52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00590 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA00590  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  100 
 
 		 333 aa  663    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08663  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01910)  71.43 
 
 		 730 aa  109  8.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.872321 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04263  NSDC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q56UE1]  41.76 
 
 		 667 aa  72.8  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00306213  normal  0.1267 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67657  protein involved in methionine metabolism  51.79 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.316751  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04873  C2H2 transcription factor (Swi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11250)  51.72 
 
 		 741 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.342827 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67047  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  41.54 
 
 		 781 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.928485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61434  calcineurin responsive zinc-finger  47.54 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.383997 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01450  conserved hypothetical protein  40.91 
 
 		 1089 aa  63.2  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33273  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  41.43 
 
 		 857 aa  60.8  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0974911  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05726  Putative transcription factor CrzAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B154]  38.03 
 
 		 730 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.242002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67866  asparagine-rich zinc finger protein  38.96 
 
 		 465 aa  59.3  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.12306 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80960  Zinc Finger Protein C2H2-like protein  46.94 
 
 		 1195 aa  56.6  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758804  normal  0.0450473 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07118  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  51.06 
 
 		 991 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00096  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  46.55 
 
 		 993 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67859  transcription factor involved in glucose repression  41.67 
 
 		 579 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02270  Putative uncharacterized proteinRegulatory protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00170]  44.23 
 
 		 880 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85279  Metallothionein expression activator  45 
 
 		 626 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.608968  normal  0.706562 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_09492  DNA binding regulatory protein AmdX [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P79045]  48.98 
 
 		 1150 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100907  normal  0.703915 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01652  C2H2 transcription factor (Seb1), putative, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09080)  45.76 
 
 		 580 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.301419 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05966  RfeC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J177]  32.1 
 
 		 519 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.247112  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00890  early growth response protein 1 (egr-1), putative  50 
 
 		 662 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00600  specific RNA polymerase II transcription factor, putative  36.84 
 
 		 716 aa  53.5  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04720  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  46 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000217487  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02160  conserved hypothetical protein  33.77 
 
 		 746 aa  53.1  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51364  protein similar to protein that controls the expression of ADH2, peroxisomal protein genes, and genes required for ethanol, glycerol, and fatty acid utilization  40.68 
 
 		 1211 aa  52.8  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68117  Up in starvation  48.08 
 
 		 583 aa  51.6  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04013  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04110)  45.65 
 
 		 864 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88332  DNA-binding transcription factor  38.46 
 
 		 421 aa  50.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03070  hypothetical protein  47.62 
 
 		 1161 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03060  C2H2 zinc finger protein Zas1A, putative  41.18 
 
 		 1078 aa  50.4  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06503  C2H2 transcription factor (Azf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05160)  38.6 
 
 		 457 aa  50.4  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00870  RNA polymerase II transcription factor, putative  46 
 
 		 650 aa  50.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06195  DNA-binding protein creA (Carbon catabolite repressor) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q01981]  42.59 
 
 		 416 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000354127  normal  0.238191 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06060  expressed protein  45.83 
 
 		 477 aa  49.7  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.61408  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02421  Putative uncharacterized proteinPutative zinc finger protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74256]  40 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0534008 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68294  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  39.62 
 
 		 1009 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11112  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  38.33 
 
 		 446 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN00550  DNA-binding protein cre-1, putative  42.59 
 
 		 737 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.141726  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64902  possible regulatory protein  45.83 
 
 		 675 aa  47.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.459104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67778  ADR1-like Zn finger domain protein  38.78 
 
 		 1049 aa  47.4  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.119069 
 
 
-
 
NC_006686  CND05810  conserved hypothetical protein  44.19 
 
 		 851 aa  47  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.109949  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05583  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11480)  36.67 
 
 		 306 aa  45.8  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48819  DNA-binding protein (Carbon catabolite repressor)  42.59 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05003  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09820)  44 
 
 		 596 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50873  ADR1-like protein  40.3 
 
 		 146 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01265  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10080)  38.78 
 
 		 627 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.180578 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04070  transcriptional regulator nrg2, putative  37.04 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08741  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02690)  37.1 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000382174  normal  0.0385189 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02290  Transcription factor steA [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O74252]  45.24 
 
 		 692 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243472  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29464  C2H2 zinc finger protein  32 
 
 		 712 aa  43.5  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  38.46 
 
 		 1121 aa  42.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80808  putative zinc finger protein  36.36 
 
 		 802 aa  42.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.10969 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>