aa  170  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  25.08 
 
 
608 aa  164  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  26.22 
 
 
592 aa  159  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.43 
 
 
588 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.43 
 
 
584 aa  158  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  29.9 
 
 
602 aa  158  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 
588 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 
588 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.43 
 
 
588 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 
588 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  27.05 
 
 
588 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.24 
 
 
588 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  25.61 
 
 
583 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  25.94 
 
 
613 aa  155  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  29.5 
 
 
626 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  25.09 
 
 
614 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  24.91 
 
 
614 aa  153  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  24.95 
 
 
639 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  29.25 
 
 
615 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  28.64 
 
 
605 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  26.11 
 
 
621 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  26.05 
 
 
589 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  26.05 
 
 
589 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  26.05 
 
 
589 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  25.86 
 
 
589 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.18 
 
 
587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  25.18 
 
 
587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  27.07 
 
 
636 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  23.45 
 
 
588 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  24.68 
 
 
593 aa  149  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  28.25 
 
 
712 aa  149  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  25.78 
 
 
589 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.12 
 
 
598 aa  148  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  24.56 
 
 
610 aa  147  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  27.44 
 
 
597 aa  147  8.000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  25.63 
 
 
589 aa  147  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  26.84 
 
 
704 aa  146  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  25.38 
 
 
589 aa  146  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  23.08 
 
 
577 aa  145  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  26.32 
 
 
606 aa  145  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  25.1 
 
 
591 aa  144  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3991  ABC transporter related  25.43 
 
 
642 aa  144  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  25.75 
 
 
651 aa  144  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  23.93 
 
 
630 aa  144  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  25.82 
 
 
614 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  23.9 
 
 
578 aa  142  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  25.31 
 
 
596 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  25.49 
 
 
666 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  26.43 
 
 
674 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  24.83 
 
 
614 aa  139  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  25.82 
 
 
712 aa  139  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  24.82 
 
 
595 aa  139  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  25.82 
 
 
704 aa  137  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  24.9 
 
 
586 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  24.21 
 
 
595 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  23.17 
 
 
575 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  22.24 
 
 
603 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  24.8 
 
 
660 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  24.74 
 
 
634 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  24.74 
 
 
636 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  24.74 
 
 
636 aa  132  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  23.02 
 
 
590 aa  131  4.0000000000000003e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  25.61 
 
 
563 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  24.06 
 
 
708 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  25.19 
 
 
596 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  22.67 
 
 
583 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  26.51 
 
 
635 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>