161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pTet0040 on replicon NC_008790
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008790  CJJ81176_pTet0040  cmgD4  100 
 
 
603 aa  1240    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a021  conjugal transfer protein TraG/VirD4  68.73 
 
 
598 aa  864    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0170  cmgd4  51.89 
 
 
658 aa  587  1e-166  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.035471  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2451  TRAG family protein  44.01 
 
 
559 aa  365  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.885622  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0458  putative type IV secretory pathway protein VirD4  42.55 
 
 
593 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.626492  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0172  TRAG family protein  42.98 
 
 
594 aa  346  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.218422 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6495  TRAG family protein  40.86 
 
 
583 aa  342  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1764  putative type IV secretory pathway protein VirD4  41.27 
 
 
575 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347607  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2647  putative Type IV secretory pathway protein VirD4  41.05 
 
 
576 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.452126  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3323  TRAG family protein  42.2 
 
 
570 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4843  TRAG protein  42.29 
 
 
557 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4192  TRAG family protein  42.2 
 
 
570 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0862  TRAG family protein  36.32 
 
 
677 aa  300  6e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  37.87 
 
 
758 aa  300  8e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7522  TRAG family protein  39.61 
 
 
601 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.445518  normal  0.175078 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5823  TRAG family protein  35.52 
 
 
651 aa  288  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0047  TraG/TraD family protein  32.91 
 
 
620 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0092  TaxB  34.01 
 
 
611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.393332 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0023  conjugal transfer protein  32.5 
 
 
673 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0247  putative type IV secretory pathway protein VirD4  35.79 
 
 
648 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5000  TRAG family protein  34.97 
 
 
670 aa  260  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08203  conjugal transfer protein TraK  33.04 
 
 
592 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6334  TRAG family protein  45.72 
 
 
897 aa  241  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0739  type IV secretion system component VirD4  33.2 
 
 
641 aa  238  2e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4368  TRAG family protein  31.24 
 
 
713 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.538935 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0018  type IV secretion system component VirD4  32.18 
 
 
723 aa  226  7e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.512537  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0017  conjugal transfer protein TraK  31.14 
 
 
655 aa  226  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0040  type IV secretion system component VirD4  31.72 
 
 
714 aa  225  2e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0008  type IV secretion system component VirD4  30.33 
 
 
648 aa  223  8e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0180  hypothetical protein  30.84 
 
 
633 aa  187  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0162  hypothetical protein  30.51 
 
 
633 aa  187  5e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3006  conjugal transfer coupling protein TraG  26.63 
 
 
663 aa  182  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1506  conjugal transfer coupling protein TraG  26.73 
 
 
661 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1185  TRAG family protein  27.22 
 
 
630 aa  178  3e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0142  conjugal transfer coupling protein TraG  27.31 
 
 
674 aa  177  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1733  conjugal transfer coupling protein TraG  26.53 
 
 
660 aa  177  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0515  conjugal transfer coupling protein TraG  26.63 
 
 
662 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3708  conjugal transfer coupling protein TraG  26.6 
 
 
669 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2348  conjugal transfer coupling protein TraG  26.35 
 
 
669 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35740  conjugal transfer coupling protein TraG  26.46 
 
 
666 aa  174  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2002  conjugal transfer coupling protein TraG  26.15 
 
 
665 aa  174  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0417239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4007  conjugal transfer coupling protein TraG  26.78 
 
 
659 aa  173  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2913  conjugal transfer coupling protein TraG  26.44 
 
 
665 aa  173  9e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4169  TRAG protein  27.33 
 
 
678 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3188  conjugal transfer coupling protein TraG  27.47 
 
 
669 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3193  conjugal transfer coupling protein TraG  26.48 
 
 
661 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0684551  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2025  conjugal transfer coupling protein TraG  27.63 
 
 
678 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30960  conjugal transfer coupling protein TraG  26.32 
 
 
666 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.70004e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1493  conjugal transfer coupling protein TraG  27.32 
 
 
700 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00200644  normal  0.246461 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1196  conjugal transfer coupling protein TraG  27.34 
 
 
663 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0400673  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3539  conjugal transfer coupling protein TraG  27.34 
 
