More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00740 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA00740  glutamine-tRNA ligase, putative  100 
 
 
858 aa  1774    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.344742  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72287  glutaminyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 
799 aa  692    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.579144  normal  0.826623 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09157  Glutaminyl-tRNA synthetase (Eurofung)  46.22 
 
 
628 aa  568  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
580 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23867  predicted protein  41.61 
 
 
541 aa  432  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
563 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 
568 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 
569 aa  425  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 
561 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
565 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  45.2 
 
 
552 aa  420  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
556 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 
587 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
570 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
572 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
556 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2516  glutaminyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
556 aa  416  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0318208  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2615  glutaminyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
556 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.620395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
552 aa  412  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
568 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
559 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3121  glutaminyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 
556 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 
576 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1533  glutaminyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.208966  normal  0.486812 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
555 aa  406  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3240  glutaminyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
556 aa  409  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00746606  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 
565 aa  406  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
557 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
560 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
563 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1216  glutaminyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 
555 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
589 aa  409  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 
565 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1482  glutaminyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
556 aa  405  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
552 aa  405  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2828  glutaminyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
569 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.531779  normal  0.0114243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
561 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
556 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1307  glutaminyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
569 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
561 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
552 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
548 aa  406  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
556 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0137132  hitchhiker  0.0018216 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2571  glutaminyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
556 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.838936  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
564 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
555 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 
559 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
555 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
556 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
564 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
555 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0907  glutaminyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
573 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47238  normal  0.116742 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
555 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
555 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
552 aa  400  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  44.91 
 
 
555 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2669  glutaminyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
556 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0864702  normal  0.0642035 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
554 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
554 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
554 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
554 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1786  glutaminyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
556 aa  399  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
554 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
554 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
554 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 
554 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1263  glutaminyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
781 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.578242  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  43.99 
 
 
554 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  40.11 
 
 
583 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2413  glutaminyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
556 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000218793  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
558 aa  399  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
558 aa  397  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
565 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0492  glutaminyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 
553 aa  398  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0995744  normal  0.607402 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1316  glutaminyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
569 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
556 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00970277  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
565 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
554 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
558 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0094  glutaminyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
556 aa  395  1e-108  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 
567 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1619  glutaminyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
556 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308456  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 
567 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
555 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2758  glutaminyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
556 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112039  normal  0.0252505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
566 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
562 aa  391  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1585  glutaminyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
571 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000343871  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 
565 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
555 aa  391  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 
567 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
556 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00615688  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1282  glutaminyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
569 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
555 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
580 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 
564 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2665  glutaminyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
569 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0180309  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  40 
 
 
567 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1383  glutaminyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
569 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21862 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1405  glutaminyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
569 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>