More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC01210 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  100 
 
 
669 aa  1366    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  44.62 
 
 
597 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  42.68 
 
 
360 aa  227  4e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  37.15 
 
 
544 aa  214  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  36.75 
 
 
521 aa  207  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  37.92 
 
 
560 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  34.29 
 
 
534 aa  193  7e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  35.14 
 
 
443 aa  187  6e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  32.37 
 
 
717 aa  179  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  30.77 
 
 
562 aa  160  9e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  34.84 
 
 
261 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  28.7 
 
 
378 aa  122  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  31.7 
 
 
268 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  28.34 
 
 
379 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  32.68 
 
 
256 aa  115  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  30.19 
 
 
265 aa  114  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  32.36 
 
 
261 aa  114  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03480  GTP-binding protein, putative  29.85 
 
 
642 aa  113  9e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.866446  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  31.6 
 
 
259 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.437741 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.95 
 
 
267 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  28.04 
 
 
374 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  28.04 
 
 
384 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77411  predicted protein  25.46 
 
 
653 aa  109  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  27.41 
 
 
388 aa  107  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  26.22 
 
 
374 aa  103  8e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02263  ribosome biogenesis GTPase Lsg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06510)  25.14 
 
 
650 aa  100  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.722478  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01470  GTP-binding protein, putative  31.05 
 
 
743 aa  89  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  28.72 
 
 
305 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  27.78 
 
 
271 aa  85.5  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  25.82 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  25.85 
 
 
254 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  25.77 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  25.77 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0827  GTP-binding protein HSR1-related  24.75 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  25.52 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  27.86 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_19438  predicted protein  23.94 
 
 
529 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0420618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  25.77 
 
 
281 aa  73.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  25.5 
 
 
271 aa  73.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  25.76 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  23.34 
 
 
369 aa  70.1  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15435  predicted protein  26.8 
 
 
611 aa  69.3  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.183176  normal  0.664844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  25.81 
 
 
292 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  25.91 
 
 
284 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  26.33 
 
 
305 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.91 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  22.26 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  25.08 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1688  GTP-binding protein HSR1-related  27.18 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161371  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  23.49 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  28.48 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  27.49 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  25 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04708  mitochondrial GTPase (YlqF), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08680)  30.29 
 
 
354 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.378462  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  25 
 
 
281 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  24.63 
 
 
314 aa  67  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  30.77 
 
 
299 aa  65.1  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  25.17 
 
 
277 aa  64.7  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  30.77 
 
 
299 aa  64.7  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  25.91 
 
 
314 aa  64.7  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  23.86 
 
 
296 aa  63.9  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06180  GTPase, putative  31.55 
 
 
638 aa  63.5  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  26.77 
 
 
276 aa  63.9  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  25.64 
 
 
270 aa  63.5  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  23.53 
 
 
296 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  23.53 
 
 
296 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  26.04 
 
 
287 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  23.53 
 
 
296 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  23.53 
 
 
296 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  27.04 
 
 
285 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  23.53 
 
 
296 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  23.2 
 
 
296 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  24.18 
 
 
296 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  26.04 
 
 
287 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  24.18 
 
 
296 aa  62  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  24.84 
 
 
288 aa  61.6  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0196  ribosomal biogenesis GTPase  25.62 
 
 
290 aa  61.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  25.64 
 
 
314 aa  60.8  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  27.96 
 
 
280 aa  60.8  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02231  ribosomal biogenesis GTPase  26.63 
 
 
288 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4647  ribosomal biogenesis GTPase  24.75 
 
 
293 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.365042 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  24.24 
 
 
311 aa  60.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3396  GTP-binding  29.26 
 
 
330 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02121  ribosomal biogenesis GTPase  26.6 
 
 
290 aa  60.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  23.84 
 
 
310 aa  59.7  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02141  ribosomal biogenesis GTPase  26.6 
 
 
290 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.909722  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27991  ribosomal biogenesis GTPase  26.53 
 
 
289 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.37 
 
 
298 aa  58.9  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  26.56 
 
 
324 aa  58.9  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  27.6 
 
 
293 aa  58.9  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  23.72 
 
 
287 aa  58.5  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  25.39 
 
 
314 aa  58.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  27.33 
 
 
291 aa  58.2  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  23.83 
 
 
315 aa  58.2  0.0000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  24.17 
 
 
379 aa  58.2  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  26.26 
 
 
307 aa  58.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  23.2 
 
 
296 aa  57.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  24.31 
 
 
313 aa  57.8  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1312  GTP-binding protein, HSR1-related  29.47 
 
 
319 aa  57.8  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  28.06 
 
 
316 aa  57.4  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>