More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00510 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_08275  Citrate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O00098]  69.59 
 
 
474 aa  657    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00510  citrate synthase, putative  100 
 
 
464 aa  958    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.793982  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85554  citrate synthase (CISY)  66.29 
 
 
466 aa  622  1e-177  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0177794  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24535  predicted protein  60 
 
 
399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734015  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6916  type I citrate synthase  56.7 
 
 
439 aa  487  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569416  normal  0.957775 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30145  hypothetical protein  52.78 
 
 
471 aa  474  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.542768  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06650  2-methylcitrate synthase, mitochondrial Precursor (Methylcitrate synthase)(EC 2.3.3.5)(Citrate synthase 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9TEM3]  52.55 
 
 
460 aa  464  1e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.353389  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1106  type I citrate synthase  49.55 
 
 
441 aa  425  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.880837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2689  type I citrate synthase  49.32 
 
 
441 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000255576  normal  0.147008 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1124  type I citrate synthase  48.15 
 
 
438 aa  423  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3728  type I citrate synthase  48.38 
 
 
443 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3670  type I citrate synthase  48.15 
 
 
443 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3811  type I citrate synthase  48.38 
 
 
443 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00120684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1379  type I citrate synthase  47.39 
 
 
440 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.170835  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1991  type I citrate synthase  47.32 
 
 
434 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3798  type I citrate synthase  47.93 
 
 
442 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.324518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2561  type I citrate synthase  47.56 
 
 
441 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.21232e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1576  type I citrate synthase  47.73 
 
 
441 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00106896  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1652  type I citrate synthase  47.33 
 
 
441 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00794994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3990  type I citrate synthase  48.14 
 
 
454 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1134  type I citrate synthase  46.53 
 
 
441 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000378105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3905  type I citrate synthase  47.44 
 
 
454 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.79 
 
 
385 aa  136  7.000000000000001e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4737  Citrate synthase  26.35 
 
 
446 aa  133  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576126  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  29.14 
 
 
427 aa  130  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  28.82 
 
 
372 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4410  citrate synthase I  28.25 
 
 
429 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  28.83 
 
 
437 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  29.37 
 
 
427 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  27.5 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2617  citrate synthase I  27.9 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.819839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  27.99 
 
 
434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  26.89 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  27.01 
 
 
434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  27.4 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  27.61 
 
 
434 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2287  citrate (Si)-synthase  30.79 
 
 
425 aa  114  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  27.61 
 
 
434 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  27.61 
 
 
434 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  27.16 
 
 
425 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0083  citrate synthase  28.26 
 
 
455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  28.97 
 
 
432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  28.78 
 
 
427 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  27.47 
 
 
428 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  27.68 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1911  citrate synthase  27.7 
 
 
430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  30.09 
 
 
372 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  26.58 
 
 
428 aa  110  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.78 
 
 
390 aa  109  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  26.53 
 
 
427 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  27.69 
 
 
378 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7227  citrate synthase I  28.12 
 
 
455 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  27.02 
 
 
437 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12790  citrate synthase  26.12 
 
 
451 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0027871  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  28.49 
 
 
374 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.42 
 
 
382 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  26.88 
 
 
427 aa  108  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  26.56 
 
 
383 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0085  citrate synthase  24.44 
 
 
448 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.691353  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  28.2 
 
 
433 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  28.2 
 
 
433 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  28.2 
 
 
433 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  28.2 
 
 
433 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  28.03 
 
 
433 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  28.03 
 
 
433 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  28.03 
 
 
433 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  28.03 
 
 
433 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  28.03 
 
 
433 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  26.18 
 
 
428 aa  107  5e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  28.03 
 
 
433 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  28.03 
 
 
433 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  26.61 
 
 
438 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0186  citrate synthase I  25.86 
 
 
438 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  28.03 
 
 
433 aa  106  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  26.81 
 
 
431 aa  106  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  27.9 
 
 
429 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  27.75 
 
 
433 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  26.18 
 
 
386 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  26.18 
 
 
386 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  30.79 
 
 
412 aa  106  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30 
 
 
397 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  28.57 
 
 
426 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0317  citrate synthase I  27.82 
 
 
447 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.36 
 
 
377 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  26.49 
 
 
389 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  28.69 
 
 
433 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1058  type II citrate synthase  27.22 
 
 
437 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.704464  normal  0.0578787 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.81 
 
 
387 aa  105  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  26.85 
 
 
440 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  27.1 
 
 
428 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  26.88 
 
 
432 aa  105  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0576  citrate (Si)-synthase  29.33 
 
 
425 aa  104  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.254667  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01350  type II citrate synthase  27.7 
 
 
429 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  28.32 
 
 
433 aa  104  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2805  citrate synthase I  27.43 
 
 
427 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359876  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0895  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.72 
 
 
430 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  27.75 
 
 
433 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.29 
 
 
404 aa  104  4e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  27.75 
 
 
433 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0260  citrate synthase I  27.68 
 
 
426 aa  104  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.419168  normal  0.11552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>