More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB01250 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB01250  short-chain dehydrogenase, putative  100 
 
 
282 aa  579  1e-164  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05450  oxidoreductase, putative  51.84 
 
 
304 aa  234  8e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00618  conserved hypothetical protein  45.02 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.767704 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00179  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G11240)  45 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.983253  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80053  NADP(+)-dependent dehydrogenase acts on serine, L-allo-threonine, and other 3-hydroxy acids  48 
 
 
269 aa  209  5e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
261 aa  202  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.64 
 
 
257 aa  196  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
257 aa  195  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.93 
 
 
256 aa  195  8.000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.56 
 
 
254 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
254 aa  193  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.73 
 
 
248 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
258 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0189644  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  42.98 
 
 
258 aa  185  6e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2450  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.3 
 
 
248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.12 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
261 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52102  serine dehydrogenase  46.18 
 
 
271 aa  183  3e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2127  Serine 3-dehydrogenase  40.82 
 
 
255 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.247906  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1378  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.5 
 
 
248 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73447  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  43.1 
 
 
258 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
248 aa  178  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295991  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0091  putative serine dehydrogenase  39.43 
 
 
252 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
248 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
248 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
248 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
248 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
254 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00727999  normal  0.180483 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3894  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
248 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6941  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
251 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445367  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467056  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295469  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10492  short-chain type oxidoreductase  42.08 
 
 
251 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.591118  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  36.78 
 
 
257 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 
259 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0977  NADP-dependent l-serine/l-allo-threonine dehydrogenase ydfg  38.84 
 
 
248 aa  171  1e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.616956  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.33 
 
 
253 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.71 
 
 
254 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2076  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 
248 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  37.19 
 
 
257 aa  169  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3251  putative short-chain dehydrogenase  40 
 
 
248 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 
248 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1944  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 
248 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
248 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0832  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 
248 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2666  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 
248 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.99175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3198  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 
248 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40 
 
 
248 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.964469  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
269 aa  169  6e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 
250 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0197  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.16 
 
 
254 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0723  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
250 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.191484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0730  oxidoreductase protein  42.19 
 
 
262 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1841  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.39 
 
 
250 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00165114  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.19 
 
 
250 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.22723  normal  0.897045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0713  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
251 aa  163  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0397  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.24 
 
 
254 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0955  short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  40.25 
 
 
245 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
254 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0676  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.45 
 
 
253 aa  161  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.153885 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
253 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
250 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.241835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02630  short-chain alcohol dehydrogenase  39.92 
 
 
243 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5952  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
250 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.908331 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 
255 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000309791  hitchhiker  0.00252207 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 
252 aa  159  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1864  3-hydroxy acid dehydrogenase  36.55 
 
 
249 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.612513  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1976  3-hydroxy acid dehydrogenase  36.55 
 
 
249 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3915  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
248 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0850  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.1 
 
 
249 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1406  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.27 
 
 
248 aa  158  8e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000194485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
250 aa  158  9e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2290  3-hydroxy acid dehydrogenase  35.97 
 
 
249 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.997293 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02915  serine 3-dehydrogenase  38.68 
 
 
251 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
250 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1682  3-hydroxy acid dehydrogenase  36.59 
 
 
248 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97667  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1660  3-hydroxy acid dehydrogenase  36.59 
 
 
248 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00687336  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1893  3-hydroxy acid dehydrogenase  36.46 
 
 
249 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1826  3-hydroxy acid dehydrogenase  36.59 
 
 
248 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0315451  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1614  3-hydroxy acid dehydrogenase  36.59 
 
 
248 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.594866  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1623  3-hydroxy acid dehydrogenase  36.59 
 
 
248 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4862  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.66 
 
 
254 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000522303  unclonable  0.000000385865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 
255 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155421  hitchhiker  0.00000000000159857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
243 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.66 
 
 
254 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000261149  unclonable  0.000000000503217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
252 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1376  NADP-dependent l-serine/l-allo-threonine dehydrogenase ydfg  34.98 
 
 
250 aa  156  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
251 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0668  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 
251 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60736  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4914  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.08 
 
 
254 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
251 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.410016 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0920  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.85 
 
 
249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0602  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
254 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0114024  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5631  putative short-chain dehydrogenase  34.41 
 
 
253 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
254 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>