186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06990 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  100 
 
 		 365 aa  751    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  71.81 
 
 		 348 aa  497  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  58.55 
 
 		 343 aa  408  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  56.53 
 
 		 350 aa  376  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  47.87 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  49.85 
 
 		 323 aa  301  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  46.33 
 
 		 658 aa  297  2e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  44.58 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  45.08 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  44.44 
 
 		 330 aa  259  4e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  40.11 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  44.13 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  40.67 
 
 		 324 aa  245  9e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  41.67 
 
 		 358 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  39.51 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  39.57 
 
 		 324 aa  239  6.999999999999999e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  41.8 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  41.02 
 
 		 325 aa  232  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  40.37 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  39.58 
 
 		 329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  38.97 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  38.62 
 
 		 327 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  39.39 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  40 
 
 		 322 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  37.24 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  35.93 
 
 		 349 aa  209  8e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  37.54 
 
 		 322 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  39.58 
 
 		 324 aa  206  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  35.03 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  37.24 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  36.94 
 
 		 322 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  36.94 
 
 		 322 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  34.57 
 
 		 343 aa  199  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  34.57 
 
 		 343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  34.29 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  36.01 
 
 		 315 aa  187  3e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  37.11 
 
 		 250 aa  138  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  32.3 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  30.23 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  28.42 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 312 aa  100  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  28.77 
 
 		 358 aa  93.6  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  29.48 
 
 		 243 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  29.76 
 
 		 221 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  30.27 
 
 		 227 aa  86.7  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  27.54 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  27.46 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  28.67 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  29.18 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  28.97 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  31.47 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  28.35 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  27.17 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  28.65 
 
 		 217 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  27.49 
 
 		 224 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  26.29 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  27.67 
 
 		 226 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  32.21 
 
 		 554 aa  69.3  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  29.89 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  27.35 
 
 		 541 aa  63.9  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  23.97 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1787  recombinase A  25.1 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.744188  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  26.74 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  27.12 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  26.74 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  25.31 
 
 		 213 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  26.69 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02320  RAD57 protein, putative  28.94 
 
 		 598 aa  53.1  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  23.98 
 
 		 215 aa  52.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0530  recA protein  26.34 
 
 		 327 aa  52.8  0.000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.3 
 
 		 456 aa  52.8  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  23.83 
 
 		 216 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  23.79 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0153  recombinase A  25.99 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0206  recA protein  24.91 
 
 		 350 aa  50.1  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.613588  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0876  recombinase A  26.34 
 
 		 357 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  26.87 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  25.88 
 
 		 362 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  26.39 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5034  recA protein  25.85 
 
 		 364 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  23.83 
 
 		 215 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0005  recA protein  27.31 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0310986  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  26.09 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0804  recA protein  23.53 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  24.46 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  26.94 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  25.11 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1288  recombinase A  25.32 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3340  recombinase A  24.89 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317597  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0201  recombinase A  25.1 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.911025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  26.92 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1905  recombinase A  25 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0291  recombinase A  26.43 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000893894  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2398  recA protein  24.67 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.38659e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1643  recombinase A  25.1 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883064  decreased coverage  0.00000000000602005 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  27.78 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  27.78 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  26.38 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  26.38 
 
 		 366 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>