142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_pTet0038 on replicon NC_008790
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  100 
 
 
391 aa  801    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  58.75 
 
 
391 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  61.28 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  43.65 
 
 
369 aa  179  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  43 
 
 
391 aa  173  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  41.94 
 
 
400 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  42.51 
 
 
380 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  40.53 
 
 
380 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  40.78 
 
 
492 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  42.42 
 
 
397 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0115  TriI protein  41.84 
 
 
398 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  39.6 
 
 
484 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  41.24 
 
 
381 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  39.06 
 
 
391 aa  156  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  40.62 
 
 
378 aa  156  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  39.06 
 
 
390 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  38.1 
 
 
386 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  38.78 
 
 
405 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  35.93 
 
 
445 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0095  pilx10 protein  40.1 
 
 
401 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264804  normal  0.564962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  37.63 
 
 
396 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  35.48 
 
 
372 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  35.9 
 
 
408 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  37.84 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  38.95 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  38.62 
 
 
450 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  38.62 
 
 
381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  35.07 
 
 
400 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  35.05 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  35.07 
 
 
402 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  34.95 
 
 
414 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  36.45 
 
 
432 aa  126  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  31.4 
 
 
363 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  30.16 
 
 
403 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  33.18 
 
 
410 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  30.67 
 
 
363 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  35.08 
 
 
453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  35.2 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  32.31 
 
 
410 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  33.83 
 
 
407 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  34.12 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  34.12 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  31.02 
 
 
445 aa  112  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  31.79 
 
 
406 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  31.28 
 
 
402 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  32.96 
 
 
459 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  33.52 
 
 
459 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  29.25 
 
 
444 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  32.4 
 
 
459 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  31.6 
 
 
439 aa  90.1  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  31.41 
 
 
437 aa  90.1  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  30.89 
 
 
437 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  30.32 
 
 
426 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  30.53 
 
 
430 aa  82.8  0.000000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  29.9 
 
 
433 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  31.91 
 
 
423 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  30.3 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  29.02 
 
 
402 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  27.1 
 
 
457 aa  80.5  0.00000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  30.85 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  30.85 
 
 
439 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  31.91 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000167509  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0003  VirB10  29.41 
 
 
378 aa  80.1  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  29.02 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  34.38 
 
 
486 aa  79.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  31.38 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  31.55 
 
 
422 aa  79.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  30.85 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  30.35 
 
 
425 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  30.85 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  30.85 
 
 
423 aa  77  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  30.85 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000274304  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  30.35 
 
 
427 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  26.89 
 
 
466 aa  76.3  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0042  type IV secretion system protein VirB10  29.15 
 
 
447 aa  75.9  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  30.85 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  29.85 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  30.85 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  30.35 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0259  conjugation TrbI family protein  33.33 
 
 
469 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.089272  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  27.55 
 
 
483 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0006  type IV secretion system protein VirB10  29.49 
 
 
486 aa  72.8  0.000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.44093  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  27.04 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  31.55 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  29.05 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3373  putative conjugal transfer protein trbI  24.54 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1148  conjugation TrbI family protein  28.72 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  27.32 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  28.72 
 
 
473 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  28.33 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  28.72 
 
 
473 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  28.72 
 
 
472 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  27.87 
 
 
414 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  24.48 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0690  conjugation TrbI family protein  26.78 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2477  conjugation TrbI-like protein  26.02 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.260778  normal  0.292469 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3203  conjugation TrbI family protein  24.47 
 
 
388 aa  67  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.71331  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  26.9 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  26.7 
 
 
397 aa  66.6  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0020  conjugation TrbI-like protein  25.76 
 
 
445 aa  66.2  0.0000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>