More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA06310 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA06310  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  100 
 
 		 867 aa  1770    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10078  peroxisomal fatty acid ABC transporter, putative (Eurofung)  42.33 
 
 		 820 aa  596  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.252374  normal  0.955787 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30885  predicted protein  35.9 
 
 		 806 aa  491  1e-137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0333554  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03860  adrenoleukodystrophy protein, putative  41.19 
 
 		 725 aa  467  9.999999999999999e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01014  peroxisomal fatty acid ABC transporter, putative (Eurofung)  40.06 
 
 		 706 aa  443  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186726 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_10028  ABC(ABCD) family transporter: long-chain fatty acid  32.3 
 
 		 583 aa  318  3e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.98374  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82035  Peroxisomal long-chain fatty acid import protein 1 (Peroxisomal ABC transporter 2)  32.45 
 
 		 689 aa  312  2e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.670256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43996  ABC(ABCD) family transporter: long-chain fatty acid (ALDP-like protein)  32.82 
 
 		 615 aa  266  8.999999999999999e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.4859  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5213  ABC transporter domain protein  28.92 
 
 		 563 aa  190  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149652 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  28.09 
 
 		 662 aa  184  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  27.59 
 
 		 663 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  27.59 
 
 		 663 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  27.26 
 
 		 567 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  29.07 
 
 		 660 aa  170  1e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  24.72 
 
 		 534 aa  169  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  25.6 
 
 		 662 aa  168  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  26.28 
 
 		 662 aa  167  8e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  29.84 
 
 		 660 aa  166  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  29.28 
 
 		 660 aa  163  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  28.87 
 
 		 660 aa  159  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  28.75 
 
 		 575 aa  158  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22803  predicted protein  29.77 
 
 		 608 aa  156  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  38.74 
 
 		 603 aa  156  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  42.86 
 
 		 589 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1622  ABC transporter-like  26.65 
 
 		 611 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0184099  normal  0.0800311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  29.08 
 
 		 667 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  26.08 
 
 		 667 aa  152  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  26.09 
 
 		 576 aa  151  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1617  ABC transporter-like  37.27 
 
 		 669 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.477524  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  25.5 
 
 		 658 aa  148  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  42.78 
 
 		 665 aa  148  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  24.24 
 
 		 590 aa  147  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0424  ABC transporter  40.53 
 
 		 640 aa  147  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  41.67 
 
 		 570 aa  146  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  27.8 
 
 		 668 aa  141  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  27.05 
 
 		 605 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  26.74 
 
 		 576 aa  134  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  25.56 
 
 		 614 aa  134  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  27.4 
 
 		 626 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  25.15 
 
 		 614 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  26.83 
 
 		 602 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  24.95 
 
 		 614 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  26.99 
 
 		 615 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  25.41 
 
 		 587 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.41 
 
 		 587 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  38.46 
 
 		 595 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.93 
 
 		 598 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  26.35 
 
 		 578 aa  127  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 		 639 aa  127  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  25.53 
 
 		 606 aa  127  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  26.63 
 
 		 712 aa  125  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  36.89 
 
 		 635 aa  124  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  27.94 
 
 		 589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  27.85 
 
 		 589 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  27.85 
 
 		 589 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  27.85 
 
 		 589 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  25.18 
 
 		 583 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  35.1 
 
 		 636 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  27.01 
 
 		 713 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  27.9 
 
 		 589 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  35.1 
 
 		 634 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  36.98 
 
 		 712 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  35.1 
 
 		 636 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  36.98 
 
 		 704 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  36.41 
 
 		 637 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  27.73 
 
 		 589 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  34.9 
 
 		 704 aa  119  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  34.07 
 
 		 626 aa  117  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  25.56 
 
 		 575 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  26.42 
 
 		 592 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  32.85 
 
 		 593 aa  117  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  26.62 
 
 		 588 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  26.62 
 
 		 588 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  26.62 
 
 		 588 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  26.57 
 
 		 613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.62 
 
 		 584 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.62 
 
 		 588 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  34.39 
 
 		 586 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.62 
 
 		 588 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  33.99 
 
 		 614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.37 
 
 		 588 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  34.38 
 
 		 674 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  26.37 
 
 		 588 aa  111  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  27.64 
 
 		 589 aa  111  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  33.51 
 
 		 583 aa  111  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  33.33 
 
 		 708 aa  111  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  34.11 
 
 		 596 aa  111  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  25.25 
 
 		 595 aa  110  9.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  35.26 
 
 		 606 aa  110  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  22.95 
 
 		 577 aa  110  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  25 
 
 		 621 aa  110  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  33.48 
 
 		 597 aa  110  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  35.85 
 
 		 603 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  24.06 
 
 		 596 aa  110  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4366  ABC transporter related  33.85 
 
 		 660 aa  109  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  31.6 
 
 		 630 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  33.68 
 
 		 588 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0163  Sigma 54 interacting domain protein  33.67 
 
 		 666 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  24.24 
 
 		 600 aa  108  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4198  ABC transporter related  35.38 
 
 		 591 aa  108  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00760523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>