More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA03880 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA03880  conserved hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  290  4e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  51.82 
 
 
140 aa  121  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2351  hypothetical protein  48.2 
 
 
141 aa  120  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0140381  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32835  conserved hypothetical protein  46.03 
 
 
147 aa  120  9e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.805601  normal  0.755477 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002339  hypothetical protein  48.03 
 
 
148 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00014  hypothetical protein  46.46 
 
 
159 aa  117  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1665  hypothetical protein  45.32 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000223212  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4360  hypothetical protein  47.24 
 
 
139 aa  114  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  41.73 
 
 
139 aa  114  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1039  protein of unknown function UPF0047  50.45 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3510  hypothetical protein  44.72 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0725  protein of unknown function UPF0047  42.45 
 
 
141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5528  protein of unknown function UPF0047  40.28 
 
 
140 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.652918  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49270  predicted protein  45.38 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0249  hypothetical protein  45.67 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00650906  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0527  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  47.75 
 
 
139 aa  107  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03928  hypothetical protein  43.65 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3936  protein of unknown function UPF0047  43.65 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4298  hypothetical protein  43.65 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5559  conserved hypothetical protein TIGR00149  43.65 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.484103  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4518  hypothetical protein  43.65 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03888  hypothetical protein  43.65 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.143638  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3971  hypothetical protein  43.65 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.147621 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4608  hypothetical protein  43.65 
 
 
138 aa  106  9.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  43.31 
 
 
139 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0559  hypothetical protein  43.17 
 
 
139 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4444  hypothetical protein  51.55 
 
 
138 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.388057 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  43.9 
 
 
139 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4570  hypothetical protein  43.65 
 
 
138 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6028  hypothetical protein  44.44 
 
 
141 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69780  hypothetical protein  44.44 
 
 
141 aa  103  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.570881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1893  hypothetical protein  47.71 
 
 
139 aa  102  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.323991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4645  hypothetical protein  46.03 
 
 
138 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.462887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4593  hypothetical protein  46.03 
 
 
138 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4594  hypothetical protein  46.03 
 
 
138 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.916716  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4499  hypothetical protein  46.03 
 
 
138 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  48.86 
 
 
157 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2246  protein of unknown function UPF0047  43.93 
 
 
140 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2650  hypothetical protein  40.83 
 
 
139 aa  101  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3740  hypothetical protein  41.73 
 
 
141 aa  101  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.597829  hitchhiker  0.000337865 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08050  UPF0047 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G02090)  42.64 
 
 
144 aa  101  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.823848  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  45.13 
 
 
141 aa  101  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4507  hypothetical protein  46.03 
 
 
138 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0219  hypothetical protein  40.94 
 
 
141 aa  100  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5504  hypothetical protein  41.73 
 
 
141 aa  100  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387087  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47770  hypothetical protein  42.52 
 
 
141 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0261  hypothetical protein  44.64 
 
 
141 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0188  hypothetical protein  40.94 
 
 
141 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1262  protein of unknown function UPF0047  44.14 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.46172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  43.41 
 
 
139 aa  98.2  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2403  protein of unknown function UPF0047  45.05 
 
 
140 aa  97.4  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  49.46 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  49.45 
 
 
160 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2162  hypothetical protein  41.73 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2136  hypothetical protein  41.73 
 
 
134 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  41.07 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3983  hypothetical protein  43.64 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000552293  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  42.86 
 
 
157 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1889  protein of unknown function UPF0047  44 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1102  hypothetical protein  39.84 
 
 
139 aa  94.7  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.495108  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1688  hypothetical protein  47.73 
 
 
195 aa  94  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0693  protein of unknown function UPF0047  45.16 
 
 
139 aa  94  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  43.62 
 
 
139 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  41.88 
 
 
157 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  43.62 
 
 
139 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  39.53 
 
 
137 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  43.88 
 
 
160 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0674  hypothetical protein  46.15 
 
 
205 aa  92.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.798458  normal  0.310853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  47.73 
 
 
160 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  42.55 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  42.55 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0485  hypothetical protein  45.05 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000361267  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  47.73 
 
 
160 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  42.71 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  48.81 
 
 
157 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0081  protein of unknown function UPF0047  40.91 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0686334  normal  0.0165253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  48.86 
 
 
155 aa  90.5  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  48.81 
 
 
157 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0131  hypothetical protein  42.11 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1587  hypothetical protein  42.11 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.185989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0104  hypothetical protein  42.11 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0099  hypothetical protein  42.11 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1273  protein of unknown function UPF0047  38.21 
 
 
138 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0632  hypothetical protein  49.44 
 
 
139 aa  89  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0627  hypothetical protein  40.16 
 
 
166 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.299074  decreased coverage  0.00428994 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1762  hypothetical protein  40.57 
 
 
142 aa  88.6  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292066  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  40.57 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  40.57 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3367  hypothetical protein  40.57 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00750068  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6559  protein of unknown function UPF0047  42.06 
 
 
143 aa  87.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552252  normal  0.186603 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  49.43 
 
 
138 aa  87  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  41.28 
 
 
138 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  41.28 
 
 
138 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2851  protein of unknown function UPF0047  44.94 
 
 
140 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  45.83 
 
 
133 aa  86.7  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1542  protein of unknown function UPF0047  42.31 
 
 
166 aa  85.9  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  49.43 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  47.17 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2109  hypothetical protein  39.57 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2258  hypothetical protein  40.17 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.479021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>