More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00630 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA00630  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  100 
 
 
870 aa  1771    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08071  conserved hypothetical protein similar to striatin (Eurofung)  27.41 
 
 
762 aa  128  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.65 
 
 
1193 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  27.51 
 
 
1411 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.53 
 
 
1236 aa  111  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.18 
 
 
1831 aa  109  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.49 
 
 
1868 aa  108  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.53 
 
 
1363 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  28 
 
 
1196 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.37 
 
 
740 aa  103  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  28.17 
 
 
696 aa  103  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.14 
 
 
1163 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.84 
 
 
1557 aa  102  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  27.95 
 
 
1523 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.78 
 
 
1348 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.66 
 
 
1221 aa  97.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.68 
 
 
930 aa  96.3  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.5 
 
 
1652 aa  95.9  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.98 
 
 
1789 aa  95.9  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.62 
 
 
1901 aa  94.4  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.77 
 
 
742 aa  94.4  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  23.72 
 
 
1208 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  24.76 
 
 
1474 aa  92.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.97 
 
 
1807 aa  91.7  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  22.92 
 
 
1264 aa  91.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  22.92 
 
 
1264 aa  91.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87280  predicted protein  24.65 
 
 
1204 aa  90.1  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0864133  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.54 
 
 
919 aa  90.5  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  26.53 
 
 
1454 aa  89.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.05 
 
 
924 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.08 
 
 
630 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.37 
 
 
596 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.8 
 
 
1686 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.91 
 
 
1626 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.79 
 
 
1553 aa  89  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.47 
 
 
1211 aa  89.4  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.63 
 
 
1599 aa  88.6  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  24.06 
 
 
589 aa  88.6  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.97 
 
 
1240 aa  88.6  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  25.38 
 
 
1190 aa  88.6  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.88 
 
 
1552 aa  88.2  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.07 
 
 
1217 aa  87.8  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.01 
 
 
1711 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.4 
 
 
947 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  27.18 
 
 
813 aa  86.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.93 
 
 
576 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.7 
 
 
1481 aa  85.5  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.78 
 
 
1510 aa  85.5  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  25.51 
 
 
782 aa  84.7  0.000000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.14 
 
 
1364 aa  84.3  0.000000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03026  Coatomer alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59946]  25.36 
 
 
1205 aa  84  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  23.66 
 
 
728 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24 
 
 
682 aa  84  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  25.77 
 
 
1367 aa  84.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.73 
 
 
1760 aa  84  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.38 
 
 
676 aa  84.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.37 
 
 
1609 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  31.09 
 
 
790 aa  82.8  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.63 
 
 
1607 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.55 
 
 
1188 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.12 
 
 
1161 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  26.35 
 
 
1344 aa  83.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.73 
 
 
1161 aa  83.2  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  27.61 
 
 
344 aa  82  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.45 
 
 
1247 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  27.48 
 
 
1661 aa  81.6  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.26 
 
 
675 aa  81.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.37 
 
 
1623 aa  80.1  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  25.8 
 
 
1357 aa  80.1  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  25.61 
 
 
1878 aa  80.1  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.69 
 
 
1598 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.69 
 
 
1858 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25 
 
 
1262 aa  80.1  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  24.01 
 
 
505 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.61 
 
 
1766 aa  80.1  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.84 
 
 
1267 aa  79.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  27.07 
 
 
1656 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.2 
 
 
1547 aa  78.6  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.98 
 
 
677 aa  78.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  24.93 
 
 
1229 aa  78.2  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06359  Sulfur metabolite repression control protein [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00659]  24.76 
 
 
678 aa  77.8  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.189769  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.66 
 
 
1443 aa  77.8  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00480  coatomer alpha subunit, putative  22.29 
 
 
1222 aa  77  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  29.1 
 
 
1330 aa  77.4  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.61 
 
 
1684 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.09 
 
 
1856 aa  76.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  24.86 
 
 
1176 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.06 
 
 
657 aa  76.6  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 
642 aa  76.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.01 
 
 
344 aa  75.5  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.62 
 
 
1617 aa  75.1  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01220  cytoplasm protein, putative  27.07 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  23.1 
 
 
578 aa  74.7  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  23.91 
 
 
1484 aa  74.3  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  26.26 
 
 
652 aa  74.3  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.53 
 
 
1164 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  29.03 
 
 
363 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  29.03 
 
 
363 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  23.68 
 
 
617 aa  72.8  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.04 
 
 
716 aa  73.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0650147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>