89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00900 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_10497  DNA replication licensing factor Mcm3, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03920)  68.27 
 
 
847 aa  887    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00900  ATP dependent DNA helicase, putative  100 
 
 
876 aa  1805    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000271511  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_71636  member of complex that acts at ARS's to initiate replication  54.5 
 
 
848 aa  861    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0921597  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_51597  predicted protein  49.06 
 
 
551 aa  529  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119520  replication origin activator MCM3, probable  47.54 
 
 
707 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0497  MCM family protein  35.98 
 
 
693 aa  369  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0382  MCM family protein  37.09 
 
 
688 aa  354  4e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.324163  normal  0.752457 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07994  DNA replication licensing factor Mcm5, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02520)  33.59 
 
 
724 aa  329  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1152  MCM family protein  36.75 
 
 
680 aa  328  3e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000211045 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75184  DNA replication licensing factor, MCM4 component  33.86 
 
 
882 aa  328  3e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.391055  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59868  DNA replication licensing factor, MCM5 component  32.23 
 
 
729 aa  327  4.0000000000000003e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.133303  normal  0.976418 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0242  MCM family protein  34.68 
 
 
695 aa  327  7e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0104  MCM family protein  36.3 
 
 
682 aa  325  3e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00522782 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0084  replicative DNA helicase Mcm  35.9 
 
 
679 aa  322  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.117672 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1834  MCM family protein  33.64 
 
 
686 aa  323  9.999999999999999e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.320765  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05360  ATP dependent DNA helicase, putative  32.73 
 
 
739 aa  321  3e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.178412  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0113  MCM family protein  36.04 
 
 
680 aa  320  6e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02491  hypothetical protein similar to DNA replication licensing factor (Eurofung)  34.3 
 
 
890 aa  320  7.999999999999999e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_18622  predicted protein  33.96 
 
 
808 aa  319  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11490  predicted protein  35.35 
 
 
667 aa  319  2e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44312  predicted protein  37.23 
 
 
796 aa  318  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00796229  normal  0.0395232 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51954  predicted protein  31.34 
 
 
755 aa  318  4e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0698904  normal  0.536125 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85790  DNA replication licensing factor, MCM2 component (Minichromosome maintenance protein 2)  33.59 
 
 
859 aa  318  4e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1673  MCM family protein  34.31 
 
 
703 aa  316  9.999999999999999e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.919385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0985  MCM  32.18 
 
 
706 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.214323  normal  0.713661 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02380  DNA replication licensing factor cdc19 (cell division control protein 19), putative  36.75 
 
 
932 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05992  DNA replication licensing factor Mcm7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10140)  35.96 
 
 
811 aa  309  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.807141  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0316  MCM family protein  31.97 
 
 
700 aa  309  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0259  MCM family protein  32.39 
 
 
689 aa  306  9.000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.29141  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48809  predicted protein  34.82 
 
 
717 aa  305  3.0000000000000004e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1593  replicative DNA helicase Mcm  34.22 
 
 
700 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0830  replicative DNA helicase Mcm  34.95 
 
 
717 aa  301  4e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70932  DNA replication licensing factor, MCM6 component  32.57 
 
 
949 aa  301  5e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37286  predicted protein  33.28 
 
 
709 aa  299  2e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0178881  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2043  replicative DNA helicase Mcm  32.01 
 
 
686 aa  298  3e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2510  MCM family protein  30.08 
 
 
700 aa  298  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.504758  normal  0.266375 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83251  DNA helicase and DNA replication licensing factor (CDC47)  35.29 
 
 
795 aa  296  1e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01550  ATP dependent DNA helicase, putative  36.27 
 
 
788 aa  292  2e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1175  MCM family protein  33.86 
 
 
694 aa  290  1e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04510  DNA unwinding-related protein, putative  30.42 
 
 
963 aa  290  1e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285676  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13243  predicted protein  36.77 
 
 
618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51412  predicted protein  31.13 
 
 
791 aa  281  4e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39655  predicted protein  33.97 
 
 
841 aa  280  1e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0721482  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2432  replicative DNA helicase Mcm  31.38 
 
 
696 aa  279  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39165  predicted protein  34.06 
 
 
761 aa  267  7e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.883562  hitchhiker  0.00772157 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00228  DNA replication licensing factor Mcm6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10890)  30.72 
 
 
915 aa  263  8e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.564524 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06070  hypothetical protein similar to cdc21 (Broad)  33.53 
 
 
556 aa  251  3e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.161244  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_468  predicted protein  41.01 
 
 
660 aa  248  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01820  DNA unwinding-related protein, putative  39.84 
 
 
989 aa  240  8e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.414806  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_52561  predicted protein  32.15 
 
 
675 aa  229  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  30.8 
 
 
1064 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  36.01 
 
 
1059 aa  191  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  35.89 
 
 
873 aa  191  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_1571  predicted protein  32.4 
 
 
487 aa  187  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412513  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1027  MCM family protein  29.61 
 
 
676 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0193963 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0740  MCM family protein  26.15 
 
 
717 aa  182  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0731805  normal  0.436887 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1144  MCM family protein  26.24 
 
 
676 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0919  MCM family protein  31.47 
 
 
672 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.564679  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1650  replicative DNA helicase Mcm  31.35 
 
 
676 aa  181  7e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0503921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1027  MCM family protein  31.98 
 
 
672 aa  180  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.160717  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0348  MCM family protein  27.82 
 
 
710 aa  177  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121923  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0490  MCM family protein  28.1 
 
 
717 aa  177  7e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.555954  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0108  MCM family protein  31.38 
 
 
670 aa  177  9e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.630129  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1119  replicative DNA helicase Mcm  28.33 
 
 
674 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0133  MCM family protein  28.06 
 
 
674 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.404754  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0438  MCM family protein  29.47 
 
 
674 aa  174  7.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_981  predicted protein  32.75 
 
 
467 aa  171  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0232666  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2196  transcriptional regulator, XRE family  29.4 
 
 
1342 aa  169  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.868406  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0027  MCM family protein  25.61 
 
 
676 aa  168  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.120243  hitchhiker  0.000537459 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0266  MCM family protein  29.8 
 
 
710 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00136614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1635  MCM family protein  29.8 
 
 
710 aa  167  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.832891  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0570  replicative DNA helicase Mcm  31.2 
 
 
710 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.480124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0420  MCM family protein  32.07 
 
 
674 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315649  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0030  MCM family protein  25.08 
 
 
668 aa  166  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1226  MCM family protein  30.13 
 
 
724 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0635  MCM family protein  30.93 
 
 
458 aa  144  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.903095 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0643  MCM family protein  25.53 
 
 
626 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  34.4 
 
 
1412 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0237  MCM family protein  26.12 
 
 
710 aa  127  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0065  MCM family protein  31.44 
 
 
677 aa  127  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191549  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1837  MCM family protein  31.44 
 
 
677 aa  127  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0267  MCM family protein  27.23 
 
 
607 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00436081  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0196  Mg chelatase, subunit ChlI  36.76 
 
 
503 aa  48.9  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1080  Mg chelatase, subunit ChlI  35.21 
 
 
507 aa  48.1  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  28.57 
 
 
517 aa  47.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_222  Holliday junction DNA helicase  28.39 
 
 
312 aa  46.2  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  26.85 
 
 
508 aa  46.2  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  35.82 
 
 
510 aa  44.3  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0685  Mg chelatase, subunit ChlI  23.08 
 
 
504 aa  44.3  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>