23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA02180 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA02180  cytoplasm protein, putative  100 
 
 
485 aa  988    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01800  cytoplasm protein, putative  30.9 
 
 
480 aa  134  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389549  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04875  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11210)  33.86 
 
 
421 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.11498 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50504  predicted protein  26.7 
 
 
438 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0295961 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10806  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G12110)  25.1 
 
 
515 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02410  cytoplasm protein, putative  29.66 
 
 
636 aa  97.8  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58312  predicted protein  30.77 
 
 
254 aa  90.5  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65824  nuclear division protein  26.47 
 
 
611 aa  89.7  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.360229 
 
 
-
 
NC_002620  TC0757  hypothetical protein  26.86 
 
 
264 aa  79.3  0.0000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0121  hypothetical protein  27.4 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0107  hypothetical protein  27.4 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4205  hypothetical protein  28.22 
 
 
266 aa  73.6  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01996  YagE family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G10390)  27.55 
 
 
655 aa  70.1  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385246  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02721  hypothetical protein  27.14 
 
 
260 aa  69.7  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0757  hypothetical protein  32.92 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.186442 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2525  hypothetical protein  24.1 
 
 
262 aa  64.7  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3007  protein of unknown function DUF155  23.1 
 
 
274 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1331  hypothetical protein  26.36 
 
 
267 aa  60.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.728417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0703  hypothetical protein  22.65 
 
 
271 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.197614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5021  hypothetical protein  24.39 
 
 
266 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.268747 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1174  hypothetical protein  23.73 
 
 
274 aa  51.2  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2060  hypothetical protein  35.14 
 
 
278 aa  50.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.180421  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0224  hypothetical protein  27.19 
 
 
269 aa  47.8  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>