More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04920 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB04920  GTP cyclohydrolase I, putative  100 
 
 
435 aa  890    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08188  hypothetical protein similar to GTP cyclohydrolase I (Broad)  69.08 
 
 
329 aa  306  6e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34960  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  64.25 
 
 
270 aa  289  8e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  58.54 
 
 
247 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  64.09 
 
 
239 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  64.09 
 
 
239 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  61.38 
 
 
235 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  59.28 
 
 
213 aa  250  5e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  57.07 
 
 
235 aa  249  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  57.56 
 
 
235 aa  248  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21868  predicted protein  62.01 
 
 
186 aa  246  4.9999999999999997e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.213311  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  56.91 
 
 
243 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1949  GTP cyclohydrolase I  54.87 
 
 
216 aa  226  8e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2208  GTP cyclohydrolase  61.08 
 
 
199 aa  226  8e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0579312  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1299  GTP cyclohydrolase  56.83 
 
 
185 aa  225  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3847  GTP cyclohydrolase I  56.98 
 
 
218 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0864  GTP cyclohydrolase I  55.85 
 
 
214 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0890  GTP cyclohydrolase I  55.85 
 
 
214 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.273347  normal  0.916518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3782  GTP cyclohydrolase I  55.06 
 
 
189 aa  220  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  56.42 
 
 
218 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2117  GTP cyclohydrolase I  55.62 
 
 
203 aa  217  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1690  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 
186 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1670  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 
185 aa  216  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4616  GTP cyclohydrolase I  56.42 
 
 
212 aa  216  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19630  GTP cyclohydrolase I  56.74 
 
 
186 aa  216  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0187  GTP cyclohydrolase I  51.65 
 
 
190 aa  216  9e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0225  GTP cyclohydrolase I  51.65 
 
 
190 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0891  GTP cyclohydrolase I  57.23 
 
 
186 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  54.75 
 
 
223 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0859  GTP cyclohydrolase I  52.97 
 
 
226 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.323599 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1020  GTP cyclohydrolase I  56.65 
 
 
187 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0863  GTP cyclohydrolase I  54.86 
 
 
188 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1153  GTP cyclohydrolase I  54.86 
 
 
184 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1390  GTP cyclohydrolase I  50.76 
 
 
213 aa  213  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  50.78 
 
 
219 aa  213  7e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0754  GTP cyclohydrolase I  54.19 
 
 
216 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2294  GTP cyclohydrolase I  52.78 
 
 
184 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0204  GTP cyclohydrolase I  51.1 
 
 
190 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1588  GTP cyclohydrolase I  47.25 
 
 
223 aa  211  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1496  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 
190 aa  211  3e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  51.58 
 
 
219 aa  210  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3598  GTP cyclohydrolase I  54.34 
 
 
181 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1182  GTP cyclohydrolase I  54.91 
 
 
187 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3207  GTP cyclohydrolase I  52.81 
 
 
186 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.574177  normal  0.0542023 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0206  GTP cyclohydrolase I  53.67 
 
 
202 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42850  GTP cyclohydrolase I  53.76 
 
 
181 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2678  GTP cyclohydrolase I  54.86 
 
 
180 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.508198  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23690  GTP cyclohydrolase I  54.65 
 
 
181 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0310829  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1481  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 
190 aa  207  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3289  GTP cyclohydrolase  53.37 
 
 
186 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2932  GTP cyclohydrolase I  53.3 
 
 
201 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0900198 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1715  GTP cyclohydrolase I  54.65 
 
 
181 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2021  GTP cyclohydrolase I  51.69 
 
 
186 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.780834  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  50.74 
 
 
220 aa  206  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0548  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 
184 aa  206  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1799  GTP cyclohydrolase I  50.56 
 
 
198 aa  206  6e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.982751  hitchhiker  0.00000626036 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2093  GTP cyclohydrolase  52.33 
 
 
179 aa  206  8e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.101734  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2512  GTP cyclohydrolase I  52.25 
 
 
186 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1778  GTP cyclohydrolase I  49.18 
 
 
190 aa  205  1e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2683  GTP cyclohydrolase I  54.95 
 
 
179 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2035  GTP cyclohydrolase I  53.49 
 
 
181 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2814  GTP cyclohydrolase I  54.95 
 
 
179 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1431  GTP cyclohydrolase I  55.23 
 
 
181 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.33903  normal  0.426591 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1845  GTP cyclohydrolase I  53.49 
 
 
181 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.350099 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2086  GTP cyclohydrolase I  48.57 
 
 
179 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1694  GTP cyclohydrolase I  48.11 
 
 
195 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4504  GTP cyclohydrolase I  55.43 
 
 
210 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2744  GTP cyclohydrolase I  53.49 
 
 
181 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0752455  normal  0.719118 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2156  GTP cyclohydrolase I  47.34 
 
 
193 aa  199  9e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08636  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 
199 aa  198  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0625  GTP cyclohydrolase I  53.8 
 
 
193 aa  198  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.497078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0301  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 
225 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000150261  normal  0.11188 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4149  GTP cyclohydrolase I  52.02 
 
 
210 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0266568 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2930  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
182 aa  197  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0705  GTP cyclohydrolase I  52.81 
 
 
226 aa  197  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0041  GTP cyclohydrolase I  48.59 
 
 
194 aa  197  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6956  GTP cyclohydrolase I  51.69 
 
 
195 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.837765  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1393  GTP cyclohydrolase I  55.23 
 
 
200 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2469  GTP cyclohydrolase I  48.85 
 
 
181 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  54.1 
 
 
190 aa  195  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0836  GTP cyclohydrolase I  48.29 
 
 
214 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0812961  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1401  GTP cyclohydrolase I  54.65 
 
 
181 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154537  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0205  GTP cyclohydrolase I  50.51 
 
 
200 aa  194  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.224052 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2894  GTP cyclohydrolase I  54.44 
 
 
207 aa  193  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4971  GTP cyclohydrolase I  52.41 
 
 
199 aa  193  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.853969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  51.93 
 
 
188 aa  193  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3888  GTP cyclohydrolase I  54.65 
 
 
181 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.299741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1823  GTP cyclohydrolase I  54.65 
 
 
190 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00310183  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0131  GTP cyclohydrolase I  51.41 
 
 
206 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4743  GTP cyclohydrolase I  49.75 
 
 
219 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  hitchhiker  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0617  GTP cyclohydrolase I  53.93 
 
 
206 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1048  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 
187 aa  191  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0017  GTP cyclohydrolase I  50.82 
 
 
224 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4307  GTP cyclohydrolase I  49.75 
 
 
219 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9174  GTP cyclohydrolase I  53.89 
 
 
193 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0955  GTP cyclohydrolase I  53.99 
 
 
201 aa  189  7e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000998174  hitchhiker  0.00336193 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 
188 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4315  GTP cyclohydrolase  51.17 
 
 
217 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1425  GTP cyclohydrolase I  51.74 
 
 
203 aa  187  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.899017  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  50.28 
 
 
234 aa  187  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>