18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00110 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB00110  conserved hypothetical protein  100 
 
 
1608 aa  3264    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108047  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50414  predicted protein  37.06 
 
 
262 aa  75.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0185184  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41374  predicted protein  37.06 
 
 
262 aa  75.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00887084  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34199  predicted protein  28.87 
 
 
471 aa  67.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10140  cell wall biogenesis protein Mhp1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12900)  26.72 
 
 
1205 aa  65.9  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.105605 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42557  predicted protein  36.61 
 
 
692 aa  63.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_5718  predicted protein  32.58 
 
 
241 aa  63.2  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0287737  decreased coverage  0.00877055 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  35.75 
 
 
464 aa  60.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39238  predicted protein  28.12 
 
 
591 aa  58.2  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.975604  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0112  cyclin domain-containing protein  34.27 
 
 
770 aa  57  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1477  hypothetical protein  32.62 
 
 
614 aa  53.5  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  32.29 
 
 
620 aa  48.9  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34148  predicted protein  28.8 
 
 
466 aa  48.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0271154  normal  0.859268 
 
 
-
 
NC_003296  RS01777  GALA protein  29.63 
 
 
981 aa  47.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254341  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47188  predicted protein  27.14 
 
 
916 aa  47  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1801  GALA protein 3  32.31 
 
 
522 aa  46.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578004  normal  0.0997916 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1436  hypothetical protein  32.03 
 
 
815 aa  45.1  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0147013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  34.36 
 
 
400 aa  45.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>