16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00230 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_08124  conserved hypothetical protein  69.6 
 
 
463 aa  657    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.906972  normal  0.172966 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00230  expressed protein  100 
 
 
496 aa  1022    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00399187  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00850  membrane protein, putative  42.72 
 
 
432 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04600  expressed protein  38.62 
 
 
495 aa  317  3e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.571814  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10332  conserved hypothetical protein  31.84 
 
 
461 aa  251  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.93778 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02680  conserved hypothetical protein  31.74 
 
 
478 aa  237  4e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02699  conserved hypothetical protein  33.73 
 
 
467 aa  217  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0231464  normal  0.612902 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06949  conserved hypothetical protein  32.61 
 
 
523 aa  211  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02783  conserved hypothetical protein  28.15 
 
 
464 aa  191  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02562  DUF895 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_3G15000)  29.31 
 
 
451 aa  190  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.666274 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31835  predicted protein  29.61 
 
 
467 aa  182  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01860  conserved hypothetical protein  28.54 
 
 
486 aa  178  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29800  predicted protein  25.31 
 
 
531 aa  157  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01427  DUF895 domain membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04110)  25.65 
 
 
508 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.371753 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08127  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17480)  23.53 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.642015 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  31 
 
 
396 aa  43.5  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>