 
663 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1548  conjugal transfer coupling protein TraG  26.45 
 
 
664 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11101  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2701  conjugal transfer coupling protein TraG  26.81 
 
 
669 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143285  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2530  TRAG family protein  25.72 
 
 
661 aa  171  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.684984  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7438  conjugal transfer coupling protein TraG  26.51 
 
 
660 aa  171  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291662  normal  0.932105 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4193  conjugal transfer coupling protein TraG  26.34 
 
 
663 aa  171  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3903  conjugal transfer coupling protein TraG  25.71 
 
 
665 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342715  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0724  conjugal transfer coupling protein TraG  26.39 
 
 
668 aa  170  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0440  conjugal transfer coupling protein TraG  26.25 
 
 
673 aa  170  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3508  conjugal transfer coupling protein TraG  27.02 
 
 
667 aa  170  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2586  conjugal transfer coupling protein TraG  25.77 
 
 
675 aa  170  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3356  conjugal transfer coupling protein TraG  26.25 
 
 
666 aa  170  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.456046  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0320  conjugal transfer coupling protein TraG  26.91 
 
 
661 aa  170  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0236522  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3084  conjugal transfer coupling protein TraG  27.36 
 
 
661 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.847978  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2643  conjugal transfer coupling protein TraG  27.22 
 
 
672 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2618  conjugal transfer coupling protein TraG  26.59 
 
 
687 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2327  conjugal transfer coupling protein TraG  25.43 
 
 
662 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.58309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3849  conjugal transfer coupling protein TraG  25.98 
 
 
664 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00986433  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4554  TRAG family protein  25.34 
 
 
695 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0701  conjugal transfer coupling protein TraG  26.3 
 
 
661 aa  169  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3548  conjugal transfer coupling protein TraG  25.86 
 
 
664 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1893  conjugal transfer coupling protein TraG  25.93 
 
 
670 aa  169  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1023  conjugal transfer coupling protein TraG  26.17 
 
 
660 aa  168  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2876  conjugal transfer coupling protein TraG  26.73 
 
 
662 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2344  conjugal transfer coupling protein TraG  26.62 
 
 
723 aa  167  5e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.743545  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0894  TRAG family protein  26.94 
 
 
627 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1280  conjugal transfer coupling protein TraG  26.44 
 
 
665 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7739  conjugal transfer coupling protein TraG  27.15 
 
 
661 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.477093 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6396  TRAG family protein  26.1 
 
 
699 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.969912  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9810  conjugative coupling protein  26.2 
 
 
699 aa  166  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0751  conjugal transfer coupling protein TraG  25.88 
 
 
661 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0589  conjugal transfer coupling protein TraG  27.76 
 
 
659 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1833  conjugal transfer coupling protein TraG  27.63 
 
 
687 aa  163  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4436  TRAG protein  26.76 
 
 
714 aa  163  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2256  conjugal transfer coupling protein TraG  26.19 
 
 
573 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1339  conjugal transfer coupling protein TraG  25.75 
 
 
664 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.953058  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1649  TRAG family protein  26.79 
 
 
823 aa  160  6e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3825  conjugal transfer coupling protein TraG  26 
 
 
666 aa  160  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2818  conjugal transfer coupling protein TraG  25.78 
 
 
660 aa  160  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.443273  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8210  type IV secretion system protein VirD4  27.45 
 
 
663 aa  160  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.493038  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6143  type IV secretion system protein VirD4  27.08 
 
 
548 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3689  conjugal transfer coupling protein TraG  25.91 
 
 
676 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0968  conjugal transfer coupling protein TraG  25.7 
 
 
666 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0680  agrobacteirum virulence protein VirD4  29.13 
 
 
554 aa  153  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1316  TRAG family protein  26.5 
 
 
670 aa  150  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0686  conjugal transfer coupling protein TraG  24.69 
 
 
756 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3988  TRAG family protein  25.31 
 
 
670 aa  146  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.420427  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3794  TRAG protein  25.5 
 
 
668 aa  145  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3655  TRAG family protein  25.5 
 
 
667 aa  144  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291322  decreased coverage  0.00000244512 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4975  TRAG family protein  25.96 
 
 
560 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.24546  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